RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.29■■■■□ 3.08
PRAME-209ENST00000439106 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.68■■■□□ 2.5
PRAME-209ENST00000439106 ABCC9O60706 1549 aa30.32■■■□□ 2.44
PRAME-209ENST00000439106 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.98■■■□□ 2.23
PRAME-209ENST00000439106 NACADO15069 1562 aa28.83■■■□□ 2.21
PRAME-209ENST00000439106 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.77■■■□□ 2.2
PRAME-209ENST00000439106 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.55■■■□□ 2.16
PRAME-209ENST00000439106 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
PRAME-209ENST00000439106 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.48■■■□□ 2.15
PRAME-209ENST00000439106 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.28■■■□□ 2.12
PRAME-209ENST00000439106 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.11
PRAME-209ENST00000439106 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.18■■■□□ 2.1
PRAME-209ENST00000439106 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.07■■■□□ 2.08
PRAME-209ENST00000439106 SCRIBQ14160 1630 aa28.04■■■□□ 2.08
PRAME-209ENST00000439106 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.67■■■□□ 2.02
PRAME-209ENST00000439106 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.44■■□□□ 1.98
PRAME-209ENST00000439106 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
PRAME-209ENST00000439106 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.22■■□□□ 1.95
PRAME-209ENST00000439106 SMARCA4P51532 1647 aa26.74■■□□□ 1.87
PRAME-209ENST00000439106 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PRAME-209ENST00000439106 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.59■■□□□ 1.85
PRAME-209ENST00000439106 NCAPD3P42695 1498 aa26.56■■□□□ 1.84
PRAME-209ENST00000439106 SMARCA2P51531 1590 aa26.54■■□□□ 1.84
PRAME-209ENST00000439106 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.48■■□□□ 1.83
PRAME-209ENST00000439106 HMGXB3Q12766 1538 aa26.48■■□□□ 1.83
PRAME-209ENST00000439106 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.41■■□□□ 1.82
PRAME-209ENST00000439106 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PRAME-209ENST00000439106 WIZO95785 1651 aa26.25■■□□□ 1.79
PRAME-209ENST00000439106 NESP48681 1621 aa26.18■■□□□ 1.78
PRAME-209ENST00000439106 ERCC6Q03468 1493 aa26.11■■□□□ 1.77
PRAME-209ENST00000439106 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PRAME-209ENST00000439106 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.99■■□□□ 1.75
PRAME-209ENST00000439106 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.95■■□□□ 1.74
PRAME-209ENST00000439106 CUX2O14529 1486 aa25.89■■□□□ 1.73
PRAME-209ENST00000439106 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PRAME-209ENST00000439106 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PRAME-209ENST00000439106 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.78■■□□□ 1.72
PRAME-209ENST00000439106 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.74■■□□□ 1.71
PRAME-209ENST00000439106 PRDM2Q13029 1718 aa25.59■■□□□ 1.69
PRAME-209ENST00000439106 CFTRP13569 1480 aa25.59■■□□□ 1.69
PRAME-209ENST00000439106 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.57■■□□□ 1.68
PRAME-209ENST00000439106 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.55■■□□□ 1.68
PRAME-209ENST00000439106 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.54■■□□□ 1.68
PRAME-209ENST00000439106 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.53■■□□□ 1.68
PRAME-209ENST00000439106 WDR62O43379 1518 aa25.52■■□□□ 1.68
PRAME-209ENST00000439106 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.41■■□□□ 1.66
PRAME-209ENST00000439106 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PRAME-209ENST00000439106 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PRAME-209ENST00000439106 TOPBP1Q92547 1522 aa25.13■■□□□ 1.61
PRAME-209ENST00000439106 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.08■■□□□ 1.61
PRAME-209ENST00000439106 ABCC8Q09428 1581 aa24.99■■□□□ 1.59
PRAME-209ENST00000439106 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PRAME-209ENST00000439106 IFT140Q96RY7 1462 aa24.98■■□□□ 1.59
PRAME-209ENST00000439106 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PRAME-209ENST00000439106 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PRAME-209ENST00000439106 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PRAME-209ENST00000439106 CUX1P39880 1505 aa24.86■■□□□ 1.57
PRAME-209ENST00000439106 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.82■■□□□ 1.56
PRAME-209ENST00000439106 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.81■■□□□ 1.56
PRAME-209ENST00000439106 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.562e-41■■■■■ 46.3
PRAME-209ENST00000439106 CHD1O14646 1710 aa24.75■■□□□ 1.55
PRAME-209ENST00000439106 SOGA1O94964 1423 aa24.73■■□□□ 1.55
PRAME-209ENST00000439106 WDR97A6NE52 1622 aa24.72■■□□□ 1.55
PRAME-209ENST00000439106 OSCARQ8IYS5 282 aa24.7■■□□□ 1.54
PRAME-209ENST00000439106 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PRAME-209ENST00000439106 PBRM1Q86U86 1689 aa24.6■■□□□ 1.53
PRAME-209ENST00000439106 SYNJ1O43426 1573 aa24.59■■□□□ 1.53
PRAME-209ENST00000439106 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.59■■□□□ 1.53
PRAME-209ENST00000439106 TRIM41Q8WV44 630 aa24.56■■□□□ 1.52
PRAME-209ENST00000439106 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.56■■□□□ 1.52
PRAME-209ENST00000439106 TOP2BQ02880 1626 aa24.55■■□□□ 1.52
PRAME-209ENST00000439106 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.54■■□□□ 1.52
PRAME-209ENST00000439106 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.54■■□□□ 1.52
PRAME-209ENST00000439106 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.54■■□□□ 1.52
PRAME-209ENST00000439106 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.52■■□□□ 1.52
PRAME-209ENST00000439106 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
PRAME-209ENST00000439106 FBLN2P98095 1184 aa24.51■■□□□ 1.51
PRAME-209ENST00000439106 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.5■■□□□ 1.51
PRAME-209ENST00000439106 GRIN2BQ13224 1484 aa24.48■■□□□ 1.51
PRAME-209ENST00000439106 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.46■■□□□ 1.51
PRAME-209ENST00000439106 ARHGEF11O15085 1522 aa24.45■■□□□ 1.5
PRAME-209ENST00000439106 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
PRAME-209ENST00000439106 SYNJ2O15056 1496 aa24.37■■□□□ 1.49
PRAME-209ENST00000439106 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.34■■□□□ 1.49
PRAME-209ENST00000439106 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
PRAME-209ENST00000439106 ADAMTS12P58397 1594 aa24.31■■□□□ 1.48
PRAME-209ENST00000439106 ARAP1Q96P48 1450 aa24.23■■□□□ 1.47
PRAME-209ENST00000439106 GRIN2AQ12879 1464 aa24.2■■□□□ 1.47
PRAME-209ENST00000439106 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.2■■□□□ 1.46
PRAME-209ENST00000439106 CEP170Q5SW79 1584 aa24.17■■□□□ 1.46
PRAME-209ENST00000439106 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.17■■□□□ 1.46
PRAME-209ENST00000439106 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.13■■□□□ 1.45
PRAME-209ENST00000439106 NUP160Q12769 1436 aa24.08■■□□□ 1.44
PRAME-209ENST00000439106 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.07■■□□□ 1.44
PRAME-209ENST00000439106 SHROOM2Q13796 1616 aa24.01■■□□□ 1.43
PRAME-209ENST00000439106 KIF27Q86VH2 1401 aa23.99■■□□□ 1.43
PRAME-209ENST00000439106 CUL7Q14999 1698 aa23.99■■□□□ 1.43
PRAME-209ENST00000439106 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.96■■□□□ 1.43
PRAME-209ENST00000439106 IGF1RP08069 1367 aa23.92■■□□□ 1.42
PRAME-209ENST00000439106 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
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