RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397098.7

C7orf50-202, Transcript of chromosome 7 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C7orf50, Length 2,131 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf50-202ENST00000397098 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.97■■■■■ 4.47
C7orf50-202ENST00000397098 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.97■■■■■ 4.47
C7orf50-202ENST00000397098 IFT140Q96RY7 1462 aa42.96■■■■■ 4.47
C7orf50-202ENST00000397098 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.96■■■■■ 4.47
C7orf50-202ENST00000397098 P3H3Q8IVL6 736 aa42.93■■■■■ 4.46
C7orf50-202ENST00000397098 PBRM1Q86U86 1689 aa42.9■■■■■ 4.46
C7orf50-202ENST00000397098 MAP3K1Q13233 1512 aa42.88■■■■■ 4.45
C7orf50-202ENST00000397098 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
C7orf50-202ENST00000397098 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.85■■■■■ 4.45
C7orf50-202ENST00000397098 GRIN2BQ13224 1484 aa42.85■■■■■ 4.45
C7orf50-202ENST00000397098 TIAM1Q13009 1591 aa42.79■■■■■ 4.44
C7orf50-202ENST00000397098 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
C7orf50-202ENST00000397098 ADAMTS12P58397 1594 aa42.75■■■■■ 4.43
C7orf50-202ENST00000397098 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
C7orf50-202ENST00000397098 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
C7orf50-202ENST00000397098 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
C7orf50-202ENST00000397098 SAMD9Q5K651 1589 aa42.67■■■■■ 4.42
C7orf50-202ENST00000397098 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.67■■■■■ 4.42
C7orf50-202ENST00000397098 FMN1Q68DA7 1419 aa42.67■■■■■ 4.42
C7orf50-202ENST00000397098 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.67■■■■■ 4.42
C7orf50-202ENST00000397098 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.64■■■■■ 4.42
C7orf50-202ENST00000397098 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
C7orf50-202ENST00000397098 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.57■■■■■ 4.41
C7orf50-202ENST00000397098 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
C7orf50-202ENST00000397098 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.53■■■■■ 4.4
C7orf50-202ENST00000397098 IQGAP2Q13576 1575 aa42.5■■■■■ 4.39
C7orf50-202ENST00000397098 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.49■■■■■ 4.39
C7orf50-202ENST00000397098 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
C7orf50-202ENST00000397098 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.35■■■■■ 4.37
C7orf50-202ENST00000397098 GRIN2AQ12879 1464 aa42.34■■■■■ 4.37
C7orf50-202ENST00000397098 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.31■■■■■ 4.36
C7orf50-202ENST00000397098 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.29■■■■■ 4.36
C7orf50-202ENST00000397098 SYNJ2O15056 1496 aa42.23■■■■■ 4.35
C7orf50-202ENST00000397098 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
C7orf50-202ENST00000397098 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.18■■■■■ 4.34
C7orf50-202ENST00000397098 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.17■■■■■ 4.34
C7orf50-202ENST00000397098 ITGAEP38570 1179 aa42.16■■■■■ 4.34
C7orf50-202ENST00000397098 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.09■■■■■ 4.33
C7orf50-202ENST00000397098 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
C7orf50-202ENST00000397098 FBLN2P98095 1184 aa42.08■■■■■ 4.33
C7orf50-202ENST00000397098 DISP1Q96F81 1524 aa42.07■■■■■ 4.33
C7orf50-202ENST00000397098 HECW1Q76N89 1606 aa42.06■■■■■ 4.32
C7orf50-202ENST00000397098 KIAA0556O60303 1618 aa42.04■■■■■ 4.32
C7orf50-202ENST00000397098 CEP170Q5SW79 1584 aa42.03■■■■■ 4.32
C7orf50-202ENST00000397098 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
C7orf50-202ENST00000397098 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.02■■■■■ 4.327e-7■■■■■ 45.1
C7orf50-202ENST00000397098 CLSPNQ9HAW4 1339 aa42.01■■■■■ 4.32
C7orf50-202ENST00000397098 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.99■■■■■ 4.31
C7orf50-202ENST00000397098 NUP160Q12769 1436 aa41.97■■■■■ 4.31
C7orf50-202ENST00000397098 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
C7orf50-202ENST00000397098 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.95■■■■■ 4.31
C7orf50-202ENST00000397098 NCOA2Q15596 1464 aa41.94■■■■■ 4.3
C7orf50-202ENST00000397098 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
C7orf50-202ENST00000397098 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.88■■■■■ 4.3
C7orf50-202ENST00000397098 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.87■■■■■ 4.29
C7orf50-202ENST00000397098 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.86■■■■■ 4.29
C7orf50-202ENST00000397098 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.85■■■■■ 4.29
C7orf50-202ENST00000397098 JPH4Q96JJ6 628 aa41.83■■■■■ 4.29
C7orf50-202ENST00000397098 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
C7orf50-202ENST00000397098 ARHGEF11O15085 1522 aa41.81■■■■■ 4.28
C7orf50-202ENST00000397098 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.77■■■■■ 4.28
C7orf50-202ENST00000397098 ARID3CA6NKF2 412 aa41.74■■■■■ 4.27
C7orf50-202ENST00000397098 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.73■■■■■ 4.27
C7orf50-202ENST00000397098 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
C7orf50-202ENST00000397098 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.6■■■■■ 4.25
C7orf50-202ENST00000397098 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
C7orf50-202ENST00000397098 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.57■■■■■ 4.25
C7orf50-202ENST00000397098 PTPRKQ15262 1439 aa41.56■■■■■ 4.24
C7orf50-202ENST00000397098 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
C7orf50-202ENST00000397098 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
C7orf50-202ENST00000397098 MIA2Q96PC5 1412 aa41.53■■■■■ 4.24
C7orf50-202ENST00000397098 HFM1A2PYH4 1435 aa41.47■■■■■ 4.23
C7orf50-202ENST00000397098 MAPKBP1O60336 1514 aa41.47■■■■■ 4.23
C7orf50-202ENST00000397098 CHD1O14646 1710 aa41.46■■■■■ 4.23
C7orf50-202ENST00000397098 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
C7orf50-202ENST00000397098 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
C7orf50-202ENST00000397098 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
C7orf50-202ENST00000397098 ABCA8O94911 1581 aa41.37■■■■■ 4.21
C7orf50-202ENST00000397098 NAIPQ13075 1403 aa41.35■■■■■ 4.21
C7orf50-202ENST00000397098 PTPRGP23470 1445 aa41.29■■■■■ 4.2
C7orf50-202ENST00000397098 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.23■■■■■ 4.19
C7orf50-202ENST00000397098 ATP10BO94823 1461 aa41.22■■■■■ 4.19
C7orf50-202ENST00000397098 SHROOM2Q13796 1616 aa41.22■■■■■ 4.19
C7orf50-202ENST00000397098 UACAQ9BZF9 1416 aa41.21■■■■■ 4.19
C7orf50-202ENST00000397098 AKNAQ7Z591 1439 aa41.2■■■■■ 4.19
C7orf50-202ENST00000397098 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.2■■■■■ 4.19
C7orf50-202ENST00000397098 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.19■■■■■ 4.18
C7orf50-202ENST00000397098 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.18■■■■■ 4.18
C7orf50-202ENST00000397098 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
C7orf50-202ENST00000397098 KIF14Q15058 1648 aa41.13■■■■■ 4.17
C7orf50-202ENST00000397098 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.13■■■■■ 4.17
C7orf50-202ENST00000397098 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
C7orf50-202ENST00000397098 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
C7orf50-202ENST00000397098 DAPK1P53355 1430 aa41.12■■■■■ 4.17
C7orf50-202ENST00000397098 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.1■■■■■ 4.17
C7orf50-202ENST00000397098 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.09■■■■■ 4.17
C7orf50-202ENST00000397098 NEUROD1Q13562 356 aa41.08■■■■■ 4.17
C7orf50-202ENST00000397098 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.08■■■■■ 4.17
C7orf50-202ENST00000397098 ABCC5O15440 1437 aa41.07■■■■■ 4.17
C7orf50-202ENST00000397098 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms