RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.12■■■■■ 5.93
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UBXN4-204ENST00000426921 ABCC9O60706 1549 aa46.32■■■■■ 5.01
UBXN4-204ENST00000426921 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.29■■■■■ 4.68
UBXN4-204ENST00000426921 NACADO15069 1562 aa44.08■■■■■ 4.65
UBXN4-204ENST00000426921 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.64■■■■■ 4.58
UBXN4-204ENST00000426921 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.62■■■■■ 4.57
UBXN4-204ENST00000426921 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
UBXN4-204ENST00000426921 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.27■■■■■ 4.52
UBXN4-204ENST00000426921 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.21■■■■■ 4.51
UBXN4-204ENST00000426921 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.16■■■■■ 4.5
UBXN4-204ENST00000426921 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.1■■■■■ 4.49
UBXN4-204ENST00000426921 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.01■■■■■ 4.48
UBXN4-204ENST00000426921 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.56■■■■■ 4.4
UBXN4-204ENST00000426921 SCRIBQ14160 1630 aa42.47■■■■■ 4.39
UBXN4-204ENST00000426921 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
UBXN4-204ENST00000426921 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.91■■■■■ 4.3
UBXN4-204ENST00000426921 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.74■■■■■ 4.27
UBXN4-204ENST00000426921 NCAPD3P42695 1498 aa40.69■■■■■ 4.1
UBXN4-204ENST00000426921 SMARCA4P51532 1647 aa40.6■■■■■ 4.09
UBXN4-204ENST00000426921 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.58■■■■■ 4.09
UBXN4-204ENST00000426921 SMARCA2P51531 1590 aa40.49■■■■■ 4.07
UBXN4-204ENST00000426921 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
UBXN4-204ENST00000426921 HMGXB3Q12766 1538 aa40.44■■■■■ 4.06
UBXN4-204ENST00000426921 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.28■■■■■ 4.04
UBXN4-204ENST00000426921 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
UBXN4-204ENST00000426921 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.13■■■■■ 4.01
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UBXN4-204ENST00000426921 NESP48681 1621 aa39.88■■■■□ 3.97
UBXN4-204ENST00000426921 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.72■■■■□ 3.95
UBXN4-204ENST00000426921 WIZO95785 1651 aa39.64■■■■□ 3.94
UBXN4-204ENST00000426921 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.52■■■■□ 3.92
UBXN4-204ENST00000426921 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
UBXN4-204ENST00000426921 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.45■■■■□ 3.91
UBXN4-204ENST00000426921 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.42■■■■□ 3.9
UBXN4-204ENST00000426921 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
UBXN4-204ENST00000426921 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.4■■■■□ 3.9
UBXN4-204ENST00000426921 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
UBXN4-204ENST00000426921 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.11■■■■□ 3.85
UBXN4-204ENST00000426921 CFTRP13569 1480 aa39.06■■■■□ 3.84
UBXN4-204ENST00000426921 WDR62O43379 1518 aa39.04■■■■□ 3.84
UBXN4-204ENST00000426921 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.99■■■■□ 3.83
UBXN4-204ENST00000426921 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.97■■■■□ 3.83
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.73■■■■□ 3.79
UBXN4-204ENST00000426921 PRDM2Q13029 1718 aa38.69■■■■□ 3.78
UBXN4-204ENST00000426921 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.64■■■■□ 3.78
UBXN4-204ENST00000426921 TOPBP1Q92547 1522 aa38.27■■■■□ 3.72
UBXN4-204ENST00000426921 ABCC8Q09428 1581 aa38.23■■■■□ 3.71
UBXN4-204ENST00000426921 IFT140Q96RY7 1462 aa38.22■■■■□ 3.71
UBXN4-204ENST00000426921 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.17■■■■□ 3.7
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
UBXN4-204ENST00000426921 OSCARQ8IYS5 282 aa38.03■■■■□ 3.68
UBXN4-204ENST00000426921 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
UBXN4-204ENST00000426921 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
UBXN4-204ENST00000426921 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
UBXN4-204ENST00000426921 TRIM41Q8WV44 630 aa37.77■■■■□ 3.64
UBXN4-204ENST00000426921 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.75■■■■□ 3.632e-8■■■□□ 15.9
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UBXN4-204ENST00000426921 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.7■■■■□ 3.63
UBXN4-204ENST00000426921 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.68■■■■□ 3.62
UBXN4-204ENST00000426921 SOGA1O94964 1423 aa37.68■■■■□ 3.62
UBXN4-204ENST00000426921 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
UBXN4-204ENST00000426921 WDR97A6NE52 1622 aa37.64■■■■□ 3.62
UBXN4-204ENST00000426921 CHD1O14646 1710 aa37.57■■■■□ 3.6
UBXN4-204ENST00000426921 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.57■■■■□ 3.6
UBXN4-204ENST00000426921 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.57■■■■□ 3.6
UBXN4-204ENST00000426921 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.57■■■■□ 3.6
UBXN4-204ENST00000426921 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
UBXN4-204ENST00000426921 ARHGEF11O15085 1522 aa37.49■■■■□ 3.59
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UBXN4-204ENST00000426921 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.38■■■■□ 3.57
UBXN4-204ENST00000426921 GRIN2BQ13224 1484 aa37.37■■■■□ 3.57
UBXN4-204ENST00000426921 FBLN2P98095 1184 aa37.34■■■■□ 3.57
UBXN4-204ENST00000426921 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.31■■■■□ 3.56
UBXN4-204ENST00000426921 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.26■■■■□ 3.55
UBXN4-204ENST00000426921 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.25■■■■□ 3.55
UBXN4-204ENST00000426921 SYNJ2O15056 1496 aa37.23■■■■□ 3.55
UBXN4-204ENST00000426921 PBRM1Q86U86 1689 aa37.23■■■■□ 3.55
UBXN4-204ENST00000426921 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.21■■■■□ 3.55
UBXN4-204ENST00000426921 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.2■■■■□ 3.55
UBXN4-204ENST00000426921 TOP2BQ02880 1626 aa37.19■■■■□ 3.54
UBXN4-204ENST00000426921 SYNJ1O43426 1573 aa37.18■■■■□ 3.54
UBXN4-204ENST00000426921 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
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UBXN4-204ENST00000426921 ARAP1Q96P48 1450 aa37.14■■■■□ 3.54
UBXN4-204ENST00000426921 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.07■■■■□ 3.52
UBXN4-204ENST00000426921 ADAMTS12P58397 1594 aa36.94■■■■□ 3.5
UBXN4-204ENST00000426921 GRIN2AQ12879 1464 aa36.9■■■■□ 3.5
UBXN4-204ENST00000426921 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.85■■■■□ 3.49
UBXN4-204ENST00000426921 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.82■■■■□ 3.48
UBXN4-204ENST00000426921 NUP160Q12769 1436 aa36.8■■■■□ 3.48
UBXN4-204ENST00000426921 CEP170Q5SW79 1584 aa36.75■■■■□ 3.47
UBXN4-204ENST00000426921 SHROOM2Q13796 1616 aa36.62■■■■□ 3.45
UBXN4-204ENST00000426921 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.58■■■■□ 3.45
UBXN4-204ENST00000426921 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
UBXN4-204ENST00000426921 KIF27Q86VH2 1401 aa36.43■■■■□ 3.42
UBXN4-204ENST00000426921 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.42■■■■□ 3.42
UBXN4-204ENST00000426921 IGF1RP08069 1367 aa36.38■■■■□ 3.41
UBXN4-204ENST00000426921 CUL7Q14999 1698 aa36.36■■■■□ 3.41
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