RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
SYF2-204ENST00000476231 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.48■■■□□ 2.31
SYF2-204ENST00000476231 ADAMTS12P58397 1594 aa29.46■■■□□ 2.31
SYF2-204ENST00000476231 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
SYF2-204ENST00000476231 APLP2Q06481 763 aa29.39■■■□□ 2.29
SYF2-204ENST00000476231 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.38■■■□□ 2.29
SYF2-204ENST00000476231 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.3■■■□□ 2.28
SYF2-204ENST00000476231 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
SYF2-204ENST00000476231 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
SYF2-204ENST00000476231 SAMD9Q5K651 1589 aa29.23■■■□□ 2.27
SYF2-204ENST00000476231 IQGAP2Q13576 1575 aa29.18■■■□□ 2.26
SYF2-204ENST00000476231 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.18■■■□□ 2.26
SYF2-204ENST00000476231 GRIN2AQ12879 1464 aa29.17■■■□□ 2.26
SYF2-204ENST00000476231 P3H3Q8IVL6 736 aa29.16■■■□□ 2.26
SYF2-204ENST00000476231 MAP3K1Q13233 1512 aa29.16■■■□□ 2.26
SYF2-204ENST00000476231 SYNJ2O15056 1496 aa29.15■■■□□ 2.26
SYF2-204ENST00000476231 FMN1Q68DA7 1419 aa29.11■■■□□ 2.25
SYF2-204ENST00000476231 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
SYF2-204ENST00000476231 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.09■■■□□ 2.25
SYF2-204ENST00000476231 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.08■■■□□ 2.25
SYF2-204ENST00000476231 TIAM1Q13009 1591 aa29.08■■■□□ 2.25
SYF2-204ENST00000476231 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.07■■■□□ 2.24
SYF2-204ENST00000476231 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
SYF2-204ENST00000476231 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
SYF2-204ENST00000476231 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.05■■■□□ 2.24
SYF2-204ENST00000476231 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.02■■■□□ 2.24
SYF2-204ENST00000476231 CEP170Q5SW79 1584 aa28.97■■■□□ 2.23
SYF2-204ENST00000476231 NUP160Q12769 1436 aa28.94■■■□□ 2.22
SYF2-204ENST00000476231 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.93■■■□□ 2.22
SYF2-204ENST00000476231 FBLN2P98095 1184 aa28.92■■■□□ 2.22
SYF2-204ENST00000476231 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
SYF2-204ENST00000476231 KIAA0556O60303 1618 aa28.88■■■□□ 2.21
SYF2-204ENST00000476231 DISP1Q96F81 1524 aa28.87■■■□□ 2.21
SYF2-204ENST00000476231 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
SYF2-204ENST00000476231 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.8■■■□□ 2.2
SYF2-204ENST00000476231 HECW1Q76N89 1606 aa28.79■■■□□ 2.2
SYF2-204ENST00000476231 CHD1O14646 1710 aa28.76■■■□□ 2.2
SYF2-204ENST00000476231 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.76■■■□□ 2.19
SYF2-204ENST00000476231 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
SYF2-204ENST00000476231 JPH4Q96JJ6 628 aa28.73■■■□□ 2.19
SYF2-204ENST00000476231 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.72■■■□□ 2.19
SYF2-204ENST00000476231 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.71■■■□□ 2.19
SYF2-204ENST00000476231 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
SYF2-204ENST00000476231 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
SYF2-204ENST00000476231 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.67■■■□□ 2.18
SYF2-204ENST00000476231 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.66■■■□□ 2.18
SYF2-204ENST00000476231 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
SYF2-204ENST00000476231 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.65■■■□□ 2.18
SYF2-204ENST00000476231 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.63■■■□□ 2.17
SYF2-204ENST00000476231 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
SYF2-204ENST00000476231 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
SYF2-204ENST00000476231 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
SYF2-204ENST00000476231 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.55■■■□□ 2.16
SYF2-204ENST00000476231 SHROOM2Q13796 1616 aa28.54■■■□□ 2.16
SYF2-204ENST00000476231 NCOA2Q15596 1464 aa28.53■■■□□ 2.16
SYF2-204ENST00000476231 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
SYF2-204ENST00000476231 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.15
SYF2-204ENST00000476231 ARHGEF11O15085 1522 aa28.5■■■□□ 2.15
SYF2-204ENST00000476231 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.48■■■□□ 2.15
SYF2-204ENST00000476231 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.46■■■□□ 2.15
SYF2-204ENST00000476231 ABCA8O94911 1581 aa28.45■■■□□ 2.14
SYF2-204ENST00000476231 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.44■■■□□ 2.14
SYF2-204ENST00000476231 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.44■■■□□ 2.14
SYF2-204ENST00000476231 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
SYF2-204ENST00000476231 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SYF2-204ENST00000476231 ARID3CA6NKF2 412 aa28.39■■■□□ 2.14
SYF2-204ENST00000476231 PTPRGP23470 1445 aa28.38■■■□□ 2.13
SYF2-204ENST00000476231 ITGAEP38570 1179 aa28.36■■■□□ 2.13
SYF2-204ENST00000476231 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.3■■■□□ 2.12
SYF2-204ENST00000476231 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
SYF2-204ENST00000476231 MIA2Q96PC5 1412 aa28.28■■■□□ 2.12
SYF2-204ENST00000476231 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SYF2-204ENST00000476231 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.27■■■□□ 2.12
SYF2-204ENST00000476231 ATP10BO94823 1461 aa28.26■■■□□ 2.11
SYF2-204ENST00000476231 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.25■■■□□ 2.11
SYF2-204ENST00000476231 UACAQ9BZF9 1416 aa28.23■■■□□ 2.11
SYF2-204ENST00000476231 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.23■■■□□ 2.11
SYF2-204ENST00000476231 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.19■■■□□ 2.1
SYF2-204ENST00000476231 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
SYF2-204ENST00000476231 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.17■■■□□ 2.1
SYF2-204ENST00000476231 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.17■■■□□ 2.1
SYF2-204ENST00000476231 ABCC2Q92887 1545 aa28.15■■■□□ 2.1
SYF2-204ENST00000476231 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.14■■■□□ 2.1
SYF2-204ENST00000476231 KIF14Q15058 1648 aa28.14■■■□□ 2.1
SYF2-204ENST00000476231 PTPRKQ15262 1439 aa28.12■■■□□ 2.09
SYF2-204ENST00000476231 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.07■■■□□ 2.08
SYF2-204ENST00000476231 HFM1A2PYH4 1435 aa28.07■■■□□ 2.08
SYF2-204ENST00000476231 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
SYF2-204ENST00000476231 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.05■■■□□ 2.08
SYF2-204ENST00000476231 OSCARQ8IYS5 282 aa28.04■■■□□ 2.08
SYF2-204ENST00000476231 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SYF2-204ENST00000476231 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
SYF2-204ENST00000476231 AKNAQ7Z591 1439 aa28■■■□□ 2.07
SYF2-204ENST00000476231 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
SYF2-204ENST00000476231 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28■■■□□ 2.07
SYF2-204ENST00000476231 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
SYF2-204ENST00000476231 NAIPQ13075 1403 aa27.99■■■□□ 2.07
SYF2-204ENST00000476231 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.97■■■□□ 2.07
SYF2-204ENST00000476231 DAPK1P53355 1430 aa27.96■■■□□ 2.07
SYF2-204ENST00000476231 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms