RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441099.5

TRAPPC12-209, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC12, Length 698 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12-209ENST00000441099 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC12-209ENST00000441099 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC12-209ENST00000441099 SHROOM2Q13796 1616 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC12-209ENST00000441099 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC12-209ENST00000441099 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC12-209ENST00000441099 PRXQ9BXM0 1461 aa26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC12-209ENST00000441099 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC12-209ENST00000441099 EEA1Q15075 1411 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC12-209ENST00000441099 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC12-209ENST00000441099 IQGAP2Q13576 1575 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC12-209ENST00000441099 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC12-209ENST00000441099 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC12-209ENST00000441099 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC12-209ENST00000441099 PTPRGP23470 1445 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC12-209ENST00000441099 DISP1Q96F81 1524 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC12-209ENST00000441099 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
TRAPPC12-209ENST00000441099 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
TRAPPC12-209ENST00000441099 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC12-209ENST00000441099 KIAA0556O60303 1618 aa26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC12-209ENST00000441099 GOLGA3Q08378 1498 aa26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC12-209ENST00000441099 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC12-209ENST00000441099 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC12-209ENST00000441099 KIF21BO75037 1637 aa26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC12-209ENST00000441099 UACAQ9BZF9 1416 aa26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC12-209ENST00000441099 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC12-209ENST00000441099 P3H3Q8IVL6 736 aa26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC12-209ENST00000441099 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC12-209ENST00000441099 ABCC2Q92887 1545 aa26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC12-209ENST00000441099 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC12-209ENST00000441099 MAPKBP1O60336 1514 aa26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC12-209ENST00000441099 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC12-209ENST00000441099 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC12-209ENST00000441099 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC12-209ENST00000441099 SAMD9Q5K651 1589 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC12-209ENST00000441099 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC12-209ENST00000441099 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC12-209ENST00000441099 ABCA8O94911 1581 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC12-209ENST00000441099 ASXL2Q76L83 1435 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC12-209ENST00000441099 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC12-209ENST00000441099 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC12-209ENST00000441099 DIP2BQ9P265 1576 aa26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC12-209ENST00000441099 ARID3CA6NKF2 412 aa26■■□□□ 1.75
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC12-209ENST00000441099 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC12-209ENST00000441099 ATP10BO94823 1461 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC12-209ENST00000441099 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC12-209ENST00000441099 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC12-209ENST00000441099 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC12-209ENST00000441099 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TRAPPC12-209ENST00000441099 GLI2P10070 1586 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC12-209ENST00000441099 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.92■■□□□ 1.74
TRAPPC12-209ENST00000441099 KCNH8Q96L42 1107 aa25.89■■□□□ 1.74
TRAPPC12-209ENST00000441099 FMN1Q68DA7 1419 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC12-209ENST00000441099 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC12-209ENST00000441099 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TRAPPC12-209ENST00000441099 CLIP1P30622 1438 aa25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC12-209ENST00000441099 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC12-209ENST00000441099 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC12-209ENST00000441099 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC12-209ENST00000441099 CD109Q6YHK3 1445 aa25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC12-209ENST00000441099 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC12-209ENST00000441099 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC12-209ENST00000441099 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC12-209ENST00000441099 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC12-209ENST00000441099 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC12-209ENST00000441099 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC12-209ENST00000441099 CEP162Q5TB80 1403 aa25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC12-209ENST00000441099 HECW1Q76N89 1606 aa25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC12-209ENST00000441099 TSPOAP1O95153 1857 aa25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC12-209ENST00000441099 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC12-209ENST00000441099 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC12-209ENST00000441099 KDM6BO15054 1643 aa25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC12-209ENST00000441099 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.61■■□□□ 1.69
TRAPPC12-209ENST00000441099 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.6■■□□□ 1.69
TRAPPC12-209ENST00000441099 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC12-209ENST00000441099 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.57■■□□□ 1.68
TRAPPC12-209ENST00000441099 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
TRAPPC12-209ENST00000441099 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC12-209ENST00000441099 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC12-209ENST00000441099 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC12-209ENST00000441099 NEO1Q92859 1461 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC12-209ENST00000441099 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC12-209ENST00000441099 PLCH2O75038 1416 aa25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC12-209ENST00000441099 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.44■■□□□ 1.66
TRAPPC12-209ENST00000441099 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC12-209ENST00000441099 FANCAO15360 1455 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC12-209ENST00000441099 RAPGEF3O95398 923 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC12-209ENST00000441099 AKNAQ7Z591 1439 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC12-209ENST00000441099 KIF14Q15058 1648 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC12-209ENST00000441099 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC12-209ENST00000441099 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC12-209ENST00000441099 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12-209ENST00000441099 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12-209ENST00000441099 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC12-209ENST00000441099 ADGRL1O94910 1474 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC12-209ENST00000441099 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC12-209ENST00000441099 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC12-209ENST00000441099 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC12-209ENST00000441099 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC12-209ENST00000441099 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
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