RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409972.5

RBMS1-205, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RBMS1, Length 1,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-205ENST00000409972 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
RBMS1-205ENST00000409972 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
RBMS1-205ENST00000409972 GRIN2AQ12879 1464 aa34.14■■■■□ 3.06
RBMS1-205ENST00000409972 SYNJ2O15056 1496 aa34.13■■■■□ 3.05
RBMS1-205ENST00000409972 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
RBMS1-205ENST00000409972 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.05■■■■□ 3.04
RBMS1-205ENST00000409972 P3H3Q8IVL6 736 aa34.04■■■■□ 3.04
RBMS1-205ENST00000409972 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.03■■■■□ 3.04
RBMS1-205ENST00000409972 IQGAP2Q13576 1575 aa34.02■■■■□ 3.04
RBMS1-205ENST00000409972 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
RBMS1-205ENST00000409972 SAMD9Q5K651 1589 aa34■■■■□ 3.03
RBMS1-205ENST00000409972 FBLN2P98095 1184 aa34■■■■□ 3.03
RBMS1-205ENST00000409972 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.97■■■■□ 3.03
RBMS1-205ENST00000409972 CEP170Q5SW79 1584 aa33.97■■■■□ 3.03
RBMS1-205ENST00000409972 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.96■■■■□ 3.03
RBMS1-205ENST00000409972 NUP160Q12769 1436 aa33.9■■■■□ 3.02
RBMS1-205ENST00000409972 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
RBMS1-205ENST00000409972 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.87■■■■□ 3.01
RBMS1-205ENST00000409972 CHD1O14646 1710 aa33.84■■■■□ 3.01
RBMS1-205ENST00000409972 APLP2Q06481 763 aa33.83■■■■□ 3.01
RBMS1-205ENST00000409972 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
RBMS1-205ENST00000409972 FMN1Q68DA7 1419 aa33.74■■■□□ 2.99
RBMS1-205ENST00000409972 DISP1Q96F81 1524 aa33.74■■■□□ 2.99
RBMS1-205ENST00000409972 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
RBMS1-205ENST00000409972 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.7■■■□□ 2.99
RBMS1-205ENST00000409972 KIAA0556O60303 1618 aa33.69■■■□□ 2.98
RBMS1-205ENST00000409972 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.68■■■□□ 2.98
RBMS1-205ENST00000409972 JPH4Q96JJ6 628 aa33.66■■■□□ 2.98
RBMS1-205ENST00000409972 TIAM1Q13009 1591 aa33.65■■■□□ 2.98
RBMS1-205ENST00000409972 MAP3K1Q13233 1512 aa33.64■■■□□ 2.98
RBMS1-205ENST00000409972 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
RBMS1-205ENST00000409972 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.57■■■□□ 2.96
RBMS1-205ENST00000409972 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.57■■■□□ 2.96
RBMS1-205ENST00000409972 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.49■■■□□ 2.95
RBMS1-205ENST00000409972 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.49■■■□□ 2.95
RBMS1-205ENST00000409972 SHROOM2Q13796 1616 aa33.45■■■□□ 2.95
RBMS1-205ENST00000409972 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
RBMS1-205ENST00000409972 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.42■■■□□ 2.94
RBMS1-205ENST00000409972 HECW1Q76N89 1606 aa33.41■■■□□ 2.94
RBMS1-205ENST00000409972 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.36■■■□□ 2.93
RBMS1-205ENST00000409972 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
RBMS1-205ENST00000409972 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.32■■■□□ 2.92
RBMS1-205ENST00000409972 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.31■■■□□ 2.92
RBMS1-205ENST00000409972 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.29■■■□□ 2.92
RBMS1-205ENST00000409972 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
RBMS1-205ENST00000409972 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
RBMS1-205ENST00000409972 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.25■■■□□ 2.91
RBMS1-205ENST00000409972 ARID3CA6NKF2 412 aa33.25■■■□□ 2.91
RBMS1-205ENST00000409972 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.23■■■□□ 2.91
RBMS1-205ENST00000409972 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
RBMS1-205ENST00000409972 ABCA8O94911 1581 aa33.22■■■□□ 2.91
RBMS1-205ENST00000409972 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.22■■■□□ 2.91
RBMS1-205ENST00000409972 PTPRGP23470 1445 aa33.21■■■□□ 2.91
RBMS1-205ENST00000409972 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.17■■■□□ 2.9
RBMS1-205ENST00000409972 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.12■■■□□ 2.89
RBMS1-205ENST00000409972 OSCARQ8IYS5 282 aa33.11■■■□□ 2.89
RBMS1-205ENST00000409972 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
RBMS1-205ENST00000409972 NCOA2Q15596 1464 aa33.09■■■□□ 2.89
RBMS1-205ENST00000409972 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
RBMS1-205ENST00000409972 ARHGEF11O15085 1522 aa33.05■■■□□ 2.88
RBMS1-205ENST00000409972 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
RBMS1-205ENST00000409972 ATP10BO94823 1461 aa33.02■■■□□ 2.88
RBMS1-205ENST00000409972 UACAQ9BZF9 1416 aa33.02■■■□□ 2.88
RBMS1-205ENST00000409972 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
RBMS1-205ENST00000409972 HRCP23327 699 aa32.95■■■□□ 2.87
RBMS1-205ENST00000409972 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.94■■■□□ 2.86
RBMS1-205ENST00000409972 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.94■■■□□ 2.86
RBMS1-205ENST00000409972 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
RBMS1-205ENST00000409972 ABCC2Q92887 1545 aa32.91■■■□□ 2.86
RBMS1-205ENST00000409972 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
RBMS1-205ENST00000409972 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.85■■■□□ 2.85
RBMS1-205ENST00000409972 ITGAEP38570 1179 aa32.84■■■□□ 2.85
RBMS1-205ENST00000409972 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.84■■■□□ 2.85
RBMS1-205ENST00000409972 KIF14Q15058 1648 aa32.83■■■□□ 2.85
RBMS1-205ENST00000409972 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.83■■■□□ 2.85
RBMS1-205ENST00000409972 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.83■■■□□ 2.85
RBMS1-205ENST00000409972 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.79■■■□□ 2.84
RBMS1-205ENST00000409972 MIA2Q96PC5 1412 aa32.74■■■□□ 2.83
RBMS1-205ENST00000409972 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
RBMS1-205ENST00000409972 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
RBMS1-205ENST00000409972 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.72■■■□□ 2.83
RBMS1-205ENST00000409972 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.69■■■□□ 2.82
RBMS1-205ENST00000409972 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
RBMS1-205ENST00000409972 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
RBMS1-205ENST00000409972 PTPRKQ15262 1439 aa32.65■■■□□ 2.82
RBMS1-205ENST00000409972 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.63■■■□□ 2.81
RBMS1-205ENST00000409972 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.62■■■□□ 2.81
RBMS1-205ENST00000409972 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
RBMS1-205ENST00000409972 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
RBMS1-205ENST00000409972 SETD5Q9C0A6 1442 aa32.52■■■□□ 2.8
RBMS1-205ENST00000409972 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.51■■■□□ 2.8
RBMS1-205ENST00000409972 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa32.51■■■□□ 2.79
RBMS1-205ENST00000409972 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
RBMS1-205ENST00000409972 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.5■■■□□ 2.79
RBMS1-205ENST00000409972 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.5■■■□□ 2.79
RBMS1-205ENST00000409972 KCNH8Q96L42 1107 aa32.49■■■□□ 2.79
RBMS1-205ENST00000409972 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.48■■■□□ 2.79
RBMS1-205ENST00000409972 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.46■■■□□ 2.79
RBMS1-205ENST00000409972 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.79
RBMS1-205ENST00000409972 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms