RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428825.8

AC060234.2-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC060234.2, Length 1,610 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC060234.2-201ENST00000428825 TIAM1Q13009 1591 aa22.87■■□□□ 1.25
AC060234.2-201ENST00000428825 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.86■■□□□ 1.25
AC060234.2-201ENST00000428825 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
AC060234.2-201ENST00000428825 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
AC060234.2-201ENST00000428825 WDR62O43379 1518 aa22.82■■□□□ 1.24
AC060234.2-201ENST00000428825 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.81■■□□□ 1.24
AC060234.2-201ENST00000428825 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
AC060234.2-201ENST00000428825 SAMD9Q5K651 1589 aa22.78■■□□□ 1.24
AC060234.2-201ENST00000428825 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
AC060234.2-201ENST00000428825 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.75■■□□□ 1.23
AC060234.2-201ENST00000428825 ADAMTS12P58397 1594 aa22.75■■□□□ 1.23
AC060234.2-201ENST00000428825 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
AC060234.2-201ENST00000428825 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.73■■□□□ 1.23
AC060234.2-201ENST00000428825 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.71■■□□□ 1.23
AC060234.2-201ENST00000428825 IFT140Q96RY7 1462 aa22.71■■□□□ 1.23
AC060234.2-201ENST00000428825 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.69■■□□□ 1.22
AC060234.2-201ENST00000428825 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
AC060234.2-201ENST00000428825 P3H3Q8IVL6 736 aa22.66■■□□□ 1.22
AC060234.2-201ENST00000428825 GRIN2BQ13224 1484 aa22.66■■□□□ 1.22
AC060234.2-201ENST00000428825 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.65■■□□□ 1.22
AC060234.2-201ENST00000428825 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.63■■□□□ 1.21
AC060234.2-201ENST00000428825 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.63■■□□□ 1.21
AC060234.2-201ENST00000428825 FMN1Q68DA7 1419 aa22.63■■□□□ 1.21
AC060234.2-201ENST00000428825 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
AC060234.2-201ENST00000428825 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
AC060234.2-201ENST00000428825 IQGAP2Q13576 1575 aa22.59■■□□□ 1.21
AC060234.2-201ENST00000428825 ERCC6Q03468 1493 aa22.58■■□□□ 1.2
AC060234.2-201ENST00000428825 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.53■■□□□ 1.2
AC060234.2-201ENST00000428825 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.48■■□□□ 1.19
AC060234.2-201ENST00000428825 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
AC060234.2-201ENST00000428825 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
AC060234.2-201ENST00000428825 HECW1Q76N89 1606 aa22.43■■□□□ 1.18
AC060234.2-201ENST00000428825 GRIN2AQ12879 1464 aa22.42■■□□□ 1.18
AC060234.2-201ENST00000428825 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.42■■□□□ 1.18
AC060234.2-201ENST00000428825 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
AC060234.2-201ENST00000428825 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.4■■□□□ 1.18
AC060234.2-201ENST00000428825 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.4■■□□□ 1.18
AC060234.2-201ENST00000428825 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
AC060234.2-201ENST00000428825 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
AC060234.2-201ENST00000428825 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.38■■□□□ 1.17
AC060234.2-201ENST00000428825 KIAA0556O60303 1618 aa22.37■■□□□ 1.17
AC060234.2-201ENST00000428825 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.34■■□□□ 1.17
AC060234.2-201ENST00000428825 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.34■■□□□ 1.17
AC060234.2-201ENST00000428825 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.33■■□□□ 1.17
AC060234.2-201ENST00000428825 ARHGEF11O15085 1522 aa22.33■■□□□ 1.17
AC060234.2-201ENST00000428825 DISP1Q96F81 1524 aa22.33■■□□□ 1.17
AC060234.2-201ENST00000428825 SYNJ2O15056 1496 aa22.33■■□□□ 1.16
AC060234.2-201ENST00000428825 CEP170Q5SW79 1584 aa22.33■■□□□ 1.16
AC060234.2-201ENST00000428825 ITGAEP38570 1179 aa22.31■■□□□ 1.16
AC060234.2-201ENST00000428825 NCOA2Q15596 1464 aa22.31■■□□□ 1.16
AC060234.2-201ENST00000428825 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.31■■□□□ 1.16
AC060234.2-201ENST00000428825 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.3■■□□□ 1.16
AC060234.2-201ENST00000428825 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
AC060234.2-201ENST00000428825 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
AC060234.2-201ENST00000428825 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.26■■□□□ 1.15
AC060234.2-201ENST00000428825 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
AC060234.2-201ENST00000428825 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
AC060234.2-201ENST00000428825 MAPKBP1O60336 1514 aa22.23■■□□□ 1.15
AC060234.2-201ENST00000428825 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.23■■□□□ 1.15
AC060234.2-201ENST00000428825 NUP160Q12769 1436 aa22.23■■□□□ 1.15
AC060234.2-201ENST00000428825 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.22■■□□□ 1.15
AC060234.2-201ENST00000428825 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
AC060234.2-201ENST00000428825 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
AC060234.2-201ENST00000428825 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
AC060234.2-201ENST00000428825 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
AC060234.2-201ENST00000428825 PTPRKQ15262 1439 aa22.13■■□□□ 1.13
AC060234.2-201ENST00000428825 HFM1A2PYH4 1435 aa22.09■■□□□ 1.13
AC060234.2-201ENST00000428825 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.08■■□□□ 1.13
AC060234.2-201ENST00000428825 MIA2Q96PC5 1412 aa22.07■■□□□ 1.12
AC060234.2-201ENST00000428825 CHD1O14646 1710 aa22.05■■□□□ 1.12
AC060234.2-201ENST00000428825 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.05■■□□□ 1.12
AC060234.2-201ENST00000428825 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.03■■□□□ 1.12
AC060234.2-201ENST00000428825 FBLN2P98095 1184 aa22.03■■□□□ 1.12
AC060234.2-201ENST00000428825 NAIPQ13075 1403 aa22.03■■□□□ 1.12
AC060234.2-201ENST00000428825 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.02■■□□□ 1.11
AC060234.2-201ENST00000428825 ABCA8O94911 1581 aa22.01■■□□□ 1.11
AC060234.2-201ENST00000428825 JPH4Q96JJ6 628 aa22.01■■□□□ 1.11
AC060234.2-201ENST00000428825 AKNAQ7Z591 1439 aa21.99■■□□□ 1.11
AC060234.2-201ENST00000428825 ARID3CA6NKF2 412 aa21.98■■□□□ 1.11
AC060234.2-201ENST00000428825 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.97■■□□□ 1.11
AC060234.2-201ENST00000428825 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
AC060234.2-201ENST00000428825 UACAQ9BZF9 1416 aa21.96■■□□□ 1.11
AC060234.2-201ENST00000428825 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
AC060234.2-201ENST00000428825 KIF14Q15058 1648 aa21.93■■□□□ 1.1
AC060234.2-201ENST00000428825 SHROOM2Q13796 1616 aa21.92■■□□□ 1.1
AC060234.2-201ENST00000428825 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
AC060234.2-201ENST00000428825 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
AC060234.2-201ENST00000428825 KDM6BO15054 1643 aa21.9■■□□□ 1.1
AC060234.2-201ENST00000428825 DAPK1P53355 1430 aa21.87■■□□□ 1.09
AC060234.2-201ENST00000428825 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.87■■□□□ 1.09
AC060234.2-201ENST00000428825 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.85■■□□□ 1.09
AC060234.2-201ENST00000428825 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.85■■□□□ 1.09
AC060234.2-201ENST00000428825 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.85■■□□□ 1.09
AC060234.2-201ENST00000428825 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.84■■□□□ 1.09
AC060234.2-201ENST00000428825 ABCC5O15440 1437 aa21.83■■□□□ 1.09
AC060234.2-201ENST00000428825 ATP10BO94823 1461 aa21.83■■□□□ 1.09
AC060234.2-201ENST00000428825 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
AC060234.2-201ENST00000428825 ROCK1Q13464 1354 aa21.83■■□□□ 1.08
AC060234.2-201ENST00000428825 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.82■■□□□ 1.08
AC060234.2-201ENST00000428825 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms