RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478150.1

STX4-208, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 4

Gene STX4, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-208ENST00000478150 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
STX4-208ENST00000478150 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.54■■■□□ 2.48
STX4-208ENST00000478150 JPH4Q96JJ6 628 aa30.53■■■□□ 2.48
STX4-208ENST00000478150 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.52■■■□□ 2.48
STX4-208ENST00000478150 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.47■■■□□ 2.47
STX4-208ENST00000478150 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.43■■■□□ 2.46
STX4-208ENST00000478150 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.43■■■□□ 2.46
STX4-208ENST00000478150 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.36■■■□□ 2.45
STX4-208ENST00000478150 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.33■■■□□ 2.45
STX4-208ENST00000478150 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.32■■■□□ 2.44
STX4-208ENST00000478150 MAPKBP1O60336 1514 aa30.28■■■□□ 2.44
STX4-208ENST00000478150 IQGAP2Q13576 1575 aa30.22■■■□□ 2.43
STX4-208ENST00000478150 DIP2BQ9P265 1576 aa30.17■■■□□ 2.42
STX4-208ENST00000478150 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.17■■■□□ 2.42
STX4-208ENST00000478150 PRXQ9BXM0 1461 aa30.15■■■□□ 2.42
STX4-208ENST00000478150 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.13■■■□□ 2.41
STX4-208ENST00000478150 EEA1Q15075 1411 aa30.08■■■□□ 2.41
STX4-208ENST00000478150 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.07■■■□□ 2.4
STX4-208ENST00000478150 KDM6BO15054 1643 aa30.07■■■□□ 2.4
STX4-208ENST00000478150 PTPRGP23470 1445 aa30.05■■■□□ 2.4
STX4-208ENST00000478150 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.05■■■□□ 2.4
STX4-208ENST00000478150 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.04■■■□□ 2.4
STX4-208ENST00000478150 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.04■■■□□ 2.4
STX4-208ENST00000478150 DISP1Q96F81 1524 aa30.01■■■□□ 2.4
STX4-208ENST00000478150 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.01■■■□□ 2.39
STX4-208ENST00000478150 TSPOAP1O95153 1857 aa29.99■■■□□ 2.39
STX4-208ENST00000478150 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
STX4-208ENST00000478150 KIAA0556O60303 1618 aa29.93■■■□□ 2.38
STX4-208ENST00000478150 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.92■■■□□ 2.38
STX4-208ENST00000478150 ABCC2Q92887 1545 aa29.91■■■□□ 2.38
STX4-208ENST00000478150 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
STX4-208ENST00000478150 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.9■■■□□ 2.38
STX4-208ENST00000478150 GOLGA3Q08378 1498 aa29.89■■■□□ 2.38
STX4-208ENST00000478150 ASXL2Q76L83 1435 aa29.83■■■□□ 2.37
STX4-208ENST00000478150 UACAQ9BZF9 1416 aa29.83■■■□□ 2.37
STX4-208ENST00000478150 GLI2P10070 1586 aa29.82■■■□□ 2.36
STX4-208ENST00000478150 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.82■■■□□ 2.36
STX4-208ENST00000478150 KIF21BO75037 1637 aa29.77■■■□□ 2.36
STX4-208ENST00000478150 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
STX4-208ENST00000478150 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.67■■■□□ 2.34
STX4-208ENST00000478150 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.67■■■□□ 2.34
STX4-208ENST00000478150 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
STX4-208ENST00000478150 SAMD9Q5K651 1589 aa29.64■■■□□ 2.34
STX4-208ENST00000478150 P3H3Q8IVL6 736 aa29.63■■■□□ 2.33
STX4-208ENST00000478150 ABCA8O94911 1581 aa29.62■■■□□ 2.33
STX4-208ENST00000478150 ADGRL1O94910 1474 aa29.6■■■□□ 2.33
STX4-208ENST00000478150 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
STX4-208ENST00000478150 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.59■■■□□ 2.33
STX4-208ENST00000478150 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
STX4-208ENST00000478150 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
STX4-208ENST00000478150 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.54■■■□□ 2.32
STX4-208ENST00000478150 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
STX4-208ENST00000478150 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.49■■■□□ 2.31
STX4-208ENST00000478150 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.48■■■□□ 2.31
STX4-208ENST00000478150 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.47■■■□□ 2.31
STX4-208ENST00000478150 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
STX4-208ENST00000478150 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.42■■■□□ 2.3
STX4-208ENST00000478150 CD109Q6YHK3 1445 aa29.38■■■□□ 2.29
STX4-208ENST00000478150 ARID3CA6NKF2 412 aa29.38■■■□□ 2.29
STX4-208ENST00000478150 ATP10BO94823 1461 aa29.37■■■□□ 2.29
STX4-208ENST00000478150 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.37■■■□□ 2.29
STX4-208ENST00000478150 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.35■■■□□ 2.29
STX4-208ENST00000478150 KCNH8Q96L42 1107 aa29.35■■■□□ 2.29
STX4-208ENST00000478150 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
STX4-208ENST00000478150 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.3■■■□□ 2.28
STX4-208ENST00000478150 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.28■■■□□ 2.28
STX4-208ENST00000478150 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
STX4-208ENST00000478150 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
STX4-208ENST00000478150 FMN1Q68DA7 1419 aa29.23■■■□□ 2.27
STX4-208ENST00000478150 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.17■■■□□ 2.26
STX4-208ENST00000478150 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.15■■■□□ 2.26
STX4-208ENST00000478150 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.13■■■□□ 2.25
STX4-208ENST00000478150 HECW1Q76N89 1606 aa29.11■■■□□ 2.25
STX4-208ENST00000478150 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.11■■■□□ 2.25
STX4-208ENST00000478150 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
STX4-208ENST00000478150 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
STX4-208ENST00000478150 CLIP1P30622 1438 aa29.05■■■□□ 2.24
STX4-208ENST00000478150 NEO1Q92859 1461 aa28.98■■■□□ 2.23
STX4-208ENST00000478150 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
STX4-208ENST00000478150 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.96■■■□□ 2.23
STX4-208ENST00000478150 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
STX4-208ENST00000478150 RAPGEF3O95398 923 aa28.93■■■□□ 2.22
STX4-208ENST00000478150 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.93■■■□□ 2.22
STX4-208ENST00000478150 PTPRMP28827 1452 aa28.92■■■□□ 2.22
STX4-208ENST00000478150 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.91■■■□□ 2.22
STX4-208ENST00000478150 FBXO41Q8TF61 875 aa28.91■■■□□ 2.22
STX4-208ENST00000478150 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.89■■■□□ 2.22
STX4-208ENST00000478150 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
STX4-208ENST00000478150 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.89■■■□□ 2.21
STX4-208ENST00000478150 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.88■■■□□ 2.21
STX4-208ENST00000478150 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.88■■■□□ 2.21
STX4-208ENST00000478150 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
STX4-208ENST00000478150 CEP162Q5TB80 1403 aa28.85■■■□□ 2.21
STX4-208ENST00000478150 FANCAO15360 1455 aa28.82■■■□□ 2.2
STX4-208ENST00000478150 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.82■■■□□ 2.2
STX4-208ENST00000478150 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.81■■■□□ 2.2
STX4-208ENST00000478150 KIF14Q15058 1648 aa28.81■■■□□ 2.2
STX4-208ENST00000478150 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.78■■■□□ 2.2
STX4-208ENST00000478150 AKNAQ7Z591 1439 aa28.77■■■□□ 2.2
STX4-208ENST00000478150 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.8 ms