RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421462.5

PKP4-204, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 3,099 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-204ENST00000421462 P3H3Q8IVL6 736 aa23.3■■□□□ 1.32
PKP4-204ENST00000421462 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.25■■□□□ 1.31
PKP4-204ENST00000421462 CCER2I3L3R5 266 aa23.23■■□□□ 1.31
PKP4-204ENST00000421462 PRXQ9BXM0 1461 aa23.21■■□□□ 1.31
PKP4-204ENST00000421462 CUX2O14529 1486 aa23.2■■□□□ 1.3
PKP4-204ENST00000421462 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.17■■□□□ 1.3
PKP4-204ENST00000421462 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.14■■□□□ 1.3
PKP4-204ENST00000421462 TOP2BQ02880 1626 aa23.14■■□□□ 1.29
PKP4-204ENST00000421462 NBR1Q14596 966 aa23.12■■□□□ 1.29
PKP4-204ENST00000421462 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.12■■□□□ 1.29
PKP4-204ENST00000421462 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.12■■□□□ 1.29
PKP4-204ENST00000421462 TONSLQ96HA7 1378 aa23.11■■□□□ 1.29
PKP4-204ENST00000421462 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PKP4-204ENST00000421462 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.11■■□□□ 1.29
PKP4-204ENST00000421462 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.1■■□□□ 1.29
PKP4-204ENST00000421462 KIF27Q86VH2 1401 aa23.09■■□□□ 1.29
PKP4-204ENST00000421462 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PKP4-204ENST00000421462 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.05■■□□□ 1.28
PKP4-204ENST00000421462 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.01■■□□□ 1.27
PKP4-204ENST00000421462 BICRAQ9NZM4 1560 aa23■■□□□ 1.27
PKP4-204ENST00000421462 CCDC184Q52MB2 194 aa23■■□□□ 1.27
PKP4-204ENST00000421462 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.99■■□□□ 1.27
PKP4-204ENST00000421462 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.96■■□□□ 1.27
PKP4-204ENST00000421462 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.96■■□□□ 1.27
PKP4-204ENST00000421462 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.95■■□□□ 1.26
PKP4-204ENST00000421462 TIAM1Q13009 1591 aa22.94■■□□□ 1.26
PKP4-204ENST00000421462 CUX1P39880 1505 aa22.94■■□□□ 1.26
PKP4-204ENST00000421462 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP4-204ENST00000421462 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PKP4-204ENST00000421462 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PKP4-204ENST00000421462 MRS2Q9HD23 443 aa22.86■■□□□ 1.25
PKP4-204ENST00000421462 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PKP4-204ENST00000421462 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.85■■□□□ 1.25
PKP4-204ENST00000421462 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP4-204ENST00000421462 IGF1RP08069 1367 aa22.82■■□□□ 1.24
PKP4-204ENST00000421462 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.81■■□□□ 1.24
PKP4-204ENST00000421462 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.8■■□□□ 1.24
PKP4-204ENST00000421462 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.78■■□□□ 1.24
PKP4-204ENST00000421462 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.78■■□□□ 1.24
PKP4-204ENST00000421462 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.75■■□□□ 1.23
PKP4-204ENST00000421462 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PKP4-204ENST00000421462 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
PKP4-204ENST00000421462 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.73■■□□□ 1.23
PKP4-204ENST00000421462 FOXD1Q16676 465 aa22.73■■□□□ 1.23
PKP4-204ENST00000421462 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PKP4-204ENST00000421462 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PKP4-204ENST00000421462 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.72■■□□□ 1.23
PKP4-204ENST00000421462 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PKP4-204ENST00000421462 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PKP4-204ENST00000421462 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PKP4-204ENST00000421462 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.7■■□□□ 1.22
PKP4-204ENST00000421462 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PKP4-204ENST00000421462 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PKP4-204ENST00000421462 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.68■■□□□ 1.22
PKP4-204ENST00000421462 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PKP4-204ENST00000421462 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.67■■□□□ 1.22
PKP4-204ENST00000421462 PTPRKQ15262 1439 aa22.66■■□□□ 1.22
PKP4-204ENST00000421462 MAP3K1Q13233 1512 aa22.65■■□□□ 1.22
PKP4-204ENST00000421462 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.221e-9■■□□□ 14.2
PKP4-204ENST00000421462 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
PKP4-204ENST00000421462 UACAQ9BZF9 1416 aa22.63■■□□□ 1.21
PKP4-204ENST00000421462 AKNAQ7Z591 1439 aa22.62■■□□□ 1.21
PKP4-204ENST00000421462 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.62■■□□□ 1.21
PKP4-204ENST00000421462 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.6■■□□□ 1.21
PKP4-204ENST00000421462 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.6■■□□□ 1.21
PKP4-204ENST00000421462 ARID3CA6NKF2 412 aa22.6■■□□□ 1.21
PKP4-204ENST00000421462 IL27Q8NEV9 243 aa22.58■■□□□ 1.2
PKP4-204ENST00000421462 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PKP4-204ENST00000421462 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PKP4-204ENST00000421462 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.57■■□□□ 1.2
PKP4-204ENST00000421462 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PKP4-204ENST00000421462 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PKP4-204ENST00000421462 NAIPQ13075 1403 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP4-204ENST00000421462 HFM1A2PYH4 1435 aa22.53■■□□□ 1.2
PKP4-204ENST00000421462 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP4-204ENST00000421462 CCDC7Q96M83 1385 aa22.51■■□□□ 1.19
PKP4-204ENST00000421462 CFTRP13569 1480 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP4-204ENST00000421462 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.5■■□□□ 1.19
PKP4-204ENST00000421462 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.49■■□□□ 1.19
PKP4-204ENST00000421462 FMN1Q68DA7 1419 aa22.48■■□□□ 1.19
PKP4-204ENST00000421462 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.47■■□□□ 1.19
PKP4-204ENST00000421462 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PKP4-204ENST00000421462 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.46■■□□□ 1.19
PKP4-204ENST00000421462 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.45■■□□□ 1.18
PKP4-204ENST00000421462 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.45■■□□□ 1.18
PKP4-204ENST00000421462 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.44■■□□□ 1.18
PKP4-204ENST00000421462 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.44■■□□□ 1.18
PKP4-204ENST00000421462 NUDCQ9Y266 331 aa22.44■■□□□ 1.18
PKP4-204ENST00000421462 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.183e-7■■■■□ 24.5
PKP4-204ENST00000421462 NEFMP07197 916 aa22.42■■□□□ 1.18
PKP4-204ENST00000421462 NCAPD3P42695 1498 aa22.38■■□□□ 1.17
PKP4-204ENST00000421462 NCOA2Q15596 1464 aa22.38■■□□□ 1.17
PKP4-204ENST00000421462 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.38■■□□□ 1.17
PKP4-204ENST00000421462 NCOA1Q15788 1441 aa22.36■■□□□ 1.17
PKP4-204ENST00000421462 TMC1Q8TDI8 760 aa22.36■■□□□ 1.17
PKP4-204ENST00000421462 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.36■■□□□ 1.17
PKP4-204ENST00000421462 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.33■■□□□ 1.16
PKP4-204ENST00000421462 SKAP1Q86WV1 359 aa22.32■■□□□ 1.16
PKP4-204ENST00000421462 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PKP4-204ENST00000421462 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
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