RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394765.7

UBXN6-202, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-202ENST00000394765 CHD1O14646 1710 aa28.68■■■□□ 2.18
UBXN6-202ENST00000394765 CEP170Q5SW79 1584 aa28.67■■■□□ 2.18
UBXN6-202ENST00000394765 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.63■■■□□ 2.17
UBXN6-202ENST00000394765 CLIP1P30622 1438 aa28.63■■■□□ 2.17
UBXN6-202ENST00000394765 NUP160Q12769 1436 aa28.62■■■□□ 2.17
UBXN6-202ENST00000394765 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.56■■■□□ 2.16
UBXN6-202ENST00000394765 P3H3Q8IVL6 736 aa28.55■■■□□ 2.16
UBXN6-202ENST00000394765 IQGAP2Q13576 1575 aa28.53■■■□□ 2.16
UBXN6-202ENST00000394765 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.52■■■□□ 2.16
UBXN6-202ENST00000394765 ARAP1Q96P48 1450 aa28.46■■■□□ 2.15
UBXN6-202ENST00000394765 JPH4Q96JJ6 628 aa28.43■■■□□ 2.14
UBXN6-202ENST00000394765 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.4■■■□□ 2.14
UBXN6-202ENST00000394765 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.39■■■□□ 2.13
UBXN6-202ENST00000394765 SAMD9Q5K651 1589 aa28.37■■■□□ 2.13
UBXN6-202ENST00000394765 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.36■■■□□ 2.13
UBXN6-202ENST00000394765 DISP1Q96F81 1524 aa28.35■■■□□ 2.13
UBXN6-202ENST00000394765 OSCARQ8IYS5 282 aa28.35■■■□□ 2.13
UBXN6-202ENST00000394765 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.33■■■□□ 2.13
UBXN6-202ENST00000394765 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
UBXN6-202ENST00000394765 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
UBXN6-202ENST00000394765 KIAA0556O60303 1618 aa28.28■■■□□ 2.12
UBXN6-202ENST00000394765 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.28■■■□□ 2.12
UBXN6-202ENST00000394765 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.26■■■□□ 2.11
UBXN6-202ENST00000394765 SHROOM2Q13796 1616 aa28.24■■■□□ 2.11
UBXN6-202ENST00000394765 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.19■■■□□ 2.1
UBXN6-202ENST00000394765 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
UBXN6-202ENST00000394765 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
UBXN6-202ENST00000394765 FMN1Q68DA7 1419 aa28.12■■■□□ 2.09
UBXN6-202ENST00000394765 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
UBXN6-202ENST00000394765 ARID3CA6NKF2 412 aa28.04■■■□□ 2.08
UBXN6-202ENST00000394765 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.04■■■□□ 2.08
UBXN6-202ENST00000394765 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.04■■■□□ 2.08
UBXN6-202ENST00000394765 PTPRGP23470 1445 aa28.03■■■□□ 2.08
UBXN6-202ENST00000394765 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.98■■■□□ 2.07
UBXN6-202ENST00000394765 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
UBXN6-202ENST00000394765 APLP2Q06481 763 aa27.95■■■□□ 2.06
UBXN6-202ENST00000394765 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.92■■■□□ 2.06
UBXN6-202ENST00000394765 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.92■■■□□ 2.06
UBXN6-202ENST00000394765 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
UBXN6-202ENST00000394765 ARHGEF11O15085 1522 aa27.9■■■□□ 2.06
UBXN6-202ENST00000394765 ABCA8O94911 1581 aa27.89■■■□□ 2.06
UBXN6-202ENST00000394765 HECW1Q76N89 1606 aa27.87■■■□□ 2.05
UBXN6-202ENST00000394765 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
UBXN6-202ENST00000394765 TIAM1Q13009 1591 aa27.86■■■□□ 2.05
UBXN6-202ENST00000394765 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
UBXN6-202ENST00000394765 UACAQ9BZF9 1416 aa27.85■■■□□ 2.05
UBXN6-202ENST00000394765 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
UBXN6-202ENST00000394765 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
UBXN6-202ENST00000394765 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.79■■■□□ 2.04
UBXN6-202ENST00000394765 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.79■■■□□ 2.04
UBXN6-202ENST00000394765 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.79■■■□□ 2.04
UBXN6-202ENST00000394765 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.78■■■□□ 2.04
UBXN6-202ENST00000394765 MAP3K1Q13233 1512 aa27.77■■■□□ 2.04
UBXN6-202ENST00000394765 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.76■■■□□ 2.03
UBXN6-202ENST00000394765 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.76■■■□□ 2.03
UBXN6-202ENST00000394765 ABCC2Q92887 1545 aa27.75■■■□□ 2.03
UBXN6-202ENST00000394765 ATP10BO94823 1461 aa27.75■■■□□ 2.03
UBXN6-202ENST00000394765 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.75■■■□□ 2.03
UBXN6-202ENST00000394765 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.73■■■□□ 2.03
UBXN6-202ENST00000394765 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.7■■■□□ 2.03
UBXN6-202ENST00000394765 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.68■■■□□ 2.02
UBXN6-202ENST00000394765 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.68■■■□□ 2.02
UBXN6-202ENST00000394765 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.6■■■□□ 2.01
UBXN6-202ENST00000394765 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
UBXN6-202ENST00000394765 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.58■■■□□ 2
UBXN6-202ENST00000394765 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
UBXN6-202ENST00000394765 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.56■■■□□ 2
UBXN6-202ENST00000394765 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.55■■■□□ 2
UBXN6-202ENST00000394765 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
UBXN6-202ENST00000394765 NCOA2Q15596 1464 aa27.52■■■□□ 2
UBXN6-202ENST00000394765 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
UBXN6-202ENST00000394765 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.5■■□□□ 1.99
UBXN6-202ENST00000394765 KIF14Q15058 1648 aa27.48■■□□□ 1.99
UBXN6-202ENST00000394765 KCNH8Q96L42 1107 aa27.47■■□□□ 1.99
UBXN6-202ENST00000394765 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
UBXN6-202ENST00000394765 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.45■■□□□ 1.98
UBXN6-202ENST00000394765 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.44■■□□□ 1.98
UBXN6-202ENST00000394765 ASXL2Q76L83 1435 aa27.42■■□□□ 1.98
UBXN6-202ENST00000394765 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.37■■□□□ 1.97
UBXN6-202ENST00000394765 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.35■■□□□ 1.97
UBXN6-202ENST00000394765 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.35■■□□□ 1.97
UBXN6-202ENST00000394765 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
UBXN6-202ENST00000394765 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.34■■□□□ 1.97
UBXN6-202ENST00000394765 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.962e-6■■□□□ 11.5
UBXN6-202ENST00000394765 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.32■■□□□ 1.96
UBXN6-202ENST00000394765 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.31■■□□□ 1.96
UBXN6-202ENST00000394765 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
UBXN6-202ENST00000394765 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
UBXN6-202ENST00000394765 ITGAEP38570 1179 aa27.25■■□□□ 1.95
UBXN6-202ENST00000394765 MAPKBP1O60336 1514 aa27.24■■□□□ 1.95
UBXN6-202ENST00000394765 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
UBXN6-202ENST00000394765 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.21■■□□□ 1.95
UBXN6-202ENST00000394765 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.19■■□□□ 1.94
UBXN6-202ENST00000394765 MIA2Q96PC5 1412 aa27.19■■□□□ 1.94
UBXN6-202ENST00000394765 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.14■■□□□ 1.93
UBXN6-202ENST00000394765 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.14■■□□□ 1.93
UBXN6-202ENST00000394765 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
UBXN6-202ENST00000394765 PREX2Q70Z35 1606 aa27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms