RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.48■■□□□ 1.83
ACTB-206ENST00000443528 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTB-206ENST00000443528 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTB-206ENST00000443528 JPH4Q96JJ6 628 aa26.46■■□□□ 1.83
ACTB-206ENST00000443528 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
ACTB-206ENST00000443528 PRXQ9BXM0 1461 aa26.4■■□□□ 1.82
ACTB-206ENST00000443528 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.37■■□□□ 1.81
ACTB-206ENST00000443528 EEA1Q15075 1411 aa26.36■■□□□ 1.81
ACTB-206ENST00000443528 IQGAP2Q13576 1575 aa26.29■■□□□ 1.8
ACTB-206ENST00000443528 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
ACTB-206ENST00000443528 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.18■■□□□ 1.78
ACTB-206ENST00000443528 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-206ENST00000443528 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.15■■□□□ 1.78
ACTB-206ENST00000443528 DISP1Q96F81 1524 aa26.15■■□□□ 1.78
ACTB-206ENST00000443528 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTB-206ENST00000443528 KIF21BO75037 1637 aa26.09■■□□□ 1.77
ACTB-206ENST00000443528 PTPRGP23470 1445 aa26.08■■□□□ 1.77
ACTB-206ENST00000443528 KIAA0556O60303 1618 aa26.05■■□□□ 1.76
ACTB-206ENST00000443528 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
ACTB-206ENST00000443528 ADCY10Q96PN6 1610 aa26■■□□□ 1.75
ACTB-206ENST00000443528 GOLGA3Q08378 1498 aa25.99■■□□□ 1.75
ACTB-206ENST00000443528 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
ACTB-206ENST00000443528 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.95■■□□□ 1.74
ACTB-206ENST00000443528 UACAQ9BZF9 1416 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-206ENST00000443528 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
ACTB-206ENST00000443528 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.89■■□□□ 1.73
ACTB-206ENST00000443528 SAMD9Q5K651 1589 aa25.88■■□□□ 1.73
ACTB-206ENST00000443528 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
ACTB-206ENST00000443528 P3H3Q8IVL6 736 aa25.88■■□□□ 1.73
ACTB-206ENST00000443528 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
ACTB-206ENST00000443528 ABCC2Q92887 1545 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTB-206ENST00000443528 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.83■■□□□ 1.73
ACTB-206ENST00000443528 MAPKBP1O60336 1514 aa25.83■■□□□ 1.72
ACTB-206ENST00000443528 ABCA8O94911 1581 aa25.78■■□□□ 1.72
ACTB-206ENST00000443528 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.77■■□□□ 1.72
ACTB-206ENST00000443528 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.75■■□□□ 1.71
ACTB-206ENST00000443528 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.74■■□□□ 1.71
ACTB-206ENST00000443528 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.72■■□□□ 1.71
ACTB-206ENST00000443528 ASXL2Q76L83 1435 aa25.7■■□□□ 1.7
ACTB-206ENST00000443528 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
ACTB-206ENST00000443528 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.68■■□□□ 1.7
ACTB-206ENST00000443528 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.67■■□□□ 1.7
ACTB-206ENST00000443528 DIP2BQ9P265 1576 aa25.67■■□□□ 1.7
ACTB-206ENST00000443528 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.66■■□□□ 1.7
ACTB-206ENST00000443528 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.63■■□□□ 1.69
ACTB-206ENST00000443528 ATP10BO94823 1461 aa25.6■■□□□ 1.69
ACTB-206ENST00000443528 ARID3CA6NKF2 412 aa25.58■■□□□ 1.69
ACTB-206ENST00000443528 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
ACTB-206ENST00000443528 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.55■■□□□ 1.68
ACTB-206ENST00000443528 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
ACTB-206ENST00000443528 GLI2P10070 1586 aa25.52■■□□□ 1.68
ACTB-206ENST00000443528 FMN1Q68DA7 1419 aa25.52■■□□□ 1.68
ACTB-206ENST00000443528 CLIP1P30622 1438 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-206ENST00000443528 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.48■■□□□ 1.67
ACTB-206ENST00000443528 KCNH8Q96L42 1107 aa25.45■■□□□ 1.66
ACTB-206ENST00000443528 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ACTB-206ENST00000443528 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
ACTB-206ENST00000443528 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.41■■□□□ 1.66
ACTB-206ENST00000443528 TSPOAP1O95153 1857 aa25.4■■□□□ 1.66
ACTB-206ENST00000443528 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ACTB-206ENST00000443528 HECW1Q76N89 1606 aa25.38■■□□□ 1.65
ACTB-206ENST00000443528 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
ACTB-206ENST00000443528 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ACTB-206ENST00000443528 CEP162Q5TB80 1403 aa25.37■■□□□ 1.65
ACTB-206ENST00000443528 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.34■■□□□ 1.65
ACTB-206ENST00000443528 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.34■■□□□ 1.65
ACTB-206ENST00000443528 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
ACTB-206ENST00000443528 CD109Q6YHK3 1445 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTB-206ENST00000443528 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.31■■□□□ 1.64
ACTB-206ENST00000443528 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.28■■□□□ 1.64
ACTB-206ENST00000443528 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.28■■□□□ 1.64
ACTB-206ENST00000443528 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTB-206ENST00000443528 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTB-206ENST00000443528 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTB-206ENST00000443528 KDM6BO15054 1643 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTB-206ENST00000443528 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
ACTB-206ENST00000443528 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.21■■□□□ 1.63
ACTB-206ENST00000443528 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ACTB-206ENST00000443528 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.622e-34■■■■□ 20.9
ACTB-206ENST00000443528 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ACTB-206ENST00000443528 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.14■■□□□ 1.62
ACTB-206ENST00000443528 KIF14Q15058 1648 aa25.11■■□□□ 1.61
ACTB-206ENST00000443528 NEO1Q92859 1461 aa25.08■■□□□ 1.6
ACTB-206ENST00000443528 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.07■■□□□ 1.6
ACTB-206ENST00000443528 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-206ENST00000443528 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.06■■□□□ 1.6
ACTB-206ENST00000443528 PLCH2O75038 1416 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTB-206ENST00000443528 FANCAO15360 1455 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-206ENST00000443528 AKNAQ7Z591 1439 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTB-206ENST00000443528 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-206ENST00000443528 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-206ENST00000443528 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-206ENST00000443528 RAPGEF3O95398 923 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTB-206ENST00000443528 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-206ENST00000443528 TIAM1Q13009 1591 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-206ENST00000443528 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-206ENST00000443528 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-206ENST00000443528 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ACTB-206ENST00000443528 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTB-206ENST00000443528 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.89■■□□□ 1.57
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