RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 JPH4Q96JJ6 628 aa46.01■■■■■ 4.96
ODC1-204ENST00000446285 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.99■■■■■ 4.95
ODC1-204ENST00000446285 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.91■■■■■ 4.94
ODC1-204ENST00000446285 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.89■■■■■ 4.94
ODC1-204ENST00000446285 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.56■■■■■ 4.88
ODC1-204ENST00000446285 IQGAP2Q13576 1575 aa45.54■■■■■ 4.88
ODC1-204ENST00000446285 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.47■■■■■ 4.87
ODC1-204ENST00000446285 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.41■■■■■ 4.86
ODC1-204ENST00000446285 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.41■■■■■ 4.86
ODC1-204ENST00000446285 PTPRGP23470 1445 aa45.36■■■■■ 4.85
ODC1-204ENST00000446285 MAPKBP1O60336 1514 aa45.35■■■■■ 4.85
ODC1-204ENST00000446285 TNIKQ9UKE5 1360 aa45.34■■■■■ 4.85
ODC1-204ENST00000446285 KIF13AQ9H1H9 1805 aa45.3■■■■■ 4.84
ODC1-204ENST00000446285 UGGT2Q9NYU1 1516 aa45.28■■■■■ 4.84
ODC1-204ENST00000446285 DISP1Q96F81 1524 aa45.24■■■■■ 4.83
ODC1-204ENST00000446285 PRXQ9BXM0 1461 aa45.21■■■■■ 4.83
ODC1-204ENST00000446285 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.21■■■■■ 4.83
ODC1-204ENST00000446285 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.2■■■■■ 4.83
ODC1-204ENST00000446285 KIAA0556O60303 1618 aa45.12■■■■■ 4.81
ODC1-204ENST00000446285 DIP2BQ9P265 1576 aa45.1■■■■■ 4.81
ODC1-204ENST00000446285 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa45.1■■■■■ 4.81
ODC1-204ENST00000446285 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.09■■■■■ 4.81
ODC1-204ENST00000446285 ABCC2Q92887 1545 aa45.09■■■■■ 4.81
ODC1-204ENST00000446285 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.07■■■■■ 4.81
ODC1-204ENST00000446285 UACAQ9BZF9 1416 aa45.06■■■■■ 4.8
ODC1-204ENST00000446285 GOLGA3Q08378 1498 aa45■■■■■ 4.79
ODC1-204ENST00000446285 EEA1Q15075 1411 aa44.98■■■■■ 4.79
ODC1-204ENST00000446285 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.94■■■■■ 4.78
ODC1-204ENST00000446285 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.89■■■■■ 4.78
ODC1-204ENST00000446285 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.86■■■■■ 4.77
ODC1-204ENST00000446285 ASXL2Q76L83 1435 aa44.84■■■■■ 4.77
ODC1-204ENST00000446285 GLI2P10070 1586 aa44.75■■■■■ 4.75
ODC1-204ENST00000446285 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
ODC1-204ENST00000446285 TSPOAP1O95153 1857 aa44.7■■■■■ 4.75
ODC1-204ENST00000446285 ABCA8O94911 1581 aa44.67■■■■■ 4.74
ODC1-204ENST00000446285 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
ODC1-204ENST00000446285 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
ODC1-204ENST00000446285 KDM6BO15054 1643 aa44.58■■■■■ 4.73
ODC1-204ENST00000446285 SAMD9Q5K651 1589 aa44.57■■■■■ 4.73
ODC1-204ENST00000446285 KIF21BO75037 1637 aa44.53■■■■■ 4.72
ODC1-204ENST00000446285 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.53■■■■■ 4.72
ODC1-204ENST00000446285 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
ODC1-204ENST00000446285 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.48■■■■■ 4.71
ODC1-204ENST00000446285 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.47■■■■■ 4.71
ODC1-204ENST00000446285 P3H3Q8IVL6 736 aa44.43■■■■■ 4.7
ODC1-204ENST00000446285 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.7
ODC1-204ENST00000446285 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.38■■■■■ 4.69
ODC1-204ENST00000446285 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa44.29■■■■■ 4.68
ODC1-204ENST00000446285 EFCAB5A4FU69 1503 aa44.28■■■■■ 4.68
ODC1-204ENST00000446285 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.27■■■■■ 4.68
ODC1-204ENST00000446285 ATP10BO94823 1461 aa44.26■■■■■ 4.68
ODC1-204ENST00000446285 FHOD3Q2V2M9 1422 aa44.19■■■■■ 4.66
ODC1-204ENST00000446285 KCNH8Q96L42 1107 aa44.19■■■■■ 4.66
ODC1-204ENST00000446285 CD109Q6YHK3 1445 aa44.18■■■■■ 4.66
ODC1-204ENST00000446285 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.18■■■■■ 4.66
ODC1-204ENST00000446285 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.18■■■■■ 4.66
ODC1-204ENST00000446285 ARID3CA6NKF2 412 aa44.11■■■■■ 4.65
ODC1-204ENST00000446285 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
ODC1-204ENST00000446285 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.08■■■■■ 4.65
ODC1-204ENST00000446285 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.65
ODC1-204ENST00000446285 ABCA9Q8IUA7 1624 aa44■■■■■ 4.63
ODC1-204ENST00000446285 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.99■■■■■ 4.63
ODC1-204ENST00000446285 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
ODC1-204ENST00000446285 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.91■■■■■ 4.62
ODC1-204ENST00000446285 FMN1Q68DA7 1419 aa43.85■■■■■ 4.61
ODC1-204ENST00000446285 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.85■■■■■ 4.61
ODC1-204ENST00000446285 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.83■■■■■ 4.61
ODC1-204ENST00000446285 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.83■■■■■ 4.61
ODC1-204ENST00000446285 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.82■■■■■ 4.61
ODC1-204ENST00000446285 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa43.81■■■■■ 4.6
ODC1-204ENST00000446285 NEO1Q92859 1461 aa43.75■■■■■ 4.59
ODC1-204ENST00000446285 HECW1Q76N89 1606 aa43.73■■■■■ 4.59
ODC1-204ENST00000446285 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
ODC1-204ENST00000446285 ADGRL1O94910 1474 aa43.65■■■■■ 4.58
ODC1-204ENST00000446285 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.61■■■■■ 4.576e-9■■■□□ 15.7
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ODC1-204ENST00000446285 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
ODC1-204ENST00000446285 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
ODC1-204ENST00000446285 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.53■■■■■ 4.56
ODC1-204ENST00000446285 FANCAO15360 1455 aa43.47■■■■■ 4.55
ODC1-204ENST00000446285 AKNAQ7Z591 1439 aa43.43■■■■■ 4.54
ODC1-204ENST00000446285 RAPGEF3O95398 923 aa43.43■■■■■ 4.54
ODC1-204ENST00000446285 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.42■■■■■ 4.54
ODC1-204ENST00000446285 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.39■■■■■ 4.54
ODC1-204ENST00000446285 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
ODC1-204ENST00000446285 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa43.38■■■■■ 4.53
ODC1-204ENST00000446285 PLCH2O75038 1416 aa43.37■■■■■ 4.53
ODC1-204ENST00000446285 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
ODC1-204ENST00000446285 CCDC18Q5T9S5 1454 aa43.36■■■■■ 4.53
ODC1-204ENST00000446285 KIF14Q15058 1648 aa43.36■■■■■ 4.53
ODC1-204ENST00000446285 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
ODC1-204ENST00000446285 CLIP1P30622 1438 aa43.35■■■■■ 4.53
ODC1-204ENST00000446285 RICTORQ6R327 1708 aa43.34■■■■■ 4.53
ODC1-204ENST00000446285 MYO5CQ9NQX4 1742 aa43.33■■■■■ 4.53
ODC1-204ENST00000446285 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.27■■■■■ 4.52
ODC1-204ENST00000446285 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.23■■■■■ 4.51
ODC1-204ENST00000446285 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.22■■■■■ 4.51
ODC1-204ENST00000446285 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.2■■■■■ 4.51
ODC1-204ENST00000446285 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.15■■■■■ 4.5
ODC1-204ENST00000446285 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.14■■■■■ 4.5
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