RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 JPH4Q96JJ6 628 aa30.2■■■□□ 2.43
PTX4-202ENST00000440447 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.19■■■□□ 2.42
PTX4-202ENST00000440447 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.19■■■□□ 2.42
PTX4-202ENST00000440447 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.19■■■□□ 2.42
PTX4-202ENST00000440447 SHROOM2Q13796 1616 aa30.13■■■□□ 2.41
PTX4-202ENST00000440447 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
PTX4-202ENST00000440447 IQGAP2Q13576 1575 aa30.08■■■□□ 2.41
PTX4-202ENST00000440447 KIF21BO75037 1637 aa30.07■■■□□ 2.4
PTX4-202ENST00000440447 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.03■■■□□ 2.4
PTX4-202ENST00000440447 ARAP1Q96P48 1450 aa30.02■■■□□ 2.4
PTX4-202ENST00000440447 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.02■■■□□ 2.4
PTX4-202ENST00000440447 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.99■■■□□ 2.39
PTX4-202ENST00000440447 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.99■■■□□ 2.39
PTX4-202ENST00000440447 GOLGA3Q08378 1498 aa29.96■■■□□ 2.39
PTX4-202ENST00000440447 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.95■■■□□ 2.38
PTX4-202ENST00000440447 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.93■■■□□ 2.38
PTX4-202ENST00000440447 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
PTX4-202ENST00000440447 DISP1Q96F81 1524 aa29.86■■■□□ 2.37
PTX4-202ENST00000440447 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.82■■■□□ 2.36
PTX4-202ENST00000440447 PTPRGP23470 1445 aa29.79■■■□□ 2.36
PTX4-202ENST00000440447 KIAA0556O60303 1618 aa29.78■■■□□ 2.36
PTX4-202ENST00000440447 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
PTX4-202ENST00000440447 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
PTX4-202ENST00000440447 P3H3Q8IVL6 736 aa29.7■■■□□ 2.35
PTX4-202ENST00000440447 SAMD9Q5K651 1589 aa29.65■■■□□ 2.34
PTX4-202ENST00000440447 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.61■■■□□ 2.33
PTX4-202ENST00000440447 UACAQ9BZF9 1416 aa29.58■■■□□ 2.33
PTX4-202ENST00000440447 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.57■■■□□ 2.32
PTX4-202ENST00000440447 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.32
PTX4-202ENST00000440447 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.54■■■□□ 2.32
PTX4-202ENST00000440447 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.53■■■□□ 2.32
PTX4-202ENST00000440447 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.51■■■□□ 2.31
PTX4-202ENST00000440447 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.5■■■□□ 2.31
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PTX4-202ENST00000440447 ABCC2Q92887 1545 aa29.49■■■□□ 2.31
PTX4-202ENST00000440447 CLIP1P30622 1438 aa29.45■■■□□ 2.3
PTX4-202ENST00000440447 ABCA8O94911 1581 aa29.44■■■□□ 2.3
PTX4-202ENST00000440447 CEP162Q5TB80 1403 aa29.37■■■□□ 2.29
PTX4-202ENST00000440447 FMN1Q68DA7 1419 aa29.37■■■□□ 2.29
PTX4-202ENST00000440447 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.36■■■□□ 2.29
PTX4-202ENST00000440447 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
PTX4-202ENST00000440447 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.34■■■□□ 2.29
PTX4-202ENST00000440447 MAPKBP1O60336 1514 aa29.32■■■□□ 2.28
PTX4-202ENST00000440447 ARID3CA6NKF2 412 aa29.28■■■□□ 2.28
PTX4-202ENST00000440447 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
PTX4-202ENST00000440447 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
PTX4-202ENST00000440447 ASXL2Q76L83 1435 aa29.25■■■□□ 2.27
PTX4-202ENST00000440447 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
PTX4-202ENST00000440447 ATP10BO94823 1461 aa29.23■■■□□ 2.27
PTX4-202ENST00000440447 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
PTX4-202ENST00000440447 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
PTX4-202ENST00000440447 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.17■■■□□ 2.26
PTX4-202ENST00000440447 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.16■■■□□ 2.26
PTX4-202ENST00000440447 HECW1Q76N89 1606 aa29.16■■■□□ 2.26
PTX4-202ENST00000440447 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.15■■■□□ 2.26
PTX4-202ENST00000440447 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.13■■■□□ 2.25
PTX4-202ENST00000440447 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
PTX4-202ENST00000440447 DIP2BQ9P265 1576 aa29.09■■■□□ 2.25
PTX4-202ENST00000440447 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.09■■■□□ 2.25
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PTX4-202ENST00000440447 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PTX4-202ENST00000440447 KCNH8Q96L42 1107 aa29.07■■■□□ 2.24
PTX4-202ENST00000440447 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
PTX4-202ENST00000440447 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.03■■■□□ 2.24
PTX4-202ENST00000440447 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.01■■■□□ 2.23
PTX4-202ENST00000440447 GLI2P10070 1586 aa29.01■■■□□ 2.23
PTX4-202ENST00000440447 VPS8Q8N3P4 1428 aa29■■■□□ 2.23
PTX4-202ENST00000440447 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.92■■■□□ 2.22
PTX4-202ENST00000440447 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
PTX4-202ENST00000440447 CD109Q6YHK3 1445 aa28.86■■■□□ 2.21
PTX4-202ENST00000440447 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.85■■■□□ 2.21
PTX4-202ENST00000440447 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.83■■■□□ 2.21
PTX4-202ENST00000440447 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.82■■■□□ 2.2
PTX4-202ENST00000440447 TSPOAP1O95153 1857 aa28.81■■■□□ 2.2
PTX4-202ENST00000440447 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.78■■■□□ 2.2
PTX4-202ENST00000440447 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.78■■■□□ 2.2
PTX4-202ENST00000440447 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.77■■■□□ 2.2
PTX4-202ENST00000440447 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.2
PTX4-202ENST00000440447 KIF14Q15058 1648 aa28.76■■■□□ 2.19
PTX4-202ENST00000440447 APLP2Q06481 763 aa28.75■■■□□ 2.19
PTX4-202ENST00000440447 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
PTX4-202ENST00000440447 TIAM1Q13009 1591 aa28.72■■■□□ 2.19
PTX4-202ENST00000440447 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.71■■■□□ 2.19
PTX4-202ENST00000440447 MAP3K1Q13233 1512 aa28.69■■■□□ 2.18
PTX4-202ENST00000440447 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.68■■■□□ 2.18
PTX4-202ENST00000440447 PLCH2O75038 1416 aa28.64■■■□□ 2.18
PTX4-202ENST00000440447 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.62■■■□□ 2.17
PTX4-202ENST00000440447 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.62■■■□□ 2.17
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PTX4-202ENST00000440447 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
PTX4-202ENST00000440447 FANCAO15360 1455 aa28.59■■■□□ 2.17
PTX4-202ENST00000440447 KDM6BO15054 1643 aa28.58■■■□□ 2.17
PTX4-202ENST00000440447 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.58■■■□□ 2.17
PTX4-202ENST00000440447 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.57■■■□□ 2.16
PTX4-202ENST00000440447 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.56■■■□□ 2.16
PTX4-202ENST00000440447 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.56■■■□□ 2.16
PTX4-202ENST00000440447 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.53■■■□□ 2.16
PTX4-202ENST00000440447 AKNAQ7Z591 1439 aa28.53■■■□□ 2.16
PTX4-202ENST00000440447 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.53■■■□□ 2.16
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