RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477768.1

URGCP-211, Transcript of upregulator of cell proliferation, humanhuman

TSL 4

Gene URGCP, Length 500 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URGCP-211ENST00000477768 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.45■■■■■ 5.99
URGCP-211ENST00000477768 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.56■■■■■ 5.04
URGCP-211ENST00000477768 ABCC9O60706 1549 aa45.69■■■■■ 4.9
URGCP-211ENST00000477768 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.93■■■■■ 4.62
URGCP-211ENST00000477768 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.84■■■■■ 4.61
URGCP-211ENST00000477768 NACADO15069 1562 aa43.79■■■■■ 4.6
URGCP-211ENST00000477768 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
URGCP-211ENST00000477768 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.48■■■■■ 4.55
URGCP-211ENST00000477768 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.32■■■■■ 4.52
URGCP-211ENST00000477768 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.98■■■■■ 4.47
URGCP-211ENST00000477768 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.76■■■■■ 4.44
URGCP-211ENST00000477768 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.62■■■■■ 4.41
URGCP-211ENST00000477768 SCRIBQ14160 1630 aa42.59■■■■■ 4.41
URGCP-211ENST00000477768 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.07■■■■■ 4.33
URGCP-211ENST00000477768 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.96■■■■■ 4.31
URGCP-211ENST00000477768 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
URGCP-211ENST00000477768 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.31■■■■■ 4.2
URGCP-211ENST00000477768 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.01■■■■■ 4.16
URGCP-211ENST00000477768 SMARCA4P51532 1647 aa40.7■■■■■ 4.11
URGCP-211ENST00000477768 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
URGCP-211ENST00000477768 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.49■■■■■ 4.07
URGCP-211ENST00000477768 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.48■■■■■ 4.07
URGCP-211ENST00000477768 NCAPD3P42695 1498 aa40.44■■■■■ 4.06
URGCP-211ENST00000477768 SMARCA2P51531 1590 aa40.36■■■■■ 4.05
URGCP-211ENST00000477768 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.26■■■■■ 4.04
URGCP-211ENST00000477768 HMGXB3Q12766 1538 aa40.2■■■■■ 4.03
URGCP-211ENST00000477768 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
URGCP-211ENST00000477768 WIZO95785 1651 aa40.06■■■■■ 4
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URGCP-211ENST00000477768 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
URGCP-211ENST00000477768 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.33■■■■□ 3.89
URGCP-211ENST00000477768 ERCC6Q03468 1493 aa39.3■■■■□ 3.88
URGCP-211ENST00000477768 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.28■■■■□ 3.88
URGCP-211ENST00000477768 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.15■■■■□ 3.86
URGCP-211ENST00000477768 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.07■■■■□ 3.85
URGCP-211ENST00000477768 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.07■■■■□ 3.85
URGCP-211ENST00000477768 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
URGCP-211ENST00000477768 CFTRP13569 1480 aa39.04■■■■□ 3.84
URGCP-211ENST00000477768 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
URGCP-211ENST00000477768 CUX2O14529 1486 aa38.85■■■■□ 3.81
URGCP-211ENST00000477768 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.83■■■■□ 3.81
URGCP-211ENST00000477768 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.74■■■■□ 3.79
URGCP-211ENST00000477768 PRDM2Q13029 1718 aa38.72■■■■□ 3.79
URGCP-211ENST00000477768 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.7■■■■□ 3.79
URGCP-211ENST00000477768 WDR62O43379 1518 aa38.58■■■■□ 3.77
URGCP-211ENST00000477768 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
URGCP-211ENST00000477768 TOPBP1Q92547 1522 aa38.22■■■■□ 3.71
URGCP-211ENST00000477768 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.14■■■■□ 3.7
URGCP-211ENST00000477768 ABCC8Q09428 1581 aa38.11■■■■□ 3.69
URGCP-211ENST00000477768 CUX1P39880 1505 aa37.96■■■■□ 3.67
URGCP-211ENST00000477768 IFT140Q96RY7 1462 aa37.93■■■■□ 3.66
URGCP-211ENST00000477768 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
URGCP-211ENST00000477768 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
URGCP-211ENST00000477768 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
URGCP-211ENST00000477768 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.81■■■■□ 3.64
URGCP-211ENST00000477768 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.8■■■■□ 3.64
URGCP-211ENST00000477768 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.77■■■■□ 3.64
URGCP-211ENST00000477768 SOGA1O94964 1423 aa37.75■■■■□ 3.63
URGCP-211ENST00000477768 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.67■■■■□ 3.62
URGCP-211ENST00000477768 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.65■■■■□ 3.628e-7■■■■■ 28.7
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URGCP-211ENST00000477768 SYNJ1O43426 1573 aa37.63■■■■□ 3.62
URGCP-211ENST00000477768 TOP2BQ02880 1626 aa37.58■■■■□ 3.61
URGCP-211ENST00000477768 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.58■■■■□ 3.61
URGCP-211ENST00000477768 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.61
URGCP-211ENST00000477768 WDR97A6NE52 1622 aa37.48■■■■□ 3.59
URGCP-211ENST00000477768 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.41■■■■□ 3.58
URGCP-211ENST00000477768 OSCARQ8IYS5 282 aa37.32■■■■□ 3.56
URGCP-211ENST00000477768 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.29■■■■□ 3.56
URGCP-211ENST00000477768 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.27■■■■□ 3.56
URGCP-211ENST00000477768 GRIN2BQ13224 1484 aa37.26■■■■□ 3.55
URGCP-211ENST00000477768 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.25■■■■□ 3.55
URGCP-211ENST00000477768 PBRM1Q86U86 1689 aa37.22■■■■□ 3.55
URGCP-211ENST00000477768 CHD1O14646 1710 aa37.22■■■■□ 3.55
URGCP-211ENST00000477768 FBLN2P98095 1184 aa37.19■■■■□ 3.54
URGCP-211ENST00000477768 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.54
URGCP-211ENST00000477768 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
URGCP-211ENST00000477768 SYNJ2O15056 1496 aa37.01■■■■□ 3.52
URGCP-211ENST00000477768 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.94■■■■□ 3.5
URGCP-211ENST00000477768 ADAMTS12P58397 1594 aa36.91■■■■□ 3.5
URGCP-211ENST00000477768 KIF27Q86VH2 1401 aa36.85■■■■□ 3.49
URGCP-211ENST00000477768 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.84■■■■□ 3.49
URGCP-211ENST00000477768 TRIM41Q8WV44 630 aa36.81■■■■□ 3.48
URGCP-211ENST00000477768 GRIN2AQ12879 1464 aa36.8■■■■□ 3.48
URGCP-211ENST00000477768 IGF1RP08069 1367 aa36.78■■■■□ 3.48
URGCP-211ENST00000477768 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.77■■■■□ 3.48
URGCP-211ENST00000477768 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.74■■■■□ 3.47
URGCP-211ENST00000477768 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.74■■■■□ 3.47
URGCP-211ENST00000477768 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.74■■■■□ 3.47
URGCP-211ENST00000477768 ARHGEF11O15085 1522 aa36.7■■■■□ 3.47
URGCP-211ENST00000477768 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.68■■■■□ 3.46
URGCP-211ENST00000477768 CEP170Q5SW79 1584 aa36.66■■■■□ 3.46
URGCP-211ENST00000477768 NUP160Q12769 1436 aa36.64■■■■□ 3.46
URGCP-211ENST00000477768 CUL7Q14999 1698 aa36.59■■■■□ 3.45
URGCP-211ENST00000477768 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.54■■■■□ 3.44
URGCP-211ENST00000477768 ARAP1Q96P48 1450 aa36.43■■■■□ 3.42
URGCP-211ENST00000477768 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.43■■■■□ 3.42
URGCP-211ENST00000477768 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.43■■■■□ 3.42
URGCP-211ENST00000477768 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.37■■■■□ 3.41
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