RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
UBXN4-204ENST00000426921 JPH4Q96JJ6 628 aa36.31■■■■□ 3.4
UBXN4-204ENST00000426921 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.23■■■■□ 3.39
UBXN4-204ENST00000426921 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.13■■■■□ 3.37
UBXN4-204ENST00000426921 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.94■■■■□ 3.34
UBXN4-204ENST00000426921 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.9■■■■□ 3.34
UBXN4-204ENST00000426921 IQGAP2Q13576 1575 aa35.9■■■■□ 3.34
UBXN4-204ENST00000426921 MAPKBP1O60336 1514 aa35.9■■■■□ 3.34
UBXN4-204ENST00000426921 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.85■■■■□ 3.33
UBXN4-204ENST00000426921 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.82■■■■□ 3.32
UBXN4-204ENST00000426921 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.8■■■■□ 3.32
UBXN4-204ENST00000426921 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.8■■■■□ 3.32
UBXN4-204ENST00000426921 PTPRGP23470 1445 aa35.79■■■■□ 3.32
UBXN4-204ENST00000426921 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.77■■■■□ 3.32
UBXN4-204ENST00000426921 DIP2BQ9P265 1576 aa35.74■■■■□ 3.31
UBXN4-204ENST00000426921 DISP1Q96F81 1524 aa35.73■■■■□ 3.31
UBXN4-204ENST00000426921 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.72■■■■□ 3.31
UBXN4-204ENST00000426921 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.66■■■■□ 3.3
UBXN4-204ENST00000426921 ABCC2Q92887 1545 aa35.63■■■■□ 3.29
UBXN4-204ENST00000426921 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.63■■■■□ 3.29
UBXN4-204ENST00000426921 KIAA0556O60303 1618 aa35.59■■■■□ 3.29
UBXN4-204ENST00000426921 PRXQ9BXM0 1461 aa35.58■■■■□ 3.29
UBXN4-204ENST00000426921 UACAQ9BZF9 1416 aa35.56■■■■□ 3.28
UBXN4-204ENST00000426921 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.56■■■■□ 3.28
UBXN4-204ENST00000426921 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
UBXN4-204ENST00000426921 ASXL2Q76L83 1435 aa35.46■■■■□ 3.27
UBXN4-204ENST00000426921 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.46■■■■□ 3.27
UBXN4-204ENST00000426921 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.45■■■■□ 3.27
UBXN4-204ENST00000426921 GOLGA3Q08378 1498 aa35.41■■■■□ 3.26
UBXN4-204ENST00000426921 GLI2P10070 1586 aa35.4■■■■□ 3.26
UBXN4-204ENST00000426921 TSPOAP1O95153 1857 aa35.34■■■■□ 3.25
UBXN4-204ENST00000426921 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
UBXN4-204ENST00000426921 KDM6BO15054 1643 aa35.32■■■■□ 3.25
UBXN4-204ENST00000426921 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
UBXN4-204ENST00000426921 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
UBXN4-204ENST00000426921 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
UBXN4-204ENST00000426921 ABCA8O94911 1581 aa35.25■■■■□ 3.23
UBXN4-204ENST00000426921 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.25■■■■□ 3.23
UBXN4-204ENST00000426921 EEA1Q15075 1411 aa35.24■■■■□ 3.23
UBXN4-204ENST00000426921 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.2■■■■□ 3.23
UBXN4-204ENST00000426921 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.17■■■■□ 3.22
UBXN4-204ENST00000426921 SAMD9Q5K651 1589 aa35.11■■■■□ 3.21
UBXN4-204ENST00000426921 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.06■■■■□ 3.2
UBXN4-204ENST00000426921 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
UBXN4-204ENST00000426921 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.96■■■■□ 3.19
UBXN4-204ENST00000426921 P3H3Q8IVL6 736 aa34.95■■■■□ 3.19
UBXN4-204ENST00000426921 KIF21BO75037 1637 aa34.95■■■■□ 3.18
UBXN4-204ENST00000426921 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
UBXN4-204ENST00000426921 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.93■■■■□ 3.18
UBXN4-204ENST00000426921 ATP10BO94823 1461 aa34.92■■■■□ 3.18
UBXN4-204ENST00000426921 CD109Q6YHK3 1445 aa34.89■■■■□ 3.18
UBXN4-204ENST00000426921 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.88■■■■□ 3.17
UBXN4-204ENST00000426921 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.84■■■■□ 3.17
UBXN4-204ENST00000426921 KCNH8Q96L42 1107 aa34.83■■■■□ 3.17
UBXN4-204ENST00000426921 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.8■■■■□ 3.16
UBXN4-204ENST00000426921 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.79■■■■□ 3.16
UBXN4-204ENST00000426921 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
UBXN4-204ENST00000426921 ARID3CA6NKF2 412 aa34.76■■■■□ 3.16
UBXN4-204ENST00000426921 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.75■■■■□ 3.15
UBXN4-204ENST00000426921 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.74■■■■□ 3.15
UBXN4-204ENST00000426921 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
UBXN4-204ENST00000426921 ADGRL1O94910 1474 aa34.65■■■■□ 3.14
UBXN4-204ENST00000426921 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.65■■■■□ 3.14
UBXN4-204ENST00000426921 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.6■■■■□ 3.13
UBXN4-204ENST00000426921 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
UBXN4-204ENST00000426921 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
UBXN4-204ENST00000426921 NEO1Q92859 1461 aa34.54■■■■□ 3.12
UBXN4-204ENST00000426921 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
UBXN4-204ENST00000426921 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.48■■■■□ 3.11
UBXN4-204ENST00000426921 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.47■■■■□ 3.11
UBXN4-204ENST00000426921 FMN1Q68DA7 1419 aa34.45■■■■□ 3.11
UBXN4-204ENST00000426921 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
UBXN4-204ENST00000426921 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.41■■■■□ 3.15e-6■■□□□ 11.8
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UBXN4-204ENST00000426921 HECW1Q76N89 1606 aa34.38■■■■□ 3.09
UBXN4-204ENST00000426921 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.38■■■■□ 3.09
UBXN4-204ENST00000426921 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.36■■■■□ 3.09
UBXN4-204ENST00000426921 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.33■■■■□ 3.09
UBXN4-204ENST00000426921 RAPGEF3O95398 923 aa34.32■■■■□ 3.08
UBXN4-204ENST00000426921 FANCAO15360 1455 aa34.3■■■■□ 3.08
UBXN4-204ENST00000426921 AKNAQ7Z591 1439 aa34.28■■■■□ 3.08
UBXN4-204ENST00000426921 RICTORQ6R327 1708 aa34.25■■■■□ 3.07
UBXN4-204ENST00000426921 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
UBXN4-204ENST00000426921 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.2■■■■□ 3.07
UBXN4-204ENST00000426921 PLCH2O75038 1416 aa34.19■■■■□ 3.06
UBXN4-204ENST00000426921 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.17■■■■□ 3.06
UBXN4-204ENST00000426921 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
UBXN4-204ENST00000426921 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.15■■■■□ 3.06
UBXN4-204ENST00000426921 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
UBXN4-204ENST00000426921 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.15■■■■□ 3.06
UBXN4-204ENST00000426921 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
UBXN4-204ENST00000426921 KIF14Q15058 1648 aa34.12■■■■□ 3.05
UBXN4-204ENST00000426921 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.11■■■■□ 3.05
UBXN4-204ENST00000426921 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.1■■■■□ 3.05
UBXN4-204ENST00000426921 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.1■■■■□ 3.05
UBXN4-204ENST00000426921 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
UBXN4-204ENST00000426921 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.09■■■■□ 3.05
UBXN4-204ENST00000426921 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.07■■■■□ 3.04
UBXN4-204ENST00000426921 CLIP1P30622 1438 aa34.06■■■■□ 3.04
UBXN4-204ENST00000426921 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.06■■■■□ 3.04
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