RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416427.5

RANBP1-204, Transcript of RAN binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene RANBP1, Length 645 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1-204ENST00000416427 CUL7Q14999 1698 aa43.54■■■■■ 4.56
RANBP1-204ENST00000416427 JPH4Q96JJ6 628 aa43.5■■■■■ 4.55
RANBP1-204ENST00000416427 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.32■■■■■ 4.52
RANBP1-204ENST00000416427 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.29■■■■■ 4.52
RANBP1-204ENST00000416427 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.06■■■■■ 4.48
RANBP1-204ENST00000416427 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.06■■■■■ 4.48
RANBP1-204ENST00000416427 IQGAP2Q13576 1575 aa43.03■■■■■ 4.48
RANBP1-204ENST00000416427 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
RANBP1-204ENST00000416427 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.96■■■■■ 4.47
RANBP1-204ENST00000416427 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.94■■■■■ 4.47
RANBP1-204ENST00000416427 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.89■■■■■ 4.46
RANBP1-204ENST00000416427 PTPRGP23470 1445 aa42.88■■■■■ 4.46
RANBP1-204ENST00000416427 MAPKBP1O60336 1514 aa42.87■■■■■ 4.45
RANBP1-204ENST00000416427 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.81■■■■■ 4.44
RANBP1-204ENST00000416427 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.8■■■■■ 4.44
RANBP1-204ENST00000416427 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.78■■■■■ 4.44
RANBP1-204ENST00000416427 DIP2BQ9P265 1576 aa42.77■■■■■ 4.44
RANBP1-204ENST00000416427 DISP1Q96F81 1524 aa42.76■■■■■ 4.44
RANBP1-204ENST00000416427 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.7■■■■■ 4.43
RANBP1-204ENST00000416427 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.7■■■■■ 4.43
RANBP1-204ENST00000416427 KIAA0556O60303 1618 aa42.64■■■■■ 4.42
RANBP1-204ENST00000416427 ABCC2Q92887 1545 aa42.62■■■■■ 4.41
RANBP1-204ENST00000416427 TSPOAP1O95153 1857 aa42.58■■■■■ 4.41
RANBP1-204ENST00000416427 UACAQ9BZF9 1416 aa42.56■■■■■ 4.4
RANBP1-204ENST00000416427 PRXQ9BXM0 1461 aa42.55■■■■■ 4.4
RANBP1-204ENST00000416427 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.53■■■■■ 4.4
RANBP1-204ENST00000416427 ASXL2Q76L83 1435 aa42.46■■■■■ 4.39
RANBP1-204ENST00000416427 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.39■■■■■ 4.38
RANBP1-204ENST00000416427 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.38
RANBP1-204ENST00000416427 GOLGA3Q08378 1498 aa42.37■■■■■ 4.37
RANBP1-204ENST00000416427 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
RANBP1-204ENST00000416427 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.36■■■■■ 4.37
RANBP1-204ENST00000416427 KDM6BO15054 1643 aa42.35■■■■■ 4.37
RANBP1-204ENST00000416427 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.29■■■■■ 4.36
RANBP1-204ENST00000416427 GLI2P10070 1586 aa42.27■■■■■ 4.36
RANBP1-204ENST00000416427 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
RANBP1-204ENST00000416427 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
RANBP1-204ENST00000416427 ABCA8O94911 1581 aa42.19■■■■■ 4.34
RANBP1-204ENST00000416427 P3H3Q8IVL6 736 aa42.14■■■■■ 4.34
RANBP1-204ENST00000416427 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
RANBP1-204ENST00000416427 EEA1Q15075 1411 aa42.13■■■■■ 4.34
RANBP1-204ENST00000416427 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.13■■■■■ 4.33
RANBP1-204ENST00000416427 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.1■■■■■ 4.33
RANBP1-204ENST00000416427 SAMD9Q5K651 1589 aa42.03■■■■■ 4.32
RANBP1-204ENST00000416427 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
RANBP1-204ENST00000416427 ARID3CA6NKF2 412 aa41.97■■■■■ 4.31
RANBP1-204ENST00000416427 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.93■■■■■ 4.3
RANBP1-204ENST00000416427 KCNH8Q96L42 1107 aa41.93■■■■■ 4.3
RANBP1-204ENST00000416427 KIF21BO75037 1637 aa41.87■■■■■ 4.29
RANBP1-204ENST00000416427 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
RANBP1-204ENST00000416427 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.87■■■■■ 4.29
RANBP1-204ENST00000416427 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.84■■■■■ 4.29
RANBP1-204ENST00000416427 ATP10BO94823 1461 aa41.83■■■■■ 4.29
RANBP1-204ENST00000416427 CD109Q6YHK3 1445 aa41.8■■■■■ 4.28
RANBP1-204ENST00000416427 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.8■■■■■ 4.28
RANBP1-204ENST00000416427 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.79■■■■■ 4.28
RANBP1-204ENST00000416427 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.76■■■■■ 4.28
RANBP1-204ENST00000416427 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.72■■■■■ 4.27
RANBP1-204ENST00000416427 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.72■■■■■ 4.27
RANBP1-204ENST00000416427 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
RANBP1-204ENST00000416427 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
RANBP1-204ENST00000416427 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
RANBP1-204ENST00000416427 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.64■■■■■ 4.26
RANBP1-204ENST00000416427 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.58■■■■■ 4.25
RANBP1-204ENST00000416427 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
RANBP1-204ENST00000416427 ADGRL1O94910 1474 aa41.52■■■■■ 4.24
RANBP1-204ENST00000416427 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.39■■■■■ 4.22
RANBP1-204ENST00000416427 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.35■■■■■ 4.21
RANBP1-204ENST00000416427 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
RANBP1-204ENST00000416427 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.34■■■■■ 4.21
RANBP1-204ENST00000416427 NEO1Q92859 1461 aa41.28■■■■■ 4.2
RANBP1-204ENST00000416427 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
RANBP1-204ENST00000416427 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.25■■■■■ 4.19
RANBP1-204ENST00000416427 FMN1Q68DA7 1419 aa41.24■■■■■ 4.19
RANBP1-204ENST00000416427 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.23■■■■■ 4.191e-21■■■□□ 17.3
RANBP1-204ENST00000416427 HECW1Q76N89 1606 aa41.23■■■■■ 4.19
RANBP1-204ENST00000416427 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.23■■■■■ 4.19
RANBP1-204ENST00000416427 RAPGEF3O95398 923 aa41.22■■■■■ 4.19
RANBP1-204ENST00000416427 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.16■■■■■ 4.18
RANBP1-204ENST00000416427 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.11■■■■■ 4.17
RANBP1-204ENST00000416427 FANCAO15360 1455 aa41.1■■■■■ 4.17
RANBP1-204ENST00000416427 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.07■■■■■ 4.17
RANBP1-204ENST00000416427 AKNAQ7Z591 1439 aa41.06■■■■■ 4.16
RANBP1-204ENST00000416427 RICTORQ6R327 1708 aa41.04■■■■■ 4.16
RANBP1-204ENST00000416427 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
RANBP1-204ENST00000416427 KIF14Q15058 1648 aa40.98■■■■■ 4.15
RANBP1-204ENST00000416427 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.96■■■■■ 4.15
RANBP1-204ENST00000416427 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
RANBP1-204ENST00000416427 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
RANBP1-204ENST00000416427 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.92■■■■■ 4.14
RANBP1-204ENST00000416427 PLCH2O75038 1416 aa40.91■■■■■ 4.14
RANBP1-204ENST00000416427 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.88■■■■■ 4.13
RANBP1-204ENST00000416427 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
RANBP1-204ENST00000416427 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
RANBP1-204ENST00000416427 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.86■■■■■ 4.13
RANBP1-204ENST00000416427 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.84■■■■■ 4.13
RANBP1-204ENST00000416427 CLIP1P30622 1438 aa40.84■■■■■ 4.13
RANBP1-204ENST00000416427 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.84■■■■■ 4.13
RANBP1-204ENST00000416427 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.83■■■■■ 4.13
RANBP1-204ENST00000416427 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.81■■■■■ 4.12
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