RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428825.8

AC060234.2-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC060234.2, Length 1,610 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC060234.2-201ENST00000428825 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.99■■■□□ 2.87
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AC060234.2-201ENST00000428825 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
AC060234.2-201ENST00000428825 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.29■■□□□ 1.96
AC060234.2-201ENST00000428825 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.27■■□□□ 1.96
AC060234.2-201ENST00000428825 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.94■■□□□ 1.9
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AC060234.2-201ENST00000428825 SCRIBQ14160 1630 aa26.35■■□□□ 1.81
AC060234.2-201ENST00000428825 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.05■■□□□ 1.76
AC060234.2-201ENST00000428825 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
AC060234.2-201ENST00000428825 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.75■■□□□ 1.71
AC060234.2-201ENST00000428825 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.65■■□□□ 1.7
AC060234.2-201ENST00000428825 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.62■■□□□ 1.69
AC060234.2-201ENST00000428825 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.55■■□□□ 1.68
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AC060234.2-201ENST00000428825 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.36■■□□□ 1.65
AC060234.2-201ENST00000428825 SMARCA4P51532 1647 aa25.29■■□□□ 1.64
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AC060234.2-201ENST00000428825 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.94■■□□□ 1.58
AC060234.2-201ENST00000428825 SMARCA2P51531 1590 aa24.92■■□□□ 1.58
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AC060234.2-201ENST00000428825 TRIM41Q8WV44 630 aa24.8■■□□□ 1.56
AC060234.2-201ENST00000428825 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.7■■□□□ 1.54
AC060234.2-201ENST00000428825 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.67■■□□□ 1.54
AC060234.2-201ENST00000428825 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
AC060234.2-201ENST00000428825 ABCC8Q09428 1581 aa24.55■■□□□ 1.52
AC060234.2-201ENST00000428825 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
AC060234.2-201ENST00000428825 HMGXB3Q12766 1538 aa24.4■■□□□ 1.5
AC060234.2-201ENST00000428825 NCAPD3P42695 1498 aa24.35■■□□□ 1.49
AC060234.2-201ENST00000428825 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
AC060234.2-201ENST00000428825 SYNJ1O43426 1573 aa24.21■■□□□ 1.47
AC060234.2-201ENST00000428825 EEA1Q15075 1411 aa24.15■■□□□ 1.46
AC060234.2-201ENST00000428825 SOGA1O94964 1423 aa24.14■■□□□ 1.46
AC060234.2-201ENST00000428825 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.11■■□□□ 1.45
AC060234.2-201ENST00000428825 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.07■■□□□ 1.44
AC060234.2-201ENST00000428825 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.06■■□□□ 1.44
AC060234.2-201ENST00000428825 PRDM2Q13029 1718 aa24.06■■□□□ 1.44
AC060234.2-201ENST00000428825 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.05■■□□□ 1.44
AC060234.2-201ENST00000428825 TOP2BQ02880 1626 aa24.05■■□□□ 1.44
AC060234.2-201ENST00000428825 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.01■■□□□ 1.43
AC060234.2-201ENST00000428825 CFTRP13569 1480 aa23.98■■□□□ 1.43
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AC060234.2-201ENST00000428825 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.89■■□□□ 1.42
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AC060234.2-201ENST00000428825 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.74■■□□□ 1.39
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AC060234.2-201ENST00000428825 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.62■■□□□ 1.37
AC060234.2-201ENST00000428825 PRXQ9BXM0 1461 aa23.58■■□□□ 1.37
AC060234.2-201ENST00000428825 KIF27Q86VH2 1401 aa23.55■■□□□ 1.36
AC060234.2-201ENST00000428825 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.52■■□□□ 1.36
AC060234.2-201ENST00000428825 CLIP1P30622 1438 aa23.5■■□□□ 1.35
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AC060234.2-201ENST00000428825 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.47■■□□□ 1.35
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AC060234.2-201ENST00000428825 NESP48681 1621 aa23.45■■□□□ 1.34
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AC060234.2-201ENST00000428825 TOPBP1Q92547 1522 aa23.35■■□□□ 1.33
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AC060234.2-201ENST00000428825 ARAP1Q96P48 1450 aa23.28■■□□□ 1.32
AC060234.2-201ENST00000428825 WDR97A6NE52 1622 aa23.27■■□□□ 1.32
AC060234.2-201ENST00000428825 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.27■■□□□ 1.32
AC060234.2-201ENST00000428825 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
AC060234.2-201ENST00000428825 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.24■■□□□ 1.31
AC060234.2-201ENST00000428825 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
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AC060234.2-201ENST00000428825 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.21■■□□□ 1.31
AC060234.2-201ENST00000428825 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.19■■□□□ 1.3
AC060234.2-201ENST00000428825 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.18■■□□□ 1.3
AC060234.2-201ENST00000428825 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
AC060234.2-201ENST00000428825 CUL7Q14999 1698 aa23.15■■□□□ 1.3
AC060234.2-201ENST00000428825 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.15■■□□□ 1.3
AC060234.2-201ENST00000428825 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
AC060234.2-201ENST00000428825 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.1■■□□□ 1.29
AC060234.2-201ENST00000428825 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.04■■□□□ 1.28
AC060234.2-201ENST00000428825 APLP2Q06481 763 aa23.04■■□□□ 1.28
AC060234.2-201ENST00000428825 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
AC060234.2-201ENST00000428825 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
AC060234.2-201ENST00000428825 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.93■■□□□ 1.26
AC060234.2-201ENST00000428825 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.92■■□□□ 1.26
AC060234.2-201ENST00000428825 PBRM1Q86U86 1689 aa22.9■■□□□ 1.26
AC060234.2-201ENST00000428825 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
AC060234.2-201ENST00000428825 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.9■■□□□ 1.26
AC060234.2-201ENST00000428825 MAP3K1Q13233 1512 aa22.9■■□□□ 1.26
AC060234.2-201ENST00000428825 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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