RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 CUL7Q14999 1698 aa36.36■■■■□ 3.41
FAAP20-206ENST00000414253 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
FAAP20-206ENST00000414253 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
FAAP20-206ENST00000414253 MAP3K1Q13233 1512 aa36.22■■■■□ 3.39
FAAP20-206ENST00000414253 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.22■■■■□ 3.39
FAAP20-206ENST00000414253 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.2■■■■□ 3.39
FAAP20-206ENST00000414253 TIAM1Q13009 1591 aa36.2■■■■□ 3.39
FAAP20-206ENST00000414253 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.18■■■■□ 3.38
FAAP20-206ENST00000414253 MIER1Q8N108 512 aa36.18■■■■□ 3.38
FAAP20-206ENST00000414253 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.16■■■■□ 3.38
FAAP20-206ENST00000414253 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.14■■■■□ 3.38
FAAP20-206ENST00000414253 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
FAAP20-206ENST00000414253 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
FAAP20-206ENST00000414253 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.11■■■■□ 3.37
FAAP20-206ENST00000414253 P3H3Q8IVL6 736 aa36.11■■■■□ 3.37
FAAP20-206ENST00000414253 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.08■■■■□ 3.37
FAAP20-206ENST00000414253 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.37
FAAP20-206ENST00000414253 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.05■■■■□ 3.36
FAAP20-206ENST00000414253 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.04■■■■□ 3.36
FAAP20-206ENST00000414253 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.01■■■■□ 3.36
FAAP20-206ENST00000414253 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.97■■■■□ 3.35
FAAP20-206ENST00000414253 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.97■■■■□ 3.352e-6■■□□□ 13.2
FAAP20-206ENST00000414253 WDR62O43379 1518 aa35.96■■■■□ 3.35
FAAP20-206ENST00000414253 ERCC6Q03468 1493 aa35.95■■■■□ 3.34
FAAP20-206ENST00000414253 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.95■■■■□ 3.34
FAAP20-206ENST00000414253 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.92■■■■□ 3.34
FAAP20-206ENST00000414253 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
FAAP20-206ENST00000414253 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
FAAP20-206ENST00000414253 MYT1Q01538 1121 aa35.87■■■■□ 3.33
FAAP20-206ENST00000414253 SAMD9Q5K651 1589 aa35.85■■■■□ 3.33
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
FAAP20-206ENST00000414253 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.85■■■■□ 3.33
FAAP20-206ENST00000414253 FMN1Q68DA7 1419 aa35.84■■■■□ 3.33
FAAP20-206ENST00000414253 PBRM1Q86U86 1689 aa35.83■■■■□ 3.33
FAAP20-206ENST00000414253 IFT140Q96RY7 1462 aa35.82■■■■□ 3.33
FAAP20-206ENST00000414253 ITGAEP38570 1179 aa35.8■■■■□ 3.32
FAAP20-206ENST00000414253 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.77■■■■□ 3.32
FAAP20-206ENST00000414253 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
FAAP20-206ENST00000414253 GRIN2BQ13224 1484 aa35.72■■■■□ 3.31
FAAP20-206ENST00000414253 ADAMTS12P58397 1594 aa35.67■■■■□ 3.3
FAAP20-206ENST00000414253 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
FAAP20-206ENST00000414253 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.62■■■■□ 3.29
FAAP20-206ENST00000414253 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.61■■■■□ 3.29
FAAP20-206ENST00000414253 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
FAAP20-206ENST00000414253 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.56■■■■□ 3.28
FAAP20-206ENST00000414253 IQGAP2Q13576 1575 aa35.55■■■■□ 3.28
FAAP20-206ENST00000414253 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.53■■■■□ 3.281e-7■■■■□ 21
FAAP20-206ENST00000414253 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.52■■■■□ 3.28
FAAP20-206ENST00000414253 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.45■■■■□ 3.27
FAAP20-206ENST00000414253 MAPKBP1O60336 1514 aa35.4■■■■□ 3.26
FAAP20-206ENST00000414253 NCOA2Q15596 1464 aa35.37■■■■□ 3.25
FAAP20-206ENST00000414253 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.37■■■■□ 3.25
FAAP20-206ENST00000414253 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.36■■■■□ 3.25
FAAP20-206ENST00000414253 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.35■■■■□ 3.25
FAAP20-206ENST00000414253 HECW1Q76N89 1606 aa35.33■■■■□ 3.25
FAAP20-206ENST00000414253 GRIN2AQ12879 1464 aa35.33■■■■□ 3.25
FAAP20-206ENST00000414253 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.3■■■■□ 3.24
FAAP20-206ENST00000414253 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.3■■■■□ 3.24
FAAP20-206ENST00000414253 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
FAAP20-206ENST00000414253 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.28■■■■□ 3.24
FAAP20-206ENST00000414253 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
FAAP20-206ENST00000414253 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
FAAP20-206ENST00000414253 ARHGEF11O15085 1522 aa35.25■■■■□ 3.23
FAAP20-206ENST00000414253 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
FAAP20-206ENST00000414253 FBLN2P98095 1184 aa35.24■■■■□ 3.23
FAAP20-206ENST00000414253 SYNJ2O15056 1496 aa35.22■■■■□ 3.23
FAAP20-206ENST00000414253 PTPRKQ15262 1439 aa35.19■■■■□ 3.22
FAAP20-206ENST00000414253 KIAA0556O60303 1618 aa35.17■■■■□ 3.22
FAAP20-206ENST00000414253 DISP1Q96F81 1524 aa35.17■■■■□ 3.22
FAAP20-206ENST00000414253 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.16■■■■□ 3.22
FAAP20-206ENST00000414253 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
FAAP20-206ENST00000414253 CEP170Q5SW79 1584 aa35.13■■■■□ 3.21
FAAP20-206ENST00000414253 HFM1A2PYH4 1435 aa35.12■■■■□ 3.21
FAAP20-206ENST00000414253 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.07■■■■□ 3.2
FAAP20-206ENST00000414253 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
FAAP20-206ENST00000414253 ARID3CA6NKF2 412 aa35.02■■■■□ 3.2
FAAP20-206ENST00000414253 NAIPQ13075 1403 aa35.02■■■■□ 3.2
FAAP20-206ENST00000414253 NUP160Q12769 1436 aa35.01■■■■□ 3.2
FAAP20-206ENST00000414253 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.98■■■■□ 3.19
FAAP20-206ENST00000414253 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
FAAP20-206ENST00000414253 UACAQ9BZF9 1416 aa34.96■■■■□ 3.19
FAAP20-206ENST00000414253 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.96■■■■□ 3.19
FAAP20-206ENST00000414253 MIA2Q96PC5 1412 aa34.96■■■■□ 3.19
FAAP20-206ENST00000414253 JPH4Q96JJ6 628 aa34.94■■■■□ 3.18
FAAP20-206ENST00000414253 KCNH8Q96L42 1107 aa34.87■■■■□ 3.17
FAAP20-206ENST00000414253 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.84■■■■□ 3.17
FAAP20-206ENST00000414253 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.82■■■■□ 3.17
FAAP20-206ENST00000414253 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.82■■■■□ 3.16
FAAP20-206ENST00000414253 AKNAQ7Z591 1439 aa34.81■■■■□ 3.16
FAAP20-206ENST00000414253 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa34.8■■■■□ 3.16
FAAP20-206ENST00000414253 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
FAAP20-206ENST00000414253 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.79■■■■□ 3.16
FAAP20-206ENST00000414253 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.77■■■■□ 3.16
FAAP20-206ENST00000414253 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
FAAP20-206ENST00000414253 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
FAAP20-206ENST00000414253 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
FAAP20-206ENST00000414253 KDM6BO15054 1643 aa34.69■■■■□ 3.14
FAAP20-206ENST00000414253 TONSLQ96HA7 1378 aa34.69■■■■□ 3.14
FAAP20-206ENST00000414253 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
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