RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416427.5

RANBP1-204, Transcript of RAN binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene RANBP1, Length 645 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1-204ENST00000416427 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.35■■■■■ 7.57
RANBP1-204ENST00000416427 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.83■■■■■ 6.53
RANBP1-204ENST00000416427 ABCC9O60706 1549 aa55.56■■■■■ 6.49
RANBP1-204ENST00000416427 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.98■■■■■ 6.07
RANBP1-204ENST00000416427 NACADO15069 1562 aa52.65■■■■■ 6.02
RANBP1-204ENST00000416427 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.59■■■■■ 6.01
RANBP1-204ENST00000416427 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.94■■■■■ 5.91
RANBP1-204ENST00000416427 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.91■■■■■ 5.9
RANBP1-204ENST00000416427 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.77■■■■■ 5.88
RANBP1-204ENST00000416427 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.75■■■■■ 5.88
RANBP1-204ENST00000416427 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.75■■■■■ 5.87
RANBP1-204ENST00000416427 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.44■■■■■ 5.83
RANBP1-204ENST00000416427 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.44■■■■■ 5.82
RANBP1-204ENST00000416427 SCRIBQ14160 1630 aa51■■■■■ 5.75
RANBP1-204ENST00000416427 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.64■■■■■ 5.7
RANBP1-204ENST00000416427 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.19■■■■■ 5.63
RANBP1-204ENST00000416427 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.15■■■■■ 5.62
RANBP1-204ENST00000416427 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.96■■■■■ 5.59
RANBP1-204ENST00000416427 SMARCA4P51532 1647 aa48.62■■■■■ 5.37
RANBP1-204ENST00000416427 NCAPD3P42695 1498 aa48.56■■■■■ 5.36
RANBP1-204ENST00000416427 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.52■■■■■ 5.36
RANBP1-204ENST00000416427 SMARCA2P51531 1590 aa48.41■■■■■ 5.34
RANBP1-204ENST00000416427 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.39■■■■■ 5.34
RANBP1-204ENST00000416427 HMGXB3Q12766 1538 aa48.28■■■■■ 5.32
RANBP1-204ENST00000416427 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.11■■■■■ 5.29
RANBP1-204ENST00000416427 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.1■■■■■ 5.29
RANBP1-204ENST00000416427 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.06■■■■■ 5.28
RANBP1-204ENST00000416427 ERCC6Q03468 1493 aa47.94■■■■■ 5.26
RANBP1-204ENST00000416427 NESP48681 1621 aa47.83■■■■■ 5.25
RANBP1-204ENST00000416427 CUX2O14529 1486 aa47.64■■■■■ 5.22
RANBP1-204ENST00000416427 WIZO95785 1651 aa47.6■■■■■ 5.21
RANBP1-204ENST00000416427 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.49■■■■■ 5.19
RANBP1-204ENST00000416427 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.29■■■■■ 5.16
RANBP1-204ENST00000416427 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.27■■■■■ 5.16
RANBP1-204ENST00000416427 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.2■■■■■ 5.15
RANBP1-204ENST00000416427 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.17■■■■■ 5.14
RANBP1-204ENST00000416427 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.16■■■■■ 5.14
RANBP1-204ENST00000416427 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.12■■■■■ 5.13
RANBP1-204ENST00000416427 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.95■■■■■ 5.11
RANBP1-204ENST00000416427 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.78■■■■■ 5.08
RANBP1-204ENST00000416427 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.68■■■■■ 5.06
RANBP1-204ENST00000416427 CFTRP13569 1480 aa46.67■■■■■ 5.06
RANBP1-204ENST00000416427 WDR62O43379 1518 aa46.65■■■■■ 5.06
RANBP1-204ENST00000416427 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.65■■■■■ 5.06
RANBP1-204ENST00000416427 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.4■■■■■ 5.02
RANBP1-204ENST00000416427 PRDM2Q13029 1718 aa46.37■■■■■ 5.01
RANBP1-204ENST00000416427 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.27■■■■■ 5
RANBP1-204ENST00000416427 TOPBP1Q92547 1522 aa45.82■■■■■ 4.92
RANBP1-204ENST00000416427 IFT140Q96RY7 1462 aa45.69■■■■■ 4.91
RANBP1-204ENST00000416427 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.68■■■■■ 4.9
RANBP1-204ENST00000416427 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
RANBP1-204ENST00000416427 ABCC8Q09428 1581 aa45.66■■■■■ 4.9
RANBP1-204ENST00000416427 OSCARQ8IYS5 282 aa45.51■■■■■ 4.88
RANBP1-204ENST00000416427 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.45■■■■■ 4.87
RANBP1-204ENST00000416427 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.45■■■■■ 4.87
RANBP1-204ENST00000416427 TRIM41Q8WV44 630 aa45.43■■■■■ 4.86
RANBP1-204ENST00000416427 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
RANBP1-204ENST00000416427 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
RANBP1-204ENST00000416427 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.27■■■■■ 4.843e-10■■■■■ 32.6
RANBP1-204ENST00000416427 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.23■■■■■ 4.83
RANBP1-204ENST00000416427 CUX1P39880 1505 aa45.16■■■■■ 4.82
RANBP1-204ENST00000416427 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.16■■■■■ 4.82
RANBP1-204ENST00000416427 SOGA1O94964 1423 aa45.15■■■■■ 4.82
RANBP1-204ENST00000416427 CHD1O14646 1710 aa45.1■■■■■ 4.81
RANBP1-204ENST00000416427 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.05■■■■■ 4.8
RANBP1-204ENST00000416427 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.01■■■■■ 4.8
RANBP1-204ENST00000416427 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.01■■■■■ 4.8
RANBP1-204ENST00000416427 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.01■■■■■ 4.8
RANBP1-204ENST00000416427 FBLN2P98095 1184 aa44.94■■■■■ 4.78
RANBP1-204ENST00000416427 WDR97A6NE52 1622 aa44.88■■■■■ 4.78
RANBP1-204ENST00000416427 ARHGEF11O15085 1522 aa44.86■■■■■ 4.77
RANBP1-204ENST00000416427 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.84■■■■■ 4.77
RANBP1-204ENST00000416427 GRIN2BQ13224 1484 aa44.72■■■■■ 4.75
RANBP1-204ENST00000416427 PBRM1Q86U86 1689 aa44.69■■■■■ 4.74
RANBP1-204ENST00000416427 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
RANBP1-204ENST00000416427 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.62■■■■■ 4.73
RANBP1-204ENST00000416427 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.6■■■■■ 4.73
RANBP1-204ENST00000416427 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
RANBP1-204ENST00000416427 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.57■■■■■ 4.73
RANBP1-204ENST00000416427 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.55■■■■■ 4.72
RANBP1-204ENST00000416427 SYNJ1O43426 1573 aa44.54■■■■■ 4.72
RANBP1-204ENST00000416427 TOP2BQ02880 1626 aa44.53■■■■■ 4.72
RANBP1-204ENST00000416427 SYNJ2O15056 1496 aa44.53■■■■■ 4.72
RANBP1-204ENST00000416427 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.51■■■■■ 4.721e-9■□□□□ 8.8
RANBP1-204ENST00000416427 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.5■■■■■ 4.71
RANBP1-204ENST00000416427 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.48■■■■■ 4.71
RANBP1-204ENST00000416427 ARAP1Q96P48 1450 aa44.44■■■■■ 4.7
RANBP1-204ENST00000416427 ADAMTS12P58397 1594 aa44.22■■■■■ 4.67
RANBP1-204ENST00000416427 GRIN2AQ12879 1464 aa44.16■■■■■ 4.66
RANBP1-204ENST00000416427 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.05■■■■■ 4.64
RANBP1-204ENST00000416427 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.03■■■■■ 4.64
RANBP1-204ENST00000416427 CEP170Q5SW79 1584 aa44.03■■■■■ 4.64
RANBP1-204ENST00000416427 NUP160Q12769 1436 aa43.95■■■■■ 4.63
RANBP1-204ENST00000416427 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.93■■■■■ 4.62
RANBP1-204ENST00000416427 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.89■■■■■ 4.62
RANBP1-204ENST00000416427 SHROOM2Q13796 1616 aa43.77■■■■■ 4.6
RANBP1-204ENST00000416427 KIF27Q86VH2 1401 aa43.64■■■■■ 4.58
RANBP1-204ENST00000416427 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.6■■■■■ 4.57
RANBP1-204ENST00000416427 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
RANBP1-204ENST00000416427 IGF1RP08069 1367 aa43.54■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms