RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.62■■■■□ 3.29
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.91■■■□□ 2.7
ATG4B-218ENST00000479554 ABCC9O60706 1549 aa31.67■■■□□ 2.66
ATG4B-218ENST00000479554 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.27■■■□□ 2.44
ATG4B-218ENST00000479554 NACADO15069 1562 aa30.09■■■□□ 2.41
ATG4B-218ENST00000479554 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.93■■■□□ 2.38
ATG4B-218ENST00000479554 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.75■■■□□ 2.35
ATG4B-218ENST00000479554 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
ATG4B-218ENST00000479554 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.56■■■□□ 2.32
ATG4B-218ENST00000479554 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.31
ATG4B-218ENST00000479554 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.45■■■□□ 2.3
ATG4B-218ENST00000479554 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.43■■■□□ 2.3
ATG4B-218ENST00000479554 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.34■■■□□ 2.29
ATG4B-218ENST00000479554 SCRIBQ14160 1630 aa29.09■■■□□ 2.25
ATG4B-218ENST00000479554 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.02■■■□□ 2.24
ATG4B-218ENST00000479554 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
ATG4B-218ENST00000479554 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.62■■■□□ 2.17
ATG4B-218ENST00000479554 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.51■■■□□ 2.15
ATG4B-218ENST00000479554 SMARCA4P51532 1647 aa27.76■■■□□ 2.03
ATG4B-218ENST00000479554 NCAPD3P42695 1498 aa27.75■■■□□ 2.03
ATG4B-218ENST00000479554 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.71■■■□□ 2.03
ATG4B-218ENST00000479554 SMARCA2P51531 1590 aa27.67■■■□□ 2.02
ATG4B-218ENST00000479554 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
ATG4B-218ENST00000479554 HMGXB3Q12766 1538 aa27.61■■■□□ 2.01
ATG4B-218ENST00000479554 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.48■■□□□ 1.99
ATG4B-218ENST00000479554 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
ATG4B-218ENST00000479554 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.43■■□□□ 1.98
ATG4B-218ENST00000479554 ERCC6Q03468 1493 aa27.35■■□□□ 1.97
ATG4B-218ENST00000479554 NESP48681 1621 aa27.25■■□□□ 1.95
ATG4B-218ENST00000479554 CUX2O14529 1486 aa27.22■■□□□ 1.95
ATG4B-218ENST00000479554 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.14■■□□□ 1.93
ATG4B-218ENST00000479554 WIZO95785 1651 aa27.13■■□□□ 1.93
ATG4B-218ENST00000479554 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
ATG4B-218ENST00000479554 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.96■■□□□ 1.91
ATG4B-218ENST00000479554 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
ATG4B-218ENST00000479554 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.94■■□□□ 1.9
ATG4B-218ENST00000479554 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.92■■□□□ 1.9
ATG4B-218ENST00000479554 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.89■■□□□ 1.9
ATG4B-218ENST00000479554 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
ATG4B-218ENST00000479554 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.72■■□□□ 1.87
ATG4B-218ENST00000479554 CFTRP13569 1480 aa26.67■■□□□ 1.86
ATG4B-218ENST00000479554 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.67■■□□□ 1.86
ATG4B-218ENST00000479554 WDR62O43379 1518 aa26.65■■□□□ 1.86
ATG4B-218ENST00000479554 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.64■■□□□ 1.86
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.49■■□□□ 1.83
ATG4B-218ENST00000479554 PRDM2Q13029 1718 aa26.47■■□□□ 1.83
ATG4B-218ENST00000479554 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
ATG4B-218ENST00000479554 TOPBP1Q92547 1522 aa26.15■■□□□ 1.78
ATG4B-218ENST00000479554 ABCC8Q09428 1581 aa26.12■■□□□ 1.77
ATG4B-218ENST00000479554 IFT140Q96RY7 1462 aa26.11■■□□□ 1.77
ATG4B-218ENST00000479554 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.1■■□□□ 1.77
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
ATG4B-218ENST00000479554 OSCARQ8IYS5 282 aa25.96■■□□□ 1.75
ATG4B-218ENST00000479554 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
ATG4B-218ENST00000479554 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
ATG4B-218ENST00000479554 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
ATG4B-218ENST00000479554 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
ATG4B-218ENST00000479554 TRIM41Q8WV44 630 aa25.84■■□□□ 1.73
ATG4B-218ENST00000479554 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.81■■□□□ 1.722e-11■■■□□ 18.5
ATG4B-218ENST00000479554 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.79■■□□□ 1.72
ATG4B-218ENST00000479554 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.78■■□□□ 1.72
ATG4B-218ENST00000479554 CUX1P39880 1505 aa25.78■■□□□ 1.72
ATG4B-218ENST00000479554 SOGA1O94964 1423 aa25.77■■□□□ 1.72
ATG4B-218ENST00000479554 WDR97A6NE52 1622 aa25.7■■□□□ 1.7
ATG4B-218ENST00000479554 CHD1O14646 1710 aa25.69■■□□□ 1.7
ATG4B-218ENST00000479554 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
ATG4B-218ENST00000479554 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.65■■□□□ 1.7
ATG4B-218ENST00000479554 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.65■■□□□ 1.7
ATG4B-218ENST00000479554 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.65■■□□□ 1.7
ATG4B-218ENST00000479554 FBLN2P98095 1184 aa25.6■■□□□ 1.69
ATG4B-218ENST00000479554 ARHGEF11O15085 1522 aa25.59■■□□□ 1.69
ATG4B-218ENST00000479554 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.59■■□□□ 1.69
ATG4B-218ENST00000479554 GRIN2BQ13224 1484 aa25.54■■□□□ 1.68
ATG4B-218ENST00000479554 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
ATG4B-218ENST00000479554 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.49■■□□□ 1.67
ATG4B-218ENST00000479554 PBRM1Q86U86 1689 aa25.48■■□□□ 1.67
ATG4B-218ENST00000479554 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG4B-218ENST00000479554 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.45■■□□□ 1.67
ATG4B-218ENST00000479554 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
ATG4B-218ENST00000479554 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.45■■□□□ 1.66
ATG4B-218ENST00000479554 TOP2BQ02880 1626 aa25.44■■□□□ 1.66
ATG4B-218ENST00000479554 SYNJ2O15056 1496 aa25.43■■□□□ 1.66
ATG4B-218ENST00000479554 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
ATG4B-218ENST00000479554 SYNJ1O43426 1573 aa25.42■■□□□ 1.66
ATG4B-218ENST00000479554 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.4■■□□□ 1.66
ATG4B-218ENST00000479554 ARAP1Q96P48 1450 aa25.35■■□□□ 1.65
ATG4B-218ENST00000479554 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.34■■□□□ 1.65
ATG4B-218ENST00000479554 ADAMTS12P58397 1594 aa25.26■■□□□ 1.63
ATG4B-218ENST00000479554 GRIN2AQ12879 1464 aa25.22■■□□□ 1.63
ATG4B-218ENST00000479554 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.19■■□□□ 1.62
ATG4B-218ENST00000479554 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.17■■□□□ 1.62
ATG4B-218ENST00000479554 CEP170Q5SW79 1584 aa25.12■■□□□ 1.61
ATG4B-218ENST00000479554 NUP160Q12769 1436 aa25.12■■□□□ 1.61
ATG4B-218ENST00000479554 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
ATG4B-218ENST00000479554 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25■■□□□ 1.59
ATG4B-218ENST00000479554 SHROOM2Q13796 1616 aa24.99■■□□□ 1.59
ATG4B-218ENST00000479554 KIF27Q86VH2 1401 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG4B-218ENST00000479554 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.9■■□□□ 1.58
ATG4B-218ENST00000479554 CUL7Q14999 1698 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4B-218ENST00000479554 IGF1RP08069 1367 aa24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms