RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476535.1

LCLAT1-208, Transcript of lysocardiolipin acyltransferase 1, human

TSL 4

Gene LCLAT1, Length 537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LCLAT1-208	ENST00000476535	JPH4	Q96JJ6	628 aa		30.49	■■■□□ 2.47
LCLAT1-208	ENST00000476535	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	30.48	■■■□□ 2.47
LCLAT1-208	ENST00000476535	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		30.43	■■■□□ 2.46
LCLAT1-208	ENST00000476535	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		30.41	■■■□□ 2.46
LCLAT1-208	ENST00000476535	IQGAP2	Q13576	1575 aa		30.19	■■■□□ 2.42
LCLAT1-208	ENST00000476535	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		30.19	■■■□□ 2.42
LCLAT1-208	ENST00000476535	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		30.13	■■■□□ 2.41
LCLAT1-208	ENST00000476535	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		30.11	■■■□□ 2.41
LCLAT1-208	ENST00000476535	MAPKBP1	O60336	1514 aa		30.06	■■■□□ 2.4
LCLAT1-208	ENST00000476535	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		30.06	■■■□□ 2.4
LCLAT1-208	ENST00000476535	PTPRG	P23470	1445 aa		30.05	■■■□□ 2.4
LCLAT1-208	ENST00000476535	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		30.04	■■■□□ 2.4
LCLAT1-208	ENST00000476535	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	30.04	■■■□□ 2.4
LCLAT1-208	ENST00000476535	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		30.02	■■■□□ 2.4
LCLAT1-208	ENST00000476535	DISP1	Q96F81	1524 aa		30	■■■□□ 2.39
LCLAT1-208	ENST00000476535	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		29.97	■■■□□ 2.39
LCLAT1-208	ENST00000476535	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.97	■■■□□ 2.39
LCLAT1-208	ENST00000476535	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		29.97	■■■□□ 2.39
LCLAT1-208	ENST00000476535	DIP2B	Q9P265	1576 aa		29.91	■■■□□ 2.38
LCLAT1-208	ENST00000476535	KIAA0556	O60303	1618 aa		29.91	■■■□□ 2.38
LCLAT1-208	ENST00000476535	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		29.89	■■■□□ 2.38
LCLAT1-208	ENST00000476535	ABCC2	Q92887	1545 aa		29.89	■■■□□ 2.38
LCLAT1-208	ENST00000476535	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		29.86	■■■□□ 2.37
LCLAT1-208	ENST00000476535	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.85	■■■□□ 2.37
LCLAT1-208	ENST00000476535	UACA	Q9BZF9	1416 aa		29.85	■■■□□ 2.37
LCLAT1-208	ENST00000476535	GOLGA3	Q08378	1498 aa		29.8	■■■□□ 2.36
LCLAT1-208	ENST00000476535	EEA1	Q15075	1411 aa		29.78	■■■□□ 2.36
LCLAT1-208	ENST00000476535	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.75	■■■□□ 2.35
LCLAT1-208	ENST00000476535	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		29.74	■■■□□ 2.35
LCLAT1-208	ENST00000476535	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		29.74	■■■□□ 2.35
LCLAT1-208	ENST00000476535	ASXL2	Q76L83	1435 aa		29.72	■■■□□ 2.35
LCLAT1-208	ENST00000476535	GLI2	P10070	1586 aa		29.67	■■■□□ 2.34
LCLAT1-208	ENST00000476535	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	29.67	■■■□□ 2.34
LCLAT1-208	ENST00000476535	TSPOAP1	O95153	1857 aa		29.65	■■■□□ 2.34
LCLAT1-208	ENST00000476535	ABCA8	O94911	1581 aa		29.62	■■■□□ 2.33
LCLAT1-208	ENST00000476535	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	29.56	■■■□□ 2.32
LCLAT1-208	ENST00000476535	KDM6B	O15054	1643 aa		29.55	■■■□□ 2.32
LCLAT1-208	ENST00000476535	SAMD9	Q5K651	1589 aa		29.55	■■■□□ 2.32
LCLAT1-208	ENST00000476535	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	29.53	■■■□□ 2.32
LCLAT1-208	ENST00000476535	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		29.51	■■■□□ 2.31
LCLAT1-208	ENST00000476535	KIF21B	O75037	1637 aa		29.51	■■■□□ 2.31
LCLAT1-208	ENST00000476535	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		29.5	■■■□□ 2.31
LCLAT1-208	ENST00000476535	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		29.46	■■■□□ 2.31
LCLAT1-208	ENST00000476535	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	29.45	■■■□□ 2.31
LCLAT1-208	ENST00000476535	P3H3	Q8IVL6	736 aa		29.42	■■■□□ 2.3
LCLAT1-208	ENST00000476535	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		29.39	■■■□□ 2.3
LCLAT1-208	ENST00000476535	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	29.38	■■■□□ 2.29
LCLAT1-208	ENST00000476535	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		29.36	■■■□□ 2.29
LCLAT1-208	ENST00000476535	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		29.34	■■■□□ 2.29
LCLAT1-208	ENST00000476535	ATP10B	O94823	1461 aa		29.34	■■■□□ 2.29
LCLAT1-208	ENST00000476535	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		29.32	■■■□□ 2.28
LCLAT1-208	ENST00000476535	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		29.28	■■■□□ 2.28
LCLAT1-208	ENST00000476535	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		29.28	■■■□□ 2.28
LCLAT1-208	ENST00000476535	CD109	Q6YHK3	1445 aa		29.27	■■■□□ 2.28
LCLAT1-208	ENST00000476535	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	29.26	■■■□□ 2.27
LCLAT1-208	ENST00000476535	KCNH8	Q96L42	1107 aa		29.26	■■■□□ 2.27
LCLAT1-208	ENST00000476535	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
LCLAT1-208	ENST00000476535	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
LCLAT1-208	ENST00000476535	ARID3C	A6NKF2	412 aa		29.22	■■■□□ 2.27
LCLAT1-208	ENST00000476535	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		29.17	■■■□□ 2.26
LCLAT1-208	ENST00000476535	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
LCLAT1-208	ENST00000476535	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
LCLAT1-208	ENST00000476535	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
LCLAT1-208	ENST00000476535	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		29.07	■■■□□ 2.24
LCLAT1-208	ENST00000476535	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		29.07	■■■□□ 2.24
LCLAT1-208	ENST00000476535	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		29.05	■■■□□ 2.24
LCLAT1-208	ENST00000476535	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		29.04	■■■□□ 2.24
LCLAT1-208	ENST00000476535	FMN1	Q68DA7	1419 aa		29.03	■■■□□ 2.24
LCLAT1-208	ENST00000476535	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		29.03	■■■□□ 2.24
LCLAT1-208	ENST00000476535	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		29.01	■■■□□ 2.23
LCLAT1-208	ENST00000476535	NEO1	Q92859	1461 aa		28.98	■■■□□ 2.23
LCLAT1-208	ENST00000476535	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.96	■■■□□ 2.23
LCLAT1-208	ENST00000476535	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.95	■■■□□ 2.22
LCLAT1-208	ENST00000476535	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
LCLAT1-208	ENST00000476535	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	28.91	■■■□□ 2.22
LCLAT1-208	ENST00000476535	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		28.87	■■■□□ 2.21
LCLAT1-208	ENST00000476535	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		28.85	■■■□□ 2.21
LCLAT1-208	ENST00000476535	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		28.81	■■■□□ 2.2
LCLAT1-208	ENST00000476535	FANCA	O15360	1455 aa		28.8	■■■□□ 2.2
LCLAT1-208	ENST00000476535	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
LCLAT1-208	ENST00000476535	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
LCLAT1-208	ENST00000476535	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.78	■■■□□ 2.2
LCLAT1-208	ENST00000476535	RAPGEF3	O95398	923 aa		28.78	■■■□□ 2.2
LCLAT1-208	ENST00000476535	AKNA	Q7Z591	1439 aa		28.77	■■■□□ 2.2
LCLAT1-208	ENST00000476535	RICTOR	Q6R327	1708 aa		28.75	■■■□□ 2.19
LCLAT1-208	ENST00000476535	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.75	■■■□□ 2.19
LCLAT1-208	ENST00000476535	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
LCLAT1-208	ENST00000476535	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
LCLAT1-208	ENST00000476535	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
LCLAT1-208	ENST00000476535	PLCH2	O75038	1416 aa		28.73	■■■□□ 2.19
LCLAT1-208	ENST00000476535	KIF14	Q15058	1648 aa		28.72	■■■□□ 2.19
LCLAT1-208	ENST00000476535	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		28.71	■■■□□ 2.19
LCLAT1-208	ENST00000476535	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.71	■■■□□ 2.19
LCLAT1-208	ENST00000476535	CLIP1	P30622	1438 aa		28.69	■■■□□ 2.18
LCLAT1-208	ENST00000476535	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		28.67	■■■□□ 2.18
LCLAT1-208	ENST00000476535	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.66	■■■□□ 2.18
LCLAT1-208	ENST00000476535	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		28.66	■■■□□ 2.18
LCLAT1-208	ENST00000476535	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		28.59	■■■□□ 2.17
LCLAT1-208	ENST00000476535	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		28.59	■■■□□ 2.17
LCLAT1-208	ENST00000476535	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		28.59	■■■□□ 2.17

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