RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478150.1

STX4-208, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 4

Gene STX4, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-208ENST00000478150 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.88■■■■■ 4.61
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STX4-208ENST00000478150 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.29■■■■□ 3.4
STX4-208ENST00000478150 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.1■■■■□ 3.37
STX4-208ENST00000478150 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.78■■■■□ 3.32
STX4-208ENST00000478150 SCRIBQ14160 1630 aa35.68■■■■□ 3.3
STX4-208ENST00000478150 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.48■■■■□ 3.27
STX4-208ENST00000478150 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.47■■■■□ 3.27
STX4-208ENST00000478150 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
STX4-208ENST00000478150 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.54■■■■□ 3.12
STX4-208ENST00000478150 CUX2O14529 1486 aa34.13■■■■□ 3.05
STX4-208ENST00000478150 NCAPD3P42695 1498 aa34.13■■■■□ 3.05
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STX4-208ENST00000478150 SMARCA2P51531 1590 aa33.94■■■■□ 3.02
STX4-208ENST00000478150 HMGXB3Q12766 1538 aa33.82■■■■□ 3
STX4-208ENST00000478150 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.8■■■■□ 3
STX4-208ENST00000478150 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.77■■■■□ 3
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STX4-208ENST00000478150 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.42■■■□□ 2.94
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STX4-208ENST00000478150 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.15■■■□□ 2.9
STX4-208ENST00000478150 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.09■■■□□ 2.89
STX4-208ENST00000478150 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.89
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STX4-208ENST00000478150 WDR62O43379 1518 aa32.86■■■□□ 2.85
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STX4-208ENST00000478150 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.75■■■□□ 2.83
STX4-208ENST00000478150 CFTRP13569 1480 aa32.74■■■□□ 2.83
STX4-208ENST00000478150 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.67■■■□□ 2.82
STX4-208ENST00000478150 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.67■■■□□ 2.82
STX4-208ENST00000478150 OSCARQ8IYS5 282 aa32.55■■■□□ 2.8
STX4-208ENST00000478150 PRDM2Q13029 1718 aa32.46■■■□□ 2.79
STX4-208ENST00000478150 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
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STX4-208ENST00000478150 IFT140Q96RY7 1462 aa32.15■■■□□ 2.74
STX4-208ENST00000478150 ABCC8Q09428 1581 aa32.07■■■□□ 2.72
STX4-208ENST00000478150 TOPBP1Q92547 1522 aa32.07■■■□□ 2.72
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STX4-208ENST00000478150 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.02■■■□□ 2.72
STX4-208ENST00000478150 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.02■■■□□ 2.72
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STX4-208ENST00000478150 CUX1P39880 1505 aa31.73■■■□□ 2.67
STX4-208ENST00000478150 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
STX4-208ENST00000478150 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.67
STX4-208ENST00000478150 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.67■■■□□ 2.66
STX4-208ENST00000478150 FBLN2P98095 1184 aa31.67■■■□□ 2.66
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STX4-208ENST00000478150 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.64■■■□□ 2.66
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STX4-208ENST00000478150 ARAP1Q96P48 1450 aa31.53■■■□□ 2.64
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STX4-208ENST00000478150 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.38■■■□□ 2.61
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STX4-208ENST00000478150 SYNJ1O43426 1573 aa31.37■■■□□ 2.61
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STX4-208ENST00000478150 GRIN2BQ13224 1484 aa31.32■■■□□ 2.6
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STX4-208ENST00000478150 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.28■■■□□ 2.6
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STX4-208ENST00000478150 SYNJ2O15056 1496 aa31.24■■■□□ 2.59
STX4-208ENST00000478150 PBRM1Q86U86 1689 aa31.21■■■□□ 2.59
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STX4-208ENST00000478150 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.98■■■□□ 2.55
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STX4-208ENST00000478150 GRIN2AQ12879 1464 aa30.91■■■□□ 2.54
STX4-208ENST00000478150 KIF27Q86VH2 1401 aa30.83■■■□□ 2.53
STX4-208ENST00000478150 NUP160Q12769 1436 aa30.78■■■□□ 2.52
STX4-208ENST00000478150 CEP170Q5SW79 1584 aa30.75■■■□□ 2.51
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STX4-208ENST00000478150 IGF1RP08069 1367 aa30.71■■■□□ 2.51
STX4-208ENST00000478150 SHROOM2Q13796 1616 aa30.66■■■□□ 2.5
STX4-208ENST00000478150 CUL7Q14999 1698 aa30.65■■■□□ 2.5
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