RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430267.2

GPR35-204, Transcript of G protein-coupled receptor 35, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GPR35, Length 1,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35-204ENST00000430267 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.6■■■■□ 3.45
GPR35-204ENST00000430267 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.5■■■■□ 3.43
GPR35-204ENST00000430267 JPH4Q96JJ6 628 aa36.48■■■■□ 3.43
GPR35-204ENST00000430267 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
GPR35-204ENST00000430267 IQGAP2Q13576 1575 aa36.41■■■■□ 3.42
GPR35-204ENST00000430267 PRXQ9BXM0 1461 aa36.37■■■■□ 3.41
GPR35-204ENST00000430267 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.34■■■■□ 3.41
GPR35-204ENST00000430267 EEA1Q15075 1411 aa36.32■■■■□ 3.41
GPR35-204ENST00000430267 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.22■■■■□ 3.39
GPR35-204ENST00000430267 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.17■■■■□ 3.38
GPR35-204ENST00000430267 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.16■■■■□ 3.38
GPR35-204ENST00000430267 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.15■■■■□ 3.38
GPR35-204ENST00000430267 DISP1Q96F81 1524 aa36.13■■■■□ 3.38
GPR35-204ENST00000430267 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.08■■■■□ 3.37
GPR35-204ENST00000430267 KIAA0556O60303 1618 aa36.07■■■■□ 3.37
GPR35-204ENST00000430267 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.04■■■■□ 3.36
GPR35-204ENST00000430267 KIF21BO75037 1637 aa36.02■■■■□ 3.36
GPR35-204ENST00000430267 PTPRGP23470 1445 aa36■■■■□ 3.35
GPR35-204ENST00000430267 GOLGA3Q08378 1498 aa35.96■■■■□ 3.35
GPR35-204ENST00000430267 MAPKBP1O60336 1514 aa35.93■■■■□ 3.34
GPR35-204ENST00000430267 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
GPR35-204ENST00000430267 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.89■■■■□ 3.34
GPR35-204ENST00000430267 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.85■■■■□ 3.33
GPR35-204ENST00000430267 ABCC2Q92887 1545 aa35.82■■■■□ 3.33
GPR35-204ENST00000430267 SAMD9Q5K651 1589 aa35.82■■■■□ 3.32
GPR35-204ENST00000430267 UACAQ9BZF9 1416 aa35.8■■■■□ 3.32
GPR35-204ENST00000430267 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
GPR35-204ENST00000430267 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.76■■■■□ 3.32
GPR35-204ENST00000430267 DIP2BQ9P265 1576 aa35.7■■■■□ 3.31
GPR35-204ENST00000430267 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.7■■■■□ 3.31
GPR35-204ENST00000430267 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.7■■■■□ 3.31
GPR35-204ENST00000430267 ABCA8O94911 1581 aa35.69■■■■□ 3.3
GPR35-204ENST00000430267 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
GPR35-204ENST00000430267 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
GPR35-204ENST00000430267 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.62■■■■□ 3.29
GPR35-204ENST00000430267 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.61■■■■□ 3.29
GPR35-204ENST00000430267 ASXL2Q76L83 1435 aa35.53■■■■□ 3.28
GPR35-204ENST00000430267 GLI2P10070 1586 aa35.49■■■■□ 3.27
GPR35-204ENST00000430267 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.46■■■■□ 3.27
GPR35-204ENST00000430267 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.44■■■■□ 3.26
GPR35-204ENST00000430267 P3H3Q8IVL6 736 aa35.41■■■■□ 3.26
GPR35-204ENST00000430267 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.4■■■■□ 3.26
GPR35-204ENST00000430267 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
GPR35-204ENST00000430267 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.38■■■■□ 3.25
GPR35-204ENST00000430267 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
GPR35-204ENST00000430267 TSPOAP1O95153 1857 aa35.35■■■■□ 3.25
GPR35-204ENST00000430267 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.34■■■■□ 3.25
GPR35-204ENST00000430267 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
GPR35-204ENST00000430267 ATP10BO94823 1461 aa35.3■■■■□ 3.24
GPR35-204ENST00000430267 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.3■■■■□ 3.24
GPR35-204ENST00000430267 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
GPR35-204ENST00000430267 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
GPR35-204ENST00000430267 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.24■■■■□ 3.23
GPR35-204ENST00000430267 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.23■■■■□ 3.23
GPR35-204ENST00000430267 FMN1Q68DA7 1419 aa35.19■■■■□ 3.22
GPR35-204ENST00000430267 KDM6BO15054 1643 aa35.13■■■■□ 3.21
GPR35-204ENST00000430267 HECW1Q76N89 1606 aa35.11■■■■□ 3.21
GPR35-204ENST00000430267 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.1■■■■□ 3.21
GPR35-204ENST00000430267 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.09■■■■□ 3.21
GPR35-204ENST00000430267 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.06■■■■□ 3.2
GPR35-204ENST00000430267 ARID3CA6NKF2 412 aa35.02■■■■□ 3.2
GPR35-204ENST00000430267 CD109Q6YHK3 1445 aa35■■■■□ 3.19
GPR35-204ENST00000430267 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.98■■■■□ 3.19
GPR35-204ENST00000430267 CLIP1P30622 1438 aa34.98■■■■□ 3.19
GPR35-204ENST00000430267 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
GPR35-204ENST00000430267 KCNH8Q96L42 1107 aa34.97■■■■□ 3.19
GPR35-204ENST00000430267 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
GPR35-204ENST00000430267 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
GPR35-204ENST00000430267 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
GPR35-204ENST00000430267 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.9■■■■□ 3.18
GPR35-204ENST00000430267 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.87■■■■□ 3.17
GPR35-204ENST00000430267 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.86■■■■□ 3.17
GPR35-204ENST00000430267 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
GPR35-204ENST00000430267 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.83■■■■□ 3.17
GPR35-204ENST00000430267 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.82■■■■□ 3.17
GPR35-204ENST00000430267 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.79■■■■□ 3.16
GPR35-204ENST00000430267 CEP162Q5TB80 1403 aa34.79■■■■□ 3.16
GPR35-204ENST00000430267 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.78■■■■□ 3.16
GPR35-204ENST00000430267 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.77■■■■□ 3.16
GPR35-204ENST00000430267 NEO1Q92859 1461 aa34.76■■■■□ 3.16
GPR35-204ENST00000430267 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.74■■■■□ 3.15
GPR35-204ENST00000430267 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
GPR35-204ENST00000430267 KIF14Q15058 1648 aa34.73■■■■□ 3.15
GPR35-204ENST00000430267 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
GPR35-204ENST00000430267 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
GPR35-204ENST00000430267 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.68■■■■□ 3.14
GPR35-204ENST00000430267 FANCAO15360 1455 aa34.59■■■■□ 3.13
GPR35-204ENST00000430267 PLCH2O75038 1416 aa34.58■■■■□ 3.13
GPR35-204ENST00000430267 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.57■■■■□ 3.12
GPR35-204ENST00000430267 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.56■■■■□ 3.12
GPR35-204ENST00000430267 RICTORQ6R327 1708 aa34.55■■■■□ 3.12
GPR35-204ENST00000430267 AKNAQ7Z591 1439 aa34.51■■■■□ 3.12
GPR35-204ENST00000430267 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.49■■■■□ 3.11
GPR35-204ENST00000430267 PREX2Q70Z35 1606 aa34.49■■■■□ 3.11
GPR35-204ENST00000430267 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.46■■■■□ 3.11
GPR35-204ENST00000430267 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
GPR35-204ENST00000430267 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.42■■■■□ 3.1
GPR35-204ENST00000430267 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.42■■■■□ 3.1
GPR35-204ENST00000430267 ADGRL1O94910 1474 aa34.39■■■■□ 3.1
GPR35-204ENST00000430267 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms