RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.08■■■■■ 8.17
ODC1-204ENST00000446285 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.17■■■■■ 7.06
ODC1-204ENST00000446285 ABCC9O60706 1549 aa58.43■■■■■ 6.94
ODC1-204ENST00000446285 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.02■■■■■ 6.56
ODC1-204ENST00000446285 NACADO15069 1562 aa55.79■■■■■ 6.52
ODC1-204ENST00000446285 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.38■■■■■ 6.46
ODC1-204ENST00000446285 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.26■■■■■ 6.44
ODC1-204ENST00000446285 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.9■■■■■ 6.38
ODC1-204ENST00000446285 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.73■■■■■ 6.35
ODC1-204ENST00000446285 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.69■■■■■ 6.35
ODC1-204ENST00000446285 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.42■■■■■ 6.3
ODC1-204ENST00000446285 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.26■■■■■ 6.28
ODC1-204ENST00000446285 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.22■■■■■ 6.27
ODC1-204ENST00000446285 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.82■■■■■ 6.21
ODC1-204ENST00000446285 SCRIBQ14160 1630 aa53.79■■■■■ 6.2
ODC1-204ENST00000446285 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.93■■■■■ 6.06
ODC1-204ENST00000446285 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.88■■■■■ 6.06
ODC1-204ENST00000446285 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.65■■■■■ 6.02
ODC1-204ENST00000446285 NCAPD3P42695 1498 aa51.45■■■■■ 5.83
ODC1-204ENST00000446285 SMARCA4P51532 1647 aa51.44■■■■■ 5.83
ODC1-204ENST00000446285 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.34■■■■■ 5.81
ODC1-204ENST00000446285 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.32■■■■■ 5.81
ODC1-204ENST00000446285 SMARCA2P51531 1590 aa51.3■■■■■ 5.8
ODC1-204ENST00000446285 HMGXB3Q12766 1538 aa51.16■■■■■ 5.78
ODC1-204ENST00000446285 PEG3Q9GZU2 1588 aa51■■■■■ 5.75
ODC1-204ENST00000446285 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.89■■■■■ 5.74
ODC1-204ENST00000446285 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.85■■■■■ 5.73
ODC1-204ENST00000446285 ERCC6Q03468 1493 aa50.5■■■■■ 5.67
ODC1-204ENST00000446285 NESP48681 1621 aa50.33■■■■■ 5.65
ODC1-204ENST00000446285 CUX2O14529 1486 aa50.29■■■■■ 5.64
ODC1-204ENST00000446285 WIZO95785 1651 aa50.28■■■■■ 5.64
ODC1-204ENST00000446285 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.25■■■■■ 5.63
ODC1-204ENST00000446285 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.02■■■■■ 5.6
ODC1-204ENST00000446285 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.92■■■■■ 5.58
ODC1-204ENST00000446285 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.89■■■■■ 5.58
ODC1-204ENST00000446285 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.82■■■■■ 5.57
ODC1-204ENST00000446285 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.78■■■■■ 5.56
ODC1-204ENST00000446285 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.76■■■■■ 5.56
ODC1-204ENST00000446285 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.53■■■■■ 5.52
ODC1-204ENST00000446285 CFTRP13569 1480 aa49.45■■■■■ 5.51
ODC1-204ENST00000446285 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.42■■■■■ 5.5
ODC1-204ENST00000446285 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.34■■■■■ 5.49
ODC1-204ENST00000446285 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.31■■■■■ 5.48
ODC1-204ENST00000446285 WDR62O43379 1518 aa49.3■■■■■ 5.48
ODC1-204ENST00000446285 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.12■■■■■ 5.45
ODC1-204ENST00000446285 PRDM2Q13029 1718 aa49.09■■■■■ 5.45
ODC1-204ENST00000446285 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.83■■■■■ 5.41
ODC1-204ENST00000446285 ABCC8Q09428 1581 aa48.49■■■■■ 5.35
ODC1-204ENST00000446285 TOPBP1Q92547 1522 aa48.43■■■■■ 5.34
ODC1-204ENST00000446285 IFT140Q96RY7 1462 aa48.35■■■■■ 5.33
ODC1-204ENST00000446285 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.35■■■■■ 5.33
ODC1-204ENST00000446285 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.11■■■■■ 5.29
ODC1-204ENST00000446285 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.1■■■■■ 5.29
ODC1-204ENST00000446285 OSCARQ8IYS5 282 aa48.01■■■■■ 5.28
ODC1-204ENST00000446285 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
ODC1-204ENST00000446285 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.97■■■■■ 5.27
ODC1-204ENST00000446285 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.95■■■■■ 5.27
ODC1-204ENST00000446285 CUX1P39880 1505 aa47.76■■■■■ 5.24
ODC1-204ENST00000446285 SOGA1O94964 1423 aa47.75■■■■■ 5.23
ODC1-204ENST00000446285 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.74■■■■■ 5.23
ODC1-204ENST00000446285 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.73■■■■■ 5.231e-7■■■□□ 18.1
ODC1-204ENST00000446285 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.72■■■■■ 5.23
ODC1-204ENST00000446285 WDR97A6NE52 1622 aa47.68■■■■■ 5.22
ODC1-204ENST00000446285 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.52■■■■■ 5.2
ODC1-204ENST00000446285 TRIM41Q8WV44 630 aa47.49■■■■■ 5.19
ODC1-204ENST00000446285 CHD1O14646 1710 aa47.48■■■■■ 5.19
ODC1-204ENST00000446285 GRIN2BQ13224 1484 aa47.33■■■■■ 5.17
ODC1-204ENST00000446285 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.32■■■■■ 5.17
ODC1-204ENST00000446285 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.31■■■■■ 5.16
ODC1-204ENST00000446285 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.31■■■■■ 5.16
ODC1-204ENST00000446285 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.31■■■■■ 5.16
ODC1-204ENST00000446285 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.31■■■■■ 5.16
ODC1-204ENST00000446285 FBLN2P98095 1184 aa47.3■■■■■ 5.16
ODC1-204ENST00000446285 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.29■■■■■ 5.16
ODC1-204ENST00000446285 ARHGEF11O15085 1522 aa47.24■■■■■ 5.15
ODC1-204ENST00000446285 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.23■■■■■ 5.15
ODC1-204ENST00000446285 TOP2BQ02880 1626 aa47.22■■■■■ 5.15
ODC1-204ENST00000446285 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.22■■■■■ 5.15
ODC1-204ENST00000446285 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.21■■■■■ 5.15
ODC1-204ENST00000446285 PBRM1Q86U86 1689 aa47.18■■■■■ 5.14
ODC1-204ENST00000446285 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.16■■■■■ 5.14
ODC1-204ENST00000446285 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.11■■■■■ 5.13
ODC1-204ENST00000446285 SYNJ1O43426 1573 aa47.11■■■■■ 5.13
ODC1-204ENST00000446285 SYNJ2O15056 1496 aa47.1■■■■■ 5.13
ODC1-204ENST00000446285 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.97■■■■■ 5.11
ODC1-204ENST00000446285 ARAP1Q96P48 1450 aa46.78■■■■■ 5.08
ODC1-204ENST00000446285 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.77■■■■■ 5.08
ODC1-204ENST00000446285 ADAMTS12P58397 1594 aa46.76■■■■■ 5.08
ODC1-204ENST00000446285 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.74■■■■■ 5.07
ODC1-204ENST00000446285 GRIN2AQ12879 1464 aa46.7■■■■■ 5.07
ODC1-204ENST00000446285 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.66■■■■■ 5.06
ODC1-204ENST00000446285 NUP160Q12769 1436 aa46.54■■■■■ 5.04
ODC1-204ENST00000446285 CEP170Q5SW79 1584 aa46.47■■■■■ 5.03
ODC1-204ENST00000446285 KIF27Q86VH2 1401 aa46.32■■■■■ 5.01
ODC1-204ENST00000446285 SHROOM2Q13796 1616 aa46.28■■■■■ 5
ODC1-204ENST00000446285 CUL7Q14999 1698 aa46.18■■■■■ 4.98
ODC1-204ENST00000446285 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.17■■■■■ 4.98
ODC1-204ENST00000446285 IGF1RP08069 1367 aa46.16■■■■■ 4.98
ODC1-204ENST00000446285 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.08■■■■■ 4.97
ODC1-204ENST00000446285 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.08■■■■■ 4.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms