RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
CNGA3-205ENST00000436404 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.73■■□□□ 1.71
CNGA3-205ENST00000436404 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.72■■□□□ 1.71
CNGA3-205ENST00000436404 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.69■■□□□ 1.7
CNGA3-205ENST00000436404 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CNGA3-205ENST00000436404 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CNGA3-205ENST00000436404 SYNJ2O15056 1496 aa25.58■■□□□ 1.69
CNGA3-205ENST00000436404 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.57■■□□□ 1.68
CNGA3-205ENST00000436404 CEP162Q5TB80 1403 aa25.57■■□□□ 1.68
CNGA3-205ENST00000436404 GRIN2AQ12879 1464 aa25.54■■□□□ 1.68
CNGA3-205ENST00000436404 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CNGA3-205ENST00000436404 CHD1O14646 1710 aa25.48■■□□□ 1.67
CNGA3-205ENST00000436404 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CNGA3-205ENST00000436404 CEP170Q5SW79 1584 aa25.44■■□□□ 1.66
CNGA3-205ENST00000436404 CLIP1P30622 1438 aa25.43■■□□□ 1.66
CNGA3-205ENST00000436404 FBLN2P98095 1184 aa25.4■■□□□ 1.66
CNGA3-205ENST00000436404 NUP160Q12769 1436 aa25.39■■□□□ 1.66
CNGA3-205ENST00000436404 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
CNGA3-205ENST00000436404 IQGAP2Q13576 1575 aa25.36■■□□□ 1.65
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.35■■□□□ 1.65
CNGA3-205ENST00000436404 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.34■■□□□ 1.65
CNGA3-205ENST00000436404 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CNGA3-205ENST00000436404 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CNGA3-205ENST00000436404 ARAP1Q96P48 1450 aa25.3■■□□□ 1.64
CNGA3-205ENST00000436404 SAMD9Q5K651 1589 aa25.28■■□□□ 1.64
CNGA3-205ENST00000436404 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.26■■□□□ 1.63
CNGA3-205ENST00000436404 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.25■■□□□ 1.63
CNGA3-205ENST00000436404 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.17■■□□□ 1.62
CNGA3-205ENST00000436404 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.17■■□□□ 1.62
CNGA3-205ENST00000436404 DISP1Q96F81 1524 aa25.16■■□□□ 1.62
CNGA3-205ENST00000436404 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.16■■□□□ 1.62
CNGA3-205ENST00000436404 P3H3Q8IVL6 736 aa25.15■■□□□ 1.62
CNGA3-205ENST00000436404 KIAA0556O60303 1618 aa25.13■■□□□ 1.61
CNGA3-205ENST00000436404 SHROOM2Q13796 1616 aa25.13■■□□□ 1.61
CNGA3-205ENST00000436404 JPH4Q96JJ6 628 aa25.11■■□□□ 1.61
CNGA3-205ENST00000436404 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CNGA3-205ENST00000436404 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CNGA3-205ENST00000436404 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CNGA3-205ENST00000436404 FMN1Q68DA7 1419 aa24.99■■□□□ 1.59
CNGA3-205ENST00000436404 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.98■■□□□ 1.59
CNGA3-205ENST00000436404 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.98■■□□□ 1.59
CNGA3-205ENST00000436404 OSCARQ8IYS5 282 aa24.97■■□□□ 1.59
CNGA3-205ENST00000436404 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
CNGA3-205ENST00000436404 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.93■■□□□ 1.58
CNGA3-205ENST00000436404 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.92■■□□□ 1.58
CNGA3-205ENST00000436404 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.92■■□□□ 1.58
CNGA3-205ENST00000436404 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.84■■□□□ 1.57
CNGA3-205ENST00000436404 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.83■■□□□ 1.57
CNGA3-205ENST00000436404 TIAM1Q13009 1591 aa24.83■■□□□ 1.57
CNGA3-205ENST00000436404 HECW1Q76N89 1606 aa24.82■■□□□ 1.56
CNGA3-205ENST00000436404 MAP3K1Q13233 1512 aa24.82■■□□□ 1.56
CNGA3-205ENST00000436404 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.81■■□□□ 1.56
CNGA3-205ENST00000436404 ABCA8O94911 1581 aa24.8■■□□□ 1.56
CNGA3-205ENST00000436404 MIER1Q8N108 512 aa24.79■■□□□ 1.56
CNGA3-205ENST00000436404 PTPRGP23470 1445 aa24.79■■□□□ 1.56
CNGA3-205ENST00000436404 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CNGA3-205ENST00000436404 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CNGA3-205ENST00000436404 APLP2Q06481 763 aa24.76■■□□□ 1.55
CNGA3-205ENST00000436404 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CNGA3-205ENST00000436404 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CNGA3-205ENST00000436404 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.7■■□□□ 1.55
CNGA3-205ENST00000436404 BCL11AQ9H165 835 aa24.7■■□□□ 1.54
CNGA3-205ENST00000436404 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.7■■□□□ 1.54
CNGA3-205ENST00000436404 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.69■■□□□ 1.54
CNGA3-205ENST00000436404 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.69■■□□□ 1.54
CNGA3-205ENST00000436404 UACAQ9BZF9 1416 aa24.67■■□□□ 1.54
CNGA3-205ENST00000436404 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.65■■□□□ 1.54
CNGA3-205ENST00000436404 ARHGEF11O15085 1522 aa24.65■■□□□ 1.54
CNGA3-205ENST00000436404 ARID3CA6NKF2 412 aa24.64■■□□□ 1.53
CNGA3-205ENST00000436404 ABCC2Q92887 1545 aa24.63■■□□□ 1.53
CNGA3-205ENST00000436404 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.59■■□□□ 1.53
CNGA3-205ENST00000436404 ATP10BO94823 1461 aa24.59■■□□□ 1.53
CNGA3-205ENST00000436404 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.58■■□□□ 1.53
CNGA3-205ENST00000436404 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.58■■□□□ 1.53
CNGA3-205ENST00000436404 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.58■■□□□ 1.53
CNGA3-205ENST00000436404 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.58■■□□□ 1.52
CNGA3-205ENST00000436404 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.56■■□□□ 1.52
CNGA3-205ENST00000436404 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CNGA3-205ENST00000436404 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.53■■□□□ 1.52
CNGA3-205ENST00000436404 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CNGA3-205ENST00000436404 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.5■■□□□ 1.51
CNGA3-205ENST00000436404 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.5■■□□□ 1.51
CNGA3-205ENST00000436404 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CNGA3-205ENST00000436404 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CNGA3-205ENST00000436404 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.46■■□□□ 1.51
CNGA3-205ENST00000436404 NCOA2Q15596 1464 aa24.45■■□□□ 1.5
CNGA3-205ENST00000436404 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CNGA3-205ENST00000436404 KIF14Q15058 1648 aa24.42■■□□□ 1.5
CNGA3-205ENST00000436404 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CNGA3-205ENST00000436404 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CNGA3-205ENST00000436404 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.37■■□□□ 1.49
CNGA3-205ENST00000436404 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.33■■□□□ 1.49
CNGA3-205ENST00000436404 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.32■■□□□ 1.48
CNGA3-205ENST00000436404 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.31■■□□□ 1.48
CNGA3-205ENST00000436404 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.29■■□□□ 1.48
CNGA3-205ENST00000436404 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.28■■□□□ 1.48
CNGA3-205ENST00000436404 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.26■■□□□ 1.47
CNGA3-205ENST00000436404 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.26■■□□□ 1.47
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