RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.98■■■■□ 3.51
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CNGA3-205ENST00000436404 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.56
CNGA3-205ENST00000436404 ABCC9O60706 1549 aa30.93■■■□□ 2.54
CNGA3-205ENST00000436404 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.59■■■□□ 2.49
CNGA3-205ENST00000436404 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.49■■■□□ 2.47
CNGA3-205ENST00000436404 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.36■■■□□ 2.45
CNGA3-205ENST00000436404 NACADO15069 1562 aa30.26■■■□□ 2.43
CNGA3-205ENST00000436404 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.08■■■□□ 2.41
CNGA3-205ENST00000436404 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.83■■■□□ 2.37
CNGA3-205ENST00000436404 SCRIBQ14160 1630 aa29.76■■■□□ 2.35
CNGA3-205ENST00000436404 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.59■■■□□ 2.33
CNGA3-205ENST00000436404 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.26■■■□□ 2.27
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CNGA3-205ENST00000436404 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.77■■■□□ 2.2
CNGA3-205ENST00000436404 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.57■■■□□ 2.16
CNGA3-205ENST00000436404 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
CNGA3-205ENST00000436404 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CNGA3-205ENST00000436404 SMARCA4P51532 1647 aa28.52■■■□□ 2.16
CNGA3-205ENST00000436404 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CNGA3-205ENST00000436404 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CNGA3-205ENST00000436404 WIZO95785 1651 aa28.34■■■□□ 2.13
CNGA3-205ENST00000436404 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.21■■■□□ 2.11
CNGA3-205ENST00000436404 HRCP23327 699 aa28.2■■■□□ 2.11
CNGA3-205ENST00000436404 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.11■■■□□ 2.09
CNGA3-205ENST00000436404 SMARCA2P51531 1590 aa28.07■■■□□ 2.08
CNGA3-205ENST00000436404 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.04■■■□□ 2.08
CNGA3-205ENST00000436404 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CNGA3-205ENST00000436404 NCAPD3P42695 1498 aa27.93■■■□□ 2.06
CNGA3-205ENST00000436404 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CNGA3-205ENST00000436404 HMGXB3Q12766 1538 aa27.88■■■□□ 2.05
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.7■■■□□ 2.02
CNGA3-205ENST00000436404 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.64■■■□□ 2.01
CNGA3-205ENST00000436404 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
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CNGA3-205ENST00000436404 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.41■■□□□ 1.98
CNGA3-205ENST00000436404 CFTRP13569 1480 aa27.21■■□□□ 1.95
CNGA3-205ENST00000436404 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.16■■□□□ 1.94
CNGA3-205ENST00000436404 PRDM2Q13029 1718 aa27.14■■□□□ 1.93
CNGA3-205ENST00000436404 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.13■■□□□ 1.93
CNGA3-205ENST00000436404 NESP48681 1621 aa27.09■■□□□ 1.93
CNGA3-205ENST00000436404 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.04■■□□□ 1.92
CNGA3-205ENST00000436404 ABCC8Q09428 1581 aa27.02■■□□□ 1.92
CNGA3-205ENST00000436404 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.87■■□□□ 1.89
CNGA3-205ENST00000436404 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.84■■□□□ 1.89
CNGA3-205ENST00000436404 SYNJ1O43426 1573 aa26.82■■□□□ 1.88
CNGA3-205ENST00000436404 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.8■■□□□ 1.88
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM41Q8WV44 630 aa26.8■■□□□ 1.88
CNGA3-205ENST00000436404 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.78■■□□□ 1.88
CNGA3-205ENST00000436404 CUX1P39880 1505 aa26.74■■□□□ 1.87
CNGA3-205ENST00000436404 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.73■■□□□ 1.87
CNGA3-205ENST00000436404 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.72■■□□□ 1.87
CNGA3-205ENST00000436404 TOP2BQ02880 1626 aa26.72■■□□□ 1.87
CNGA3-205ENST00000436404 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CNGA3-205ENST00000436404 MYT1Q01538 1121 aa26.67■■□□□ 1.86
CNGA3-205ENST00000436404 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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CNGA3-205ENST00000436404 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.59■■□□□ 1.85
CNGA3-205ENST00000436404 TOPBP1Q92547 1522 aa26.56■■□□□ 1.84
CNGA3-205ENST00000436404 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CNGA3-205ENST00000436404 ERCC6Q03468 1493 aa26.51■■□□□ 1.83
CNGA3-205ENST00000436404 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.5■■□□□ 1.83
CNGA3-205ENST00000436404 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.47■■□□□ 1.83
CNGA3-205ENST00000436404 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CNGA3-205ENST00000436404 WDR62O43379 1518 aa26.42■■□□□ 1.82
CNGA3-205ENST00000436404 SOGA1O94964 1423 aa26.41■■□□□ 1.82
CNGA3-205ENST00000436404 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CNGA3-205ENST00000436404 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.37■■□□□ 1.81
CNGA3-205ENST00000436404 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.35■■□□□ 1.81
CNGA3-205ENST00000436404 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.31■■□□□ 1.8
CNGA3-205ENST00000436404 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CNGA3-205ENST00000436404 WDR97A6NE52 1622 aa26.27■■□□□ 1.8
CNGA3-205ENST00000436404 CUX2O14529 1486 aa26.25■■□□□ 1.79
CNGA3-205ENST00000436404 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CNGA3-205ENST00000436404 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.24■■□□□ 1.79
CNGA3-205ENST00000436404 EEA1Q15075 1411 aa26.23■■□□□ 1.79
CNGA3-205ENST00000436404 KIF27Q86VH2 1401 aa26.16■■□□□ 1.78
CNGA3-205ENST00000436404 IFT140Q96RY7 1462 aa26.11■■□□□ 1.77
CNGA3-205ENST00000436404 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.11■■□□□ 1.77
CNGA3-205ENST00000436404 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.1■■□□□ 1.77
CNGA3-205ENST00000436404 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CNGA3-205ENST00000436404 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CNGA3-205ENST00000436404 IGF1RP08069 1367 aa26.01■■□□□ 1.75
CNGA3-205ENST00000436404 KIF21BO75037 1637 aa25.99■■□□□ 1.75
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CNGA3-205ENST00000436404 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
CNGA3-205ENST00000436404 PRXQ9BXM0 1461 aa25.96■■□□□ 1.75
CNGA3-205ENST00000436404 PBRM1Q86U86 1689 aa25.95■■□□□ 1.74
CNGA3-205ENST00000436404 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CNGA3-205ENST00000436404 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.93■■□□□ 1.74
CNGA3-205ENST00000436404 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.92■■□□□ 1.74
CNGA3-205ENST00000436404 NEUROD1Q13562 356 aa25.91■■□□□ 1.74
CNGA3-205ENST00000436404 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.89■■□□□ 1.74
CNGA3-205ENST00000436404 GOLGA3Q08378 1498 aa25.87■■□□□ 1.73
CNGA3-205ENST00000436404 CUL7Q14999 1698 aa25.87■■□□□ 1.73
CNGA3-205ENST00000436404 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.84■■□□□ 1.73
CNGA3-205ENST00000436404 GRIN2BQ13224 1484 aa25.84■■□□□ 1.73
CNGA3-205ENST00000436404 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.8■■□□□ 1.72
CNGA3-205ENST00000436404 ADAMTS12P58397 1594 aa25.76■■□□□ 1.72
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