RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.19■■□□□ 1.14
SFRP4-201ENST00000436072 P3H3Q8IVL6 736 aa22.18■■□□□ 1.14
SFRP4-201ENST00000436072 FKBP8Q14318 412 aa22.16■■□□□ 1.14
SFRP4-201ENST00000436072 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.13■■□□□ 1.13
SFRP4-201ENST00000436072 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SFRP4-201ENST00000436072 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SFRP4-201ENST00000436072 TOPBP1Q92547 1522 aa22.1■■□□□ 1.13
SFRP4-201ENST00000436072 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SFRP4-201ENST00000436072 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SFRP4-201ENST00000436072 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.05■■□□□ 1.12
SFRP4-201ENST00000436072 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
SFRP4-201ENST00000436072 BCL11AQ9H165 835 aa22.01■■□□□ 1.11
SFRP4-201ENST00000436072 TRIM52Q96A61 297 aa22■■□□□ 1.11
SFRP4-201ENST00000436072 SIN3AQ96ST3 1273 aa22■■□□□ 1.11
SFRP4-201ENST00000436072 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SFRP4-201ENST00000436072 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.95■■□□□ 1.11
SFRP4-201ENST00000436072 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.95■■□□□ 1.1
SFRP4-201ENST00000436072 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.95■■□□□ 1.1
SFRP4-201ENST00000436072 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.92■■□□□ 1.1
SFRP4-201ENST00000436072 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SFRP4-201ENST00000436072 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.91■■□□□ 1.1
SFRP4-201ENST00000436072 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SFRP4-201ENST00000436072 NEFLP07196 543 aa21.9■■□□□ 1.1
SFRP4-201ENST00000436072 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.89■■□□□ 1.1
SFRP4-201ENST00000436072 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
SFRP4-201ENST00000436072 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.86■■□□□ 1.09
SFRP4-201ENST00000436072 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.79■■□□□ 1.08
SFRP4-201ENST00000436072 MAPKBP1O60336 1514 aa21.79■■□□□ 1.08
SFRP4-201ENST00000436072 WDR97A6NE52 1622 aa21.79■■□□□ 1.08
SFRP4-201ENST00000436072 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SFRP4-201ENST00000436072 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SFRP4-201ENST00000436072 TIAM1Q13009 1591 aa21.77■■□□□ 1.08
SFRP4-201ENST00000436072 ANP32CO43423 234 aa21.75■■□□□ 1.07
SFRP4-201ENST00000436072 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.75■■□□□ 1.07
SFRP4-201ENST00000436072 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SFRP4-201ENST00000436072 CUL7Q14999 1698 aa21.74■■□□□ 1.07
SFRP4-201ENST00000436072 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.73■■□□□ 1.07
SFRP4-201ENST00000436072 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.73■■□□□ 1.07
SFRP4-201ENST00000436072 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.72■■□□□ 1.07
SFRP4-201ENST00000436072 MSH5O43196 834 aa21.71■■□□□ 1.07
SFRP4-201ENST00000436072 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
SFRP4-201ENST00000436072 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.69■■□□□ 1.06
SFRP4-201ENST00000436072 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.67■■□□□ 1.06
SFRP4-201ENST00000436072 ARID3CA6NKF2 412 aa21.66■■□□□ 1.06
SFRP4-201ENST00000436072 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SFRP4-201ENST00000436072 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.61■■□□□ 1.05
SFRP4-201ENST00000436072 CCER2I3L3R5 266 aa21.6■■□□□ 1.05
SFRP4-201ENST00000436072 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
SFRP4-201ENST00000436072 MAP3K1Q13233 1512 aa21.6■■□□□ 1.05
SFRP4-201ENST00000436072 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.59■■□□□ 1.05
SFRP4-201ENST00000436072 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.58■■□□□ 1.05
SFRP4-201ENST00000436072 FMN1Q68DA7 1419 aa21.57■■□□□ 1.04
SFRP4-201ENST00000436072 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.57■■□□□ 1.04
SFRP4-201ENST00000436072 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.56■■□□□ 1.04
SFRP4-201ENST00000436072 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.55■■□□□ 1.04
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SFRP4-201ENST00000436072 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.54■■□□□ 1.04
SFRP4-201ENST00000436072 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SFRP4-201ENST00000436072 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.51■■□□□ 1.03
SFRP4-201ENST00000436072 TONSLQ96HA7 1378 aa21.49■■□□□ 1.03
SFRP4-201ENST00000436072 PBRM1Q86U86 1689 aa21.49■■□□□ 1.03
SFRP4-201ENST00000436072 ERCC6Q03468 1493 aa21.48■■□□□ 1.03
SFRP4-201ENST00000436072 FBLN2P98095 1184 aa21.47■■□□□ 1.03
SFRP4-201ENST00000436072 SAMD9Q5K651 1589 aa21.46■■□□□ 1.03
SFRP4-201ENST00000436072 GRIN2BQ13224 1484 aa21.43■■□□□ 1.02
SFRP4-201ENST00000436072 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.43■■□□□ 1.02
SFRP4-201ENST00000436072 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.43■■□□□ 1.02
SFRP4-201ENST00000436072 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.4■■□□□ 1.02
SFRP4-201ENST00000436072 ADAMTS12P58397 1594 aa21.39■■□□□ 1.02
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC184Q52MB2 194 aa21.39■■□□□ 1.01
SFRP4-201ENST00000436072 IQGAP2Q13576 1575 aa21.37■■□□□ 1.01
SFRP4-201ENST00000436072 IFT140Q96RY7 1462 aa21.37■■□□□ 1.01
SFRP4-201ENST00000436072 NCOA2Q15596 1464 aa21.36■■□□□ 1.01
SFRP4-201ENST00000436072 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.36■■□□□ 1.01
SFRP4-201ENST00000436072 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.36■■□□□ 1.01
SFRP4-201ENST00000436072 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.36■■□□□ 1.01
SFRP4-201ENST00000436072 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.35■■□□□ 1.01
SFRP4-201ENST00000436072 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SFRP4-201ENST00000436072 WDR62O43379 1518 aa21.34■■□□□ 1.01
SFRP4-201ENST00000436072 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SFRP4-201ENST00000436072 PTPRKQ15262 1439 aa21.32■■□□□ 1
SFRP4-201ENST00000436072 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SFRP4-201ENST00000436072 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.31■■□□□ 1
SFRP4-201ENST00000436072 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SFRP4-201ENST00000436072 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.3■■□□□ 1
SFRP4-201ENST00000436072 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.29■■□□□ 1
SFRP4-201ENST00000436072 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.28■■□□□ 1
SFRP4-201ENST00000436072 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.28■■□□□ 1
SFRP4-201ENST00000436072 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SFRP4-201ENST00000436072 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.26■□□□□ 0.99
SFRP4-201ENST00000436072 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SFRP4-201ENST00000436072 NBR1Q14596 966 aa21.25■□□□□ 0.99
SFRP4-201ENST00000436072 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.25■□□□□ 0.99
SFRP4-201ENST00000436072 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.23■□□□□ 0.99
SFRP4-201ENST00000436072 GRIN2AQ12879 1464 aa21.22■□□□□ 0.99
SFRP4-201ENST00000436072 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
SFRP4-201ENST00000436072 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.22■□□□□ 0.99
SFRP4-201ENST00000436072 HECW1Q76N89 1606 aa21.21■□□□□ 0.99
SFRP4-201ENST00000436072 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
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