RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.17■■■□□ 2.1
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.08■■■□□ 2.09
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.64■■■□□ 2.02
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.6■■■□□ 2.01
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 HECW1Q76N89 1606 aa27.58■■■□□ 2.01
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.57■■■□□ 2
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.55■■■□□ 2
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEP170Q5SW79 1584 aa27.38■■□□□ 1.97
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.37■■□□□ 1.97
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTPRKQ15262 1439 aa27.35■■□□□ 1.97
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAIPQ13075 1403 aa27.23■■□□□ 1.95
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MIA2Q96PC5 1412 aa27.23■■□□□ 1.95
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UACAQ9BZF9 1416 aa27.17■■□□□ 1.94
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.16■■□□□ 1.94
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.15■■□□□ 1.94
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.15■■□□□ 1.94
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MIER1Q8N108 512 aa27.13■■□□□ 1.93
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 JPH4Q96JJ6 628 aa27.13■■□□□ 1.93
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.13■■□□□ 1.93
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKNAQ7Z591 1439 aa27.11■■□□□ 1.93
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEUROD1Q13562 356 aa27.1■■□□□ 1.93
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.1■■□□□ 1.93
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.03■■□□□ 1.92
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.02■■□□□ 1.92
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCA8O94911 1581 aa27■■□□□ 1.91
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DAPK1P53355 1430 aa26.99■■□□□ 1.91
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KDM6BO15054 1643 aa26.98■■□□□ 1.91
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.98■■□□□ 1.91
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF14Q15058 1648 aa26.96■■□□□ 1.91
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHD1O14646 1710 aa26.95■■□□□ 1.91
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCC5O15440 1437 aa26.94■■□□□ 1.9
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ROCK1Q13464 1354 aa26.93■■□□□ 1.9
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
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