RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
PRAME-209ENST00000439106 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.78■■□□□ 1.4
PRAME-209ENST00000439106 JPH4Q96JJ6 628 aa23.77■■□□□ 1.4
PRAME-209ENST00000439106 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.75■■□□□ 1.39
PRAME-209ENST00000439106 IQGAP2Q13576 1575 aa23.66■■□□□ 1.38
PRAME-209ENST00000439106 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.63■■□□□ 1.37
PRAME-209ENST00000439106 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.6■■□□□ 1.37
PRAME-209ENST00000439106 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.6■■□□□ 1.37
PRAME-209ENST00000439106 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.59■■□□□ 1.37
PRAME-209ENST00000439106 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PRAME-209ENST00000439106 DISP1Q96F81 1524 aa23.49■■□□□ 1.35
PRAME-209ENST00000439106 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.48■■□□□ 1.35
PRAME-209ENST00000439106 PRXQ9BXM0 1461 aa23.47■■□□□ 1.35
PRAME-209ENST00000439106 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.47■■□□□ 1.35
PRAME-209ENST00000439106 KIAA0556O60303 1618 aa23.47■■□□□ 1.35
PRAME-209ENST00000439106 PTPRGP23470 1445 aa23.45■■□□□ 1.34
PRAME-209ENST00000439106 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.44■■□□□ 1.34
PRAME-209ENST00000439106 MAPKBP1O60336 1514 aa23.43■■□□□ 1.34
PRAME-209ENST00000439106 DIP2BQ9P265 1576 aa23.39■■□□□ 1.33
PRAME-209ENST00000439106 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
PRAME-209ENST00000439106 TSPOAP1O95153 1857 aa23.35■■□□□ 1.33
PRAME-209ENST00000439106 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.34■■□□□ 1.33
PRAME-209ENST00000439106 ABCC2Q92887 1545 aa23.33■■□□□ 1.32
PRAME-209ENST00000439106 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.32■■□□□ 1.32
PRAME-209ENST00000439106 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
PRAME-209ENST00000439106 UACAQ9BZF9 1416 aa23.3■■□□□ 1.32
PRAME-209ENST00000439106 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.29■■□□□ 1.32
PRAME-209ENST00000439106 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.28■■□□□ 1.32
PRAME-209ENST00000439106 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PRAME-209ENST00000439106 EEA1Q15075 1411 aa23.27■■□□□ 1.32
PRAME-209ENST00000439106 GOLGA3Q08378 1498 aa23.26■■□□□ 1.31
PRAME-209ENST00000439106 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.23■■□□□ 1.31
PRAME-209ENST00000439106 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.23■■□□□ 1.31
PRAME-209ENST00000439106 ASXL2Q76L83 1435 aa23.22■■□□□ 1.31
PRAME-209ENST00000439106 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.21■■□□□ 1.31
PRAME-209ENST00000439106 KIF21BO75037 1637 aa23.2■■□□□ 1.3
PRAME-209ENST00000439106 ABCA8O94911 1581 aa23.19■■□□□ 1.3
PRAME-209ENST00000439106 SAMD9Q5K651 1589 aa23.19■■□□□ 1.3
PRAME-209ENST00000439106 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PRAME-209ENST00000439106 P3H3Q8IVL6 736 aa23.16■■□□□ 1.3
PRAME-209ENST00000439106 GLI2P10070 1586 aa23.12■■□□□ 1.29
PRAME-209ENST00000439106 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PRAME-209ENST00000439106 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.1■■□□□ 1.29
PRAME-209ENST00000439106 KDM6BO15054 1643 aa23.1■■□□□ 1.29
PRAME-209ENST00000439106 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PRAME-209ENST00000439106 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.08■■□□□ 1.29
PRAME-209ENST00000439106 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.05■■□□□ 1.28
PRAME-209ENST00000439106 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.05■■□□□ 1.28
PRAME-209ENST00000439106 ARID3CA6NKF2 412 aa23.04■■□□□ 1.28
PRAME-209ENST00000439106 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.04■■□□□ 1.28
PRAME-209ENST00000439106 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.97■■□□□ 1.27
PRAME-209ENST00000439106 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.97■■□□□ 1.27
PRAME-209ENST00000439106 ATP10BO94823 1461 aa22.95■■□□□ 1.26
PRAME-209ENST00000439106 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PRAME-209ENST00000439106 KCNH8Q96L42 1107 aa22.92■■□□□ 1.26
PRAME-209ENST00000439106 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PRAME-209ENST00000439106 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.88■■□□□ 1.25
PRAME-209ENST00000439106 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PRAME-209ENST00000439106 CD109Q6YHK3 1445 aa22.84■■□□□ 1.25
PRAME-209ENST00000439106 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.84■■□□□ 1.25
PRAME-209ENST00000439106 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.83■■□□□ 1.25
PRAME-209ENST00000439106 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PRAME-209ENST00000439106 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PRAME-209ENST00000439106 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.81■■□□□ 1.24
PRAME-209ENST00000439106 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PRAME-209ENST00000439106 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PRAME-209ENST00000439106 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.78■■□□□ 1.24
PRAME-209ENST00000439106 HECW1Q76N89 1606 aa22.75■■□□□ 1.23
PRAME-209ENST00000439106 FMN1Q68DA7 1419 aa22.7■■□□□ 1.22
PRAME-209ENST00000439106 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.7■■□□□ 1.22
PRAME-209ENST00000439106 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PRAME-209ENST00000439106 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PRAME-209ENST00000439106 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.227e-13■□□□□ 11.3
PRAME-209ENST00000439106 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.65■■□□□ 1.22
PRAME-209ENST00000439106 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.63■■□□□ 1.21
PRAME-209ENST00000439106 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.62■■□□□ 1.21
PRAME-209ENST00000439106 KIF14Q15058 1648 aa22.6■■□□□ 1.21
PRAME-209ENST00000439106 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.59■■□□□ 1.21
PRAME-209ENST00000439106 ADGRL1O94910 1474 aa22.59■■□□□ 1.21
PRAME-209ENST00000439106 NEO1Q92859 1461 aa22.58■■□□□ 1.2
PRAME-209ENST00000439106 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.57■■□□□ 1.2
PRAME-209ENST00000439106 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.56■■□□□ 1.2
PRAME-209ENST00000439106 CLIP1P30622 1438 aa22.56■■□□□ 1.2
PRAME-209ENST00000439106 RICTORQ6R327 1708 aa22.55■■□□□ 1.2
PRAME-209ENST00000439106 FANCAO15360 1455 aa22.53■■□□□ 1.2
PRAME-209ENST00000439106 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.52■■□□□ 1.2
PRAME-209ENST00000439106 RAPGEF3O95398 923 aa22.52■■□□□ 1.2
PRAME-209ENST00000439106 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.5■■□□□ 1.19
PRAME-209ENST00000439106 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PRAME-209ENST00000439106 AKNAQ7Z591 1439 aa22.48■■□□□ 1.19
PRAME-209ENST00000439106 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.47■■□□□ 1.19
PRAME-209ENST00000439106 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.47■■□□□ 1.19
PRAME-209ENST00000439106 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.45■■□□□ 1.19
PRAME-209ENST00000439106 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PRAME-209ENST00000439106 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PRAME-209ENST00000439106 PLCH2O75038 1416 aa22.43■■□□□ 1.18
PRAME-209ENST00000439106 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.41■■□□□ 1.18
PRAME-209ENST00000439106 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.41■■□□□ 1.18
PRAME-209ENST00000439106 CEP162Q5TB80 1403 aa22.4■■□□□ 1.18
PRAME-209ENST00000439106 PREX2Q70Z35 1606 aa22.4■■□□□ 1.18
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