RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.2■■■■□ 3.07
CLDN3-201ENST00000395145 PRXQ9BXM0 1461 aa34.2■■■■□ 3.06
CLDN3-201ENST00000395145 ARAP1Q96P48 1450 aa34.15■■■■□ 3.06
CLDN3-201ENST00000395145 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.13■■■■□ 3.05
CLDN3-201ENST00000395145 JPH4Q96JJ6 628 aa34.1■■■■□ 3.05
CLDN3-201ENST00000395145 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.08■■■■□ 3.05
CLDN3-201ENST00000395145 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
CLDN3-201ENST00000395145 IQGAP2Q13576 1575 aa34.02■■■■□ 3.04
CLDN3-201ENST00000395145 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.01■■■■□ 3.03
CLDN3-201ENST00000395145 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
CLDN3-201ENST00000395145 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.96■■■■□ 3.03
CLDN3-201ENST00000395145 KIF21BO75037 1637 aa33.9■■■■□ 3.02
CLDN3-201ENST00000395145 UGGT2Q9NYU1 1516 aa33.86■■■■□ 3.01
CLDN3-201ENST00000395145 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.8■■■■□ 3
CLDN3-201ENST00000395145 DISP1Q96F81 1524 aa33.78■■■■□ 3
CLDN3-201ENST00000395145 KIAA0556O60303 1618 aa33.7■■■□□ 2.99
CLDN3-201ENST00000395145 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.69■■■□□ 2.98
CLDN3-201ENST00000395145 GOLGA3Q08378 1498 aa33.66■■■□□ 2.98
CLDN3-201ENST00000395145 PTPRGP23470 1445 aa33.64■■■□□ 2.98
CLDN3-201ENST00000395145 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.54■■■□□ 2.96
CLDN3-201ENST00000395145 SAMD9Q5K651 1589 aa33.54■■■□□ 2.96
CLDN3-201ENST00000395145 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
CLDN3-201ENST00000395145 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.46■■■□□ 2.95
CLDN3-201ENST00000395145 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
CLDN3-201ENST00000395145 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa33.44■■■□□ 2.94
CLDN3-201ENST00000395145 UACAQ9BZF9 1416 aa33.44■■■□□ 2.94
CLDN3-201ENST00000395145 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.41■■■□□ 2.94
CLDN3-201ENST00000395145 ABCC2Q92887 1545 aa33.4■■■□□ 2.94
CLDN3-201ENST00000395145 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.35■■■□□ 2.93
CLDN3-201ENST00000395145 P3H3Q8IVL6 736 aa33.35■■■□□ 2.93
CLDN3-201ENST00000395145 ABCA8O94911 1581 aa33.34■■■□□ 2.93
CLDN3-201ENST00000395145 MAPKBP1O60336 1514 aa33.33■■■□□ 2.93
CLDN3-201ENST00000395145 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
CLDN3-201ENST00000395145 PLB1Q6P1J6 1458 aa33.32■■■□□ 2.92
CLDN3-201ENST00000395145 FHOD3Q2V2M9 1422 aa33.28■■■□□ 2.92
CLDN3-201ENST00000395145 KDM5BQ9UGL1 1544 aa33.28■■■□□ 2.92
CLDN3-201ENST00000395145 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
CLDN3-201ENST00000395145 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.23■■■□□ 2.91
CLDN3-201ENST00000395145 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.9
CLDN3-201ENST00000395145 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.17■■■□□ 2.9
CLDN3-201ENST00000395145 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.13■■■□□ 2.89
CLDN3-201ENST00000395145 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.13■■■□□ 2.89
CLDN3-201ENST00000395145 ASXL2Q76L83 1435 aa33.11■■■□□ 2.89
CLDN3-201ENST00000395145 DIP2BQ9P265 1576 aa33.09■■■□□ 2.89
CLDN3-201ENST00000395145 FMN1Q68DA7 1419 aa33.07■■■□□ 2.88
CLDN3-201ENST00000395145 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
CLDN3-201ENST00000395145 CLIP1P30622 1438 aa33.04■■■□□ 2.88
CLDN3-201ENST00000395145 ATP10BO94823 1461 aa33.04■■■□□ 2.88
CLDN3-201ENST00000395145 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.99■■■□□ 2.87
CLDN3-201ENST00000395145 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.99■■■□□ 2.87
CLDN3-201ENST00000395145 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.97■■■□□ 2.87
CLDN3-201ENST00000395145 GLI2P10070 1586 aa32.96■■■□□ 2.87
CLDN3-201ENST00000395145 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
CLDN3-201ENST00000395145 CEP162Q5TB80 1403 aa32.94■■■□□ 2.86
CLDN3-201ENST00000395145 ARID3CA6NKF2 412 aa32.92■■■□□ 2.86
CLDN3-201ENST00000395145 HECW1Q76N89 1606 aa32.91■■■□□ 2.86
CLDN3-201ENST00000395145 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.83■■■□□ 2.85
CLDN3-201ENST00000395145 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.82■■■□□ 2.84
CLDN3-201ENST00000395145 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
CLDN3-201ENST00000395145 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.8■■■□□ 2.84
CLDN3-201ENST00000395145 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.8■■■□□ 2.84
CLDN3-201ENST00000395145 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
CLDN3-201ENST00000395145 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.77■■■□□ 2.84
CLDN3-201ENST00000395145 TSPOAP1O95153 1857 aa32.77■■■□□ 2.84
CLDN3-201ENST00000395145 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.76■■■□□ 2.83
CLDN3-201ENST00000395145 KCNH8Q96L42 1107 aa32.74■■■□□ 2.83
CLDN3-201ENST00000395145 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
CLDN3-201ENST00000395145 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
CLDN3-201ENST00000395145 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.73■■■□□ 2.83
CLDN3-201ENST00000395145 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.72■■■□□ 2.83
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.69■■■□□ 2.82
CLDN3-201ENST00000395145 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32.68■■■□□ 2.82
CLDN3-201ENST00000395145 CD109Q6YHK3 1445 aa32.64■■■□□ 2.82
CLDN3-201ENST00000395145 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.62■■■□□ 2.81
CLDN3-201ENST00000395145 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.62■■■□□ 2.81
CLDN3-201ENST00000395145 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
CLDN3-201ENST00000395145 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
CLDN3-201ENST00000395145 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.55■■■□□ 2.8
CLDN3-201ENST00000395145 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP32.55■■■□□ 2.8
CLDN3-201ENST00000395145 KDM6BO15054 1643 aa32.51■■■□□ 2.79
CLDN3-201ENST00000395145 TTC37Q6PGP7 1564 aa32.5■■■□□ 2.79
CLDN3-201ENST00000395145 KIF14Q15058 1648 aa32.49■■■□□ 2.79
CLDN3-201ENST00000395145 NEO1Q92859 1461 aa32.39■■■□□ 2.78
CLDN3-201ENST00000395145 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
CLDN3-201ENST00000395145 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.38■■■□□ 2.77
CLDN3-201ENST00000395145 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.36■■■□□ 2.77
CLDN3-201ENST00000395145 PLCH2O75038 1416 aa32.35■■■□□ 2.77
CLDN3-201ENST00000395145 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.35■■■□□ 2.77
CLDN3-201ENST00000395145 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.34■■■□□ 2.77
CLDN3-201ENST00000395145 TIAM1Q13009 1591 aa32.33■■■□□ 2.77
CLDN3-201ENST00000395145 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.32■■■□□ 2.76
CLDN3-201ENST00000395145 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.31■■■□□ 2.76
CLDN3-201ENST00000395145 FANCAO15360 1455 aa32.31■■■□□ 2.76
CLDN3-201ENST00000395145 MAP3K1Q13233 1512 aa32.3■■■□□ 2.76
CLDN3-201ENST00000395145 AKNAQ7Z591 1439 aa32.25■■■□□ 2.75
CLDN3-201ENST00000395145 PREX2Q70Z35 1606 aa32.24■■■□□ 2.75
CLDN3-201ENST00000395145 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.23■■■□□ 2.75
CLDN3-201ENST00000395145 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.22■■■□□ 2.75
CLDN3-201ENST00000395145 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.2■■■□□ 2.74
CLDN3-201ENST00000395145 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms