RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477768.1

URGCP-211, Transcript of upregulator of cell proliferation, humanhuman

TSL 4

Gene URGCP, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URGCP-211ENST00000477768 SHROOM2Q13796 1616 aa36.37■■■■□ 3.41
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URGCP-211ENST00000477768 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.29■■■■□ 3.4
URGCP-211ENST00000477768 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.27■■■■□ 3.4
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URGCP-211ENST00000477768 PRXQ9BXM0 1461 aa36.18■■■■□ 3.38
URGCP-211ENST00000477768 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.17■■■■□ 3.38
URGCP-211ENST00000477768 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
URGCP-211ENST00000477768 EEA1Q15075 1411 aa36.08■■■■□ 3.37
URGCP-211ENST00000477768 IQGAP2Q13576 1575 aa36.06■■■■□ 3.36
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URGCP-211ENST00000477768 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.84■■■■□ 3.33
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URGCP-211ENST00000477768 KIAA0556O60303 1618 aa35.74■■■■□ 3.31
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URGCP-211ENST00000477768 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.69■■■■□ 3.3
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URGCP-211ENST00000477768 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.47■■■■□ 3.27
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URGCP-211ENST00000477768 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.33■■■■□ 3.25
URGCP-211ENST00000477768 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.32■■■■□ 3.24
URGCP-211ENST00000477768 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
URGCP-211ENST00000477768 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.27■■■■□ 3.24
URGCP-211ENST00000477768 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.27■■■■□ 3.24
URGCP-211ENST00000477768 ASXL2Q76L83 1435 aa35.24■■■■□ 3.23
URGCP-211ENST00000477768 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.24■■■■□ 3.23
URGCP-211ENST00000477768 DIP2BQ9P265 1576 aa35.21■■■■□ 3.23
URGCP-211ENST00000477768 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.2■■■■□ 3.23
URGCP-211ENST00000477768 ARID3CA6NKF2 412 aa35.19■■■■□ 3.22
URGCP-211ENST00000477768 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.16■■■■□ 3.22
URGCP-211ENST00000477768 ATP10BO94823 1461 aa35.1■■■■□ 3.21
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URGCP-211ENST00000477768 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.03■■■■□ 3.2
URGCP-211ENST00000477768 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.02■■■■□ 3.2
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URGCP-211ENST00000477768 CEP162Q5TB80 1403 aa34.8■■■■□ 3.16
URGCP-211ENST00000477768 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.77■■■■□ 3.16
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URGCP-211ENST00000477768 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
URGCP-211ENST00000477768 CD109Q6YHK3 1445 aa34.73■■■■□ 3.15
URGCP-211ENST00000477768 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.73■■■■□ 3.15
URGCP-211ENST00000477768 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.72■■■■□ 3.15
URGCP-211ENST00000477768 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.67■■■■□ 3.14
URGCP-211ENST00000477768 KDM6BO15054 1643 aa34.64■■■■□ 3.14
URGCP-211ENST00000477768 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.64■■■■□ 3.14
URGCP-211ENST00000477768 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.63■■■■□ 3.13
URGCP-211ENST00000477768 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.61■■■■□ 3.13
URGCP-211ENST00000477768 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
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URGCP-211ENST00000477768 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.52■■■■□ 3.12
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URGCP-211ENST00000477768 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.36■■■■□ 3.09
URGCP-211ENST00000477768 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.35■■■■□ 3.09
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URGCP-211ENST00000477768 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.21■■■■□ 3.07
URGCP-211ENST00000477768 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.19■■■■□ 3.06
URGCP-211ENST00000477768 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.17■■■■□ 3.06
URGCP-211ENST00000477768 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.17■■■■□ 3.06
URGCP-211ENST00000477768 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.17■■■■□ 3.06
URGCP-211ENST00000477768 TIAM1Q13009 1591 aa34.16■■■■□ 3.06
URGCP-211ENST00000477768 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
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