RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 PRXQ9BXM0 1461 aa32.29■■■□□ 2.76
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HOXD12-202ENST00000406506 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.2■■■□□ 2.74
HOXD12-202ENST00000406506 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXD12-202ENST00000406506 IQGAP2Q13576 1575 aa32.15■■■□□ 2.74
HOXD12-202ENST00000406506 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
HOXD12-202ENST00000406506 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXD12-202ENST00000406506 KIF21BO75037 1637 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXD12-202ENST00000406506 ARAP1Q96P48 1450 aa32.11■■■□□ 2.73
HOXD12-202ENST00000406506 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
HOXD12-202ENST00000406506 JPH4Q96JJ6 628 aa32.02■■■□□ 2.72
HOXD12-202ENST00000406506 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.94■■■□□ 2.7
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HOXD12-202ENST00000406506 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.83■■■□□ 2.69
HOXD12-202ENST00000406506 SAMD9Q5K651 1589 aa31.73■■■□□ 2.67
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HOXD12-202ENST00000406506 PTPRGP23470 1445 aa31.64■■■□□ 2.66
HOXD12-202ENST00000406506 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.63■■■□□ 2.65
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HOXD12-202ENST00000406506 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
HOXD12-202ENST00000406506 ABCC2Q92887 1545 aa31.5■■■□□ 2.63
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HOXD12-202ENST00000406506 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.43■■■□□ 2.62
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HOXD12-202ENST00000406506 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.25■■■□□ 2.59
HOXD12-202ENST00000406506 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.23■■■□□ 2.59
HOXD12-202ENST00000406506 FMN1Q68DA7 1419 aa31.22■■■□□ 2.59
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HOXD12-202ENST00000406506 ASXL2Q76L83 1435 aa31.17■■■□□ 2.58
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HOXD12-202ENST00000406506 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.74■■■□□ 2.51
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HOXD12-202ENST00000406506 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
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HOXD12-202ENST00000406506 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
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HOXD12-202ENST00000406506 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.4■■■□□ 2.46
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