RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.19■■■□□ 2.58
SFRP4-201ENST00000436072 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.7■■□□□ 1.87
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.54■■□□□ 1.84
SFRP4-201ENST00000436072 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.43■■□□□ 1.82
SFRP4-201ENST00000436072 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
SFRP4-201ENST00000436072 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SFRP4-201ENST00000436072 HRCP23327 699 aa25.86■■□□□ 1.73
SFRP4-201ENST00000436072 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.72■■□□□ 1.71
SFRP4-201ENST00000436072 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.67■■□□□ 1.7
SFRP4-201ENST00000436072 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
SFRP4-201ENST00000436072 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.61■■□□□ 1.69
SFRP4-201ENST00000436072 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.42■■□□□ 1.66
SFRP4-201ENST00000436072 ABCC9O60706 1549 aa25.23■■□□□ 1.63
SFRP4-201ENST00000436072 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.19■■□□□ 1.62
SFRP4-201ENST00000436072 SCRIBQ14160 1630 aa25.09■■□□□ 1.61
SFRP4-201ENST00000436072 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SFRP4-201ENST00000436072 NACADO15069 1562 aa24.69■■□□□ 1.54
SFRP4-201ENST00000436072 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SFRP4-201ENST00000436072 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.54■■□□□ 1.52
SFRP4-201ENST00000436072 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.48■■□□□ 1.51
SFRP4-201ENST00000436072 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SFRP4-201ENST00000436072 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.41■■□□□ 1.5
SFRP4-201ENST00000436072 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
SFRP4-201ENST00000436072 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SFRP4-201ENST00000436072 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.31■■□□□ 1.48
SFRP4-201ENST00000436072 TRIM41Q8WV44 630 aa24.26■■□□□ 1.47
SFRP4-201ENST00000436072 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SFRP4-201ENST00000436072 WIZO95785 1651 aa24.18■■□□□ 1.46
SFRP4-201ENST00000436072 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
SFRP4-201ENST00000436072 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.06■■□□□ 1.44
SFRP4-201ENST00000436072 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SFRP4-201ENST00000436072 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SFRP4-201ENST00000436072 NEUROD1Q13562 356 aa23.88■■□□□ 1.41
SFRP4-201ENST00000436072 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SFRP4-201ENST00000436072 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SFRP4-201ENST00000436072 SMARCA4P51532 1647 aa23.83■■□□□ 1.4
SFRP4-201ENST00000436072 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
SFRP4-201ENST00000436072 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.77■■□□□ 1.4
SFRP4-201ENST00000436072 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.73■■□□□ 1.39
SFRP4-201ENST00000436072 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.67■■□□□ 1.38
SFRP4-201ENST00000436072 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SFRP4-201ENST00000436072 ABCC8Q09428 1581 aa23.58■■□□□ 1.37
SFRP4-201ENST00000436072 SMARCA2P51531 1590 aa23.57■■□□□ 1.36
SFRP4-201ENST00000436072 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SFRP4-201ENST00000436072 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SFRP4-201ENST00000436072 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SFRP4-201ENST00000436072 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.34■■□□□ 1.33
SFRP4-201ENST00000436072 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SFRP4-201ENST00000436072 SOGA1O94964 1423 aa23.29■■□□□ 1.32
SFRP4-201ENST00000436072 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.26■■□□□ 1.31
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SFRP4-201ENST00000436072 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.2■■□□□ 1.3
SFRP4-201ENST00000436072 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
SFRP4-201ENST00000436072 MIER1Q8N108 512 aa23.14■■□□□ 1.29
SFRP4-201ENST00000436072 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
SFRP4-201ENST00000436072 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.11■■□□□ 1.29
SFRP4-201ENST00000436072 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SFRP4-201ENST00000436072 CEP162Q5TB80 1403 aa23.1■■□□□ 1.29
SFRP4-201ENST00000436072 MYT1Q01538 1121 aa23.08■■□□□ 1.29
SFRP4-201ENST00000436072 SYNJ1O43426 1573 aa23.03■■□□□ 1.28
SFRP4-201ENST00000436072 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SFRP4-201ENST00000436072 EEA1Q15075 1411 aa22.89■■□□□ 1.26
SFRP4-201ENST00000436072 NCAPD3P42695 1498 aa22.89■■□□□ 1.25
SFRP4-201ENST00000436072 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.88■■□□□ 1.25
SFRP4-201ENST00000436072 GOLGA3Q08378 1498 aa22.82■■□□□ 1.24
SFRP4-201ENST00000436072 HMGXB3Q12766 1538 aa22.8■■□□□ 1.24
SFRP4-201ENST00000436072 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.72■■□□□ 1.23
SFRP4-201ENST00000436072 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.7■■□□□ 1.22
SFRP4-201ENST00000436072 TOP2BQ02880 1626 aa22.7■■□□□ 1.22
SFRP4-201ENST00000436072 APLP2Q06481 763 aa22.65■■□□□ 1.22
SFRP4-201ENST00000436072 CFTRP13569 1480 aa22.63■■□□□ 1.21
SFRP4-201ENST00000436072 CUX1P39880 1505 aa22.63■■□□□ 1.21
SFRP4-201ENST00000436072 CLIP1P30622 1438 aa22.62■■□□□ 1.21
SFRP4-201ENST00000436072 KIF21BO75037 1637 aa22.6■■□□□ 1.21
SFRP4-201ENST00000436072 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.6■■□□□ 1.21
SFRP4-201ENST00000436072 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SFRP4-201ENST00000436072 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.58■■□□□ 1.2
SFRP4-201ENST00000436072 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.51■■□□□ 1.19
SFRP4-201ENST00000436072 KIF27Q86VH2 1401 aa22.46■■□□□ 1.19
SFRP4-201ENST00000436072 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.41■■□□□ 1.18
SFRP4-201ENST00000436072 BCANQ96GW7 911 aa22.41■■□□□ 1.18
SFRP4-201ENST00000436072 PRXQ9BXM0 1461 aa22.4■■□□□ 1.18
SFRP4-201ENST00000436072 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.4■■□□□ 1.18
SFRP4-201ENST00000436072 KCNH8Q96L42 1107 aa22.4■■□□□ 1.18
SFRP4-201ENST00000436072 CUX2O14529 1486 aa22.38■■□□□ 1.17
SFRP4-201ENST00000436072 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.37■■□□□ 1.17
SFRP4-201ENST00000436072 ITGAEP38570 1179 aa22.37■■□□□ 1.17
SFRP4-201ENST00000436072 NESP48681 1621 aa22.36■■□□□ 1.17
SFRP4-201ENST00000436072 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SFRP4-201ENST00000436072 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.32■■□□□ 1.16
SFRP4-201ENST00000436072 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SFRP4-201ENST00000436072 PRDM2Q13029 1718 aa22.31■■□□□ 1.16
SFRP4-201ENST00000436072 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.31■■□□□ 1.16
SFRP4-201ENST00000436072 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.3■■□□□ 1.16
SFRP4-201ENST00000436072 IGF1RP08069 1367 aa22.26■■□□□ 1.15
SFRP4-201ENST00000436072 ARAP1Q96P48 1450 aa22.24■■□□□ 1.15
SFRP4-201ENST00000436072 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.23■■□□□ 1.15
SFRP4-201ENST00000436072 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.21■■□□□ 1.15
SFRP4-201ENST00000436072 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.2■■□□□ 1.14
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