RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-208ENST00000455631 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.71■■■■■ 4.27
PTPRA-208ENST00000455631 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.61■■■■■ 4.25
PTPRA-208ENST00000455631 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.6■■■■■ 4.25
PTPRA-208ENST00000455631 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.57■■■■■ 4.25
PTPRA-208ENST00000455631 MAPKBP1O60336 1514 aa41.57■■■■■ 4.25
PTPRA-208ENST00000455631 DIP2BQ9P265 1576 aa41.53■■■■■ 4.24
PTPRA-208ENST00000455631 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.52■■■■■ 4.24
PTPRA-208ENST00000455631 KDM6BO15054 1643 aa41.37■■■■■ 4.21
PTPRA-208ENST00000455631 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.35■■■■■ 4.21
PTPRA-208ENST00000455631 TSPOAP1O95153 1857 aa41.32■■■■■ 4.2
PTPRA-208ENST00000455631 CUL7Q14999 1698 aa41.28■■■■■ 4.2
PTPRA-208ENST00000455631 IGF1RP08069 1367 aa41.22■■■■■ 4.19
PTPRA-208ENST00000455631 KIF27Q86VH2 1401 aa41.2■■■■■ 4.19
PTPRA-208ENST00000455631 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.17■■■■■ 4.18
PTPRA-208ENST00000455631 PTPRGP23470 1445 aa41.11■■■■■ 4.17
PTPRA-208ENST00000455631 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
PTPRA-208ENST00000455631 ABCC2Q92887 1545 aa41.01■■■■■ 4.16
PTPRA-208ENST00000455631 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.99■■■■■ 4.15
PTPRA-208ENST00000455631 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.98■■■■■ 4.15
PTPRA-208ENST00000455631 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.97■■■■■ 4.15
PTPRA-208ENST00000455631 ASXL2Q76L83 1435 aa40.93■■■■■ 4.14
PTPRA-208ENST00000455631 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
PTPRA-208ENST00000455631 IQGAP2Q13576 1575 aa40.91■■■■■ 4.14
PTPRA-208ENST00000455631 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.9■■■■■ 4.14
PTPRA-208ENST00000455631 GLI2P10070 1586 aa40.89■■■■■ 4.14
PTPRA-208ENST00000455631 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.83■■■■■ 4.13
PTPRA-208ENST00000455631 UACAQ9BZF9 1416 aa40.78■■■■■ 4.12
PTPRA-208ENST00000455631 ADGRL1O94910 1474 aa40.76■■■■■ 4.12
PTPRA-208ENST00000455631 DISP1Q96F81 1524 aa40.73■■■■■ 4.11
PTPRA-208ENST00000455631 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.69■■■■■ 4.1
PTPRA-208ENST00000455631 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
PTPRA-208ENST00000455631 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.66■■■■■ 4.1
PTPRA-208ENST00000455631 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
PTPRA-208ENST00000455631 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
PTPRA-208ENST00000455631 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
PTPRA-208ENST00000455631 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.61■■■■■ 4.09
PTPRA-208ENST00000455631 UGGT2Q9NYU1 1516 aa40.59■■■■■ 4.09
PTPRA-208ENST00000455631 KIAA0556O60303 1618 aa40.56■■■■■ 4.08
PTPRA-208ENST00000455631 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.53■■■■■ 4.08
PTPRA-208ENST00000455631 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.44■■■■■ 4.06
PTPRA-208ENST00000455631 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.44■■■■■ 4.06
PTPRA-208ENST00000455631 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.32■■■■■ 4.05
PTPRA-208ENST00000455631 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.27■■■■■ 4.04
PTPRA-208ENST00000455631 CD109Q6YHK3 1445 aa40.25■■■■■ 4.03
PTPRA-208ENST00000455631 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.23■■■■■ 4.03
PTPRA-208ENST00000455631 GOLGA3Q08378 1498 aa40.21■■■■■ 4.03
PTPRA-208ENST00000455631 ABCA8O94911 1581 aa40.2■■■■■ 4.03
PTPRA-208ENST00000455631 KCNH8Q96L42 1107 aa40.18■■■■■ 4.02
PTPRA-208ENST00000455631 KIF21BO75037 1637 aa40.1■■■■■ 4.01
PTPRA-208ENST00000455631 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.94■■■■□ 3.98
PTPRA-208ENST00000455631 PRXQ9BXM0 1461 aa39.93■■■■□ 3.98
PTPRA-208ENST00000455631 ARID3CA6NKF2 412 aa39.92■■■■□ 3.98
PTPRA-208ENST00000455631 ATP10BO94823 1461 aa39.84■■■■□ 3.97
PTPRA-208ENST00000455631 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
PTPRA-208ENST00000455631 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.83■■■■□ 3.97
PTPRA-208ENST00000455631 P3H3Q8IVL6 736 aa39.8■■■■□ 3.96
PTPRA-208ENST00000455631 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.76■■■■□ 3.96
PTPRA-208ENST00000455631 PTPRMP28827 1452 aa39.75■■■■□ 3.95
PTPRA-208ENST00000455631 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.74■■■■□ 3.95
PTPRA-208ENST00000455631 RAPGEF3O95398 923 aa39.68■■■■□ 3.94
PTPRA-208ENST00000455631 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa39.68■■■■□ 3.94
PTPRA-208ENST00000455631 NEO1Q92859 1461 aa39.67■■■■□ 3.94
PTPRA-208ENST00000455631 FBXO41Q8TF61 875 aa39.66■■■■□ 3.94
PTPRA-208ENST00000455631 SAMD9Q5K651 1589 aa39.66■■■■□ 3.94
PTPRA-208ENST00000455631 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.63■■■■□ 3.93
PTPRA-208ENST00000455631 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.62■■■■□ 3.93
PTPRA-208ENST00000455631 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
PTPRA-208ENST00000455631 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
PTPRA-208ENST00000455631 MADDQ8WXG6 1647 aa39.59■■■■□ 3.93
PTPRA-208ENST00000455631 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
PTPRA-208ENST00000455631 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
PTPRA-208ENST00000455631 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
PTPRA-208ENST00000455631 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.48■■■■□ 3.91
PTPRA-208ENST00000455631 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.45■■■■□ 3.91
PTPRA-208ENST00000455631 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.45■■■■□ 3.91
PTPRA-208ENST00000455631 RICTORQ6R327 1708 aa39.41■■■■□ 3.9
PTPRA-208ENST00000455631 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.41■■■■□ 3.9
PTPRA-208ENST00000455631 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
PTPRA-208ENST00000455631 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
PTPRA-208ENST00000455631 FHOD3Q2V2M9 1422 aa39.38■■■■□ 3.89
PTPRA-208ENST00000455631 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.35■■■■□ 3.89
PTPRA-208ENST00000455631 AKNAQ7Z591 1439 aa39.32■■■■□ 3.89
PTPRA-208ENST00000455631 FANCAO15360 1455 aa39.32■■■■□ 3.89
PTPRA-208ENST00000455631 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.31■■■■□ 3.88
PTPRA-208ENST00000455631 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.28■■■■□ 3.88
PTPRA-208ENST00000455631 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.25■■■■□ 3.87
PTPRA-208ENST00000455631 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.25■■■■□ 3.87
PTPRA-208ENST00000455631 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.24■■■■□ 3.87
PTPRA-208ENST00000455631 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.24■■■■□ 3.87
PTPRA-208ENST00000455631 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.23■■■■□ 3.87
PTPRA-208ENST00000455631 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.21■■■■□ 3.87
PTPRA-208ENST00000455631 HSPA2P54652 639 aa39.21■■■■□ 3.87
PTPRA-208ENST00000455631 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.2■■■■□ 3.87
PTPRA-208ENST00000455631 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.17■■■■□ 3.86
PTPRA-208ENST00000455631 EEA1Q15075 1411 aa39.15■■■■□ 3.86
PTPRA-208ENST00000455631 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.12■■■■□ 3.85
PTPRA-208ENST00000455631 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.11■■■■□ 3.85
PTPRA-208ENST00000455631 HECW1Q76N89 1606 aa39.11■■■■□ 3.85
PTPRA-208ENST00000455631 MLECQ14165 292 aa39.08■■■■□ 3.85
PTPRA-208ENST00000455631 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.08■■■■□ 3.85
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