RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
ATG4B-218ENST00000479554 JPH4Q96JJ6 628 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-218ENST00000479554 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.75■■□□□ 1.55
ATG4B-218ENST00000479554 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.72■■□□□ 1.55
ATG4B-218ENST00000479554 IQGAP2Q13576 1575 aa24.57■■□□□ 1.52
ATG4B-218ENST00000479554 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.56■■□□□ 1.52
ATG4B-218ENST00000479554 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.54■■□□□ 1.52
ATG4B-218ENST00000479554 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.52■■□□□ 1.52
ATG4B-218ENST00000479554 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
ATG4B-218ENST00000479554 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.51■■□□□ 1.51
ATG4B-218ENST00000479554 MAPKBP1O60336 1514 aa24.5■■□□□ 1.51
ATG4B-218ENST00000479554 PTPRGP23470 1445 aa24.48■■□□□ 1.51
ATG4B-218ENST00000479554 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.46■■□□□ 1.51
ATG4B-218ENST00000479554 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.44■■□□□ 1.5
ATG4B-218ENST00000479554 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
ATG4B-218ENST00000479554 DISP1Q96F81 1524 aa24.41■■□□□ 1.5
ATG4B-218ENST00000479554 DIP2BQ9P265 1576 aa24.41■■□□□ 1.5
ATG4B-218ENST00000479554 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.4■■□□□ 1.5
ATG4B-218ENST00000479554 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.38■■□□□ 1.49
ATG4B-218ENST00000479554 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.37■■□□□ 1.49
ATG4B-218ENST00000479554 ABCC2Q92887 1545 aa24.35■■□□□ 1.49
ATG4B-218ENST00000479554 KIAA0556O60303 1618 aa24.35■■□□□ 1.49
ATG4B-218ENST00000479554 PRXQ9BXM0 1461 aa24.32■■□□□ 1.48
ATG4B-218ENST00000479554 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.32■■□□□ 1.48
ATG4B-218ENST00000479554 UACAQ9BZF9 1416 aa24.31■■□□□ 1.48
ATG4B-218ENST00000479554 ASXL2Q76L83 1435 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4B-218ENST00000479554 GOLGA3Q08378 1498 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4B-218ENST00000479554 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.23■■□□□ 1.47
ATG4B-218ENST00000479554 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.2■■□□□ 1.47
ATG4B-218ENST00000479554 TSPOAP1O95153 1857 aa24.2■■□□□ 1.46
ATG4B-218ENST00000479554 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ATG4B-218ENST00000479554 KDM6BO15054 1643 aa24.16■■□□□ 1.46
ATG4B-218ENST00000479554 GLI2P10070 1586 aa24.16■■□□□ 1.46
ATG4B-218ENST00000479554 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.15■■□□□ 1.46
ATG4B-218ENST00000479554 EEA1Q15075 1411 aa24.14■■□□□ 1.45
ATG4B-218ENST00000479554 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
ATG4B-218ENST00000479554 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ATG4B-218ENST00000479554 ABCA8O94911 1581 aa24.09■■□□□ 1.45
ATG4B-218ENST00000479554 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ATG4B-218ENST00000479554 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.05■■□□□ 1.44
ATG4B-218ENST00000479554 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4B-218ENST00000479554 SAMD9Q5K651 1589 aa24.02■■□□□ 1.44
ATG4B-218ENST00000479554 P3H3Q8IVL6 736 aa23.99■■□□□ 1.43
ATG4B-218ENST00000479554 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
ATG4B-218ENST00000479554 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.97■■□□□ 1.43
ATG4B-218ENST00000479554 KIF21BO75037 1637 aa23.94■■□□□ 1.42
ATG4B-218ENST00000479554 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.9■■□□□ 1.42
ATG4B-218ENST00000479554 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.89■■□□□ 1.42
ATG4B-218ENST00000479554 KCNH8Q96L42 1107 aa23.88■■□□□ 1.41
ATG4B-218ENST00000479554 ARID3CA6NKF2 412 aa23.87■■□□□ 1.41
ATG4B-218ENST00000479554 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
ATG4B-218ENST00000479554 ATP10BO94823 1461 aa23.87■■□□□ 1.41
ATG4B-218ENST00000479554 CD109Q6YHK3 1445 aa23.86■■□□□ 1.41
ATG4B-218ENST00000479554 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
ATG4B-218ENST00000479554 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.85■■□□□ 1.41
ATG4B-218ENST00000479554 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.84■■□□□ 1.41
ATG4B-218ENST00000479554 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.84■■□□□ 1.41
ATG4B-218ENST00000479554 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.83■■□□□ 1.41
ATG4B-218ENST00000479554 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
ATG4B-218ENST00000479554 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.76■■□□□ 1.39
ATG4B-218ENST00000479554 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.75■■□□□ 1.39
ATG4B-218ENST00000479554 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
ATG4B-218ENST00000479554 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
ATG4B-218ENST00000479554 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.72■■□□□ 1.39
ATG4B-218ENST00000479554 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
ATG4B-218ENST00000479554 ADGRL1O94910 1474 aa23.68■■□□□ 1.38
ATG4B-218ENST00000479554 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.64■■□□□ 1.38
ATG4B-218ENST00000479554 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.62■■□□□ 1.37
ATG4B-218ENST00000479554 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.61■■□□□ 1.37
ATG4B-218ENST00000479554 NEO1Q92859 1461 aa23.6■■□□□ 1.37
ATG4B-218ENST00000479554 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.6■■□□□ 1.37
ATG4B-218ENST00000479554 FMN1Q68DA7 1419 aa23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-218ENST00000479554 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
ATG4B-218ENST00000479554 HECW1Q76N89 1606 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-218ENST00000479554 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-218ENST00000479554 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-218ENST00000479554 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.51■■□□□ 1.35
ATG4B-218ENST00000479554 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ATG4B-218ENST00000479554 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4B-218ENST00000479554 RAPGEF3O95398 923 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4B-218ENST00000479554 FANCAO15360 1455 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4B-218ENST00000479554 AKNAQ7Z591 1439 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-218ENST00000479554 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ATG4B-218ENST00000479554 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-218ENST00000479554 RICTORQ6R327 1708 aa23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-218ENST00000479554 KIF14Q15058 1648 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4B-218ENST00000479554 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ATG4B-218ENST00000479554 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4B-218ENST00000479554 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4B-218ENST00000479554 PLCH2O75038 1416 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4B-218ENST00000479554 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-218ENST00000479554 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
ATG4B-218ENST00000479554 CLIP1P30622 1438 aa23.35■■□□□ 1.33
ATG4B-218ENST00000479554 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.34■■□□□ 1.33
ATG4B-218ENST00000479554 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.33■■□□□ 1.33
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.33■■□□□ 1.33
ATG4B-218ENST00000479554 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.31■■□□□ 1.32
ATG4B-218ENST00000479554 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4B-218ENST00000479554 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4B-218ENST00000479554 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.29■■□□□ 1.32
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