RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394765.7

UBXN6-202, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-202ENST00000394765 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.61■■■■■ 4.25
UBXN6-202ENST00000394765 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.38■■■■□ 3.41
UBXN6-202ENST00000394765 ABCC9O60706 1549 aa35.08■■■■□ 3.21
UBXN6-202ENST00000394765 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
UBXN6-202ENST00000394765 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.69■■■■□ 3.14
UBXN6-202ENST00000394765 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.29■■■■□ 3.08
UBXN6-202ENST00000394765 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.05■■■■□ 3.04
UBXN6-202ENST00000394765 NACADO15069 1562 aa34.04■■■■□ 3.04
UBXN6-202ENST00000394765 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.88■■■■□ 3.01
UBXN6-202ENST00000394765 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.79■■■■□ 3
UBXN6-202ENST00000394765 SCRIBQ14160 1630 aa33.57■■■□□ 2.96
UBXN6-202ENST00000394765 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.21■■■□□ 2.91
UBXN6-202ENST00000394765 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.05■■■□□ 2.88
UBXN6-202ENST00000394765 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.97■■■□□ 2.87
UBXN6-202ENST00000394765 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.48■■■□□ 2.79
UBXN6-202ENST00000394765 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
UBXN6-202ENST00000394765 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.2■■■□□ 2.74
UBXN6-202ENST00000394765 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
UBXN6-202ENST00000394765 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
UBXN6-202ENST00000394765 SMARCA4P51532 1647 aa32.07■■■□□ 2.72
UBXN6-202ENST00000394765 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
UBXN6-202ENST00000394765 WIZO95785 1651 aa31.89■■■□□ 2.7
UBXN6-202ENST00000394765 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.7■■■□□ 2.67
UBXN6-202ENST00000394765 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.66■■■□□ 2.66
UBXN6-202ENST00000394765 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.65■■■□□ 2.66
UBXN6-202ENST00000394765 SMARCA2P51531 1590 aa31.58■■■□□ 2.65
UBXN6-202ENST00000394765 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.5■■■□□ 2.63
UBXN6-202ENST00000394765 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
UBXN6-202ENST00000394765 NCAPD3P42695 1498 aa31.48■■■□□ 2.63
UBXN6-202ENST00000394765 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
UBXN6-202ENST00000394765 HMGXB3Q12766 1538 aa31.34■■■□□ 2.61
UBXN6-202ENST00000394765 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.22■■■□□ 2.59
UBXN6-202ENST00000394765 NESP48681 1621 aa30.67■■■□□ 2.5
UBXN6-202ENST00000394765 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.67■■■□□ 2.5
UBXN6-202ENST00000394765 CFTRP13569 1480 aa30.66■■■□□ 2.5
UBXN6-202ENST00000394765 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.53■■■□□ 2.48
UBXN6-202ENST00000394765 ABCC8Q09428 1581 aa30.46■■■□□ 2.47
UBXN6-202ENST00000394765 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.44■■■□□ 2.46
UBXN6-202ENST00000394765 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.33■■■□□ 2.45
UBXN6-202ENST00000394765 PRDM2Q13029 1718 aa30.32■■■□□ 2.44
UBXN6-202ENST00000394765 TRIM41Q8WV44 630 aa30.25■■■□□ 2.43
UBXN6-202ENST00000394765 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.25■■■□□ 2.43
UBXN6-202ENST00000394765 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.24■■■□□ 2.43
UBXN6-202ENST00000394765 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.18■■■□□ 2.42
UBXN6-202ENST00000394765 SYNJ1O43426 1573 aa30.17■■■□□ 2.42
UBXN6-202ENST00000394765 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.16■■■□□ 2.42
UBXN6-202ENST00000394765 CUX1P39880 1505 aa30.12■■■□□ 2.41
UBXN6-202ENST00000394765 ERCC6Q03468 1493 aa30.05■■■□□ 2.4
UBXN6-202ENST00000394765 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
UBXN6-202ENST00000394765 TOP2BQ02880 1626 aa30■■■□□ 2.39
UBXN6-202ENST00000394765 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.95■■■□□ 2.39
UBXN6-202ENST00000394765 TOPBP1Q92547 1522 aa29.95■■■□□ 2.38
UBXN6-202ENST00000394765 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.92■■■□□ 2.38
UBXN6-202ENST00000394765 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.91■■■□□ 2.38
UBXN6-202ENST00000394765 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.86■■■□□ 2.37
UBXN6-202ENST00000394765 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
UBXN6-202ENST00000394765 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
UBXN6-202ENST00000394765 SOGA1O94964 1423 aa29.79■■■□□ 2.36
UBXN6-202ENST00000394765 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
UBXN6-202ENST00000394765 WDR62O43379 1518 aa29.77■■■□□ 2.36
UBXN6-202ENST00000394765 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.75■■■□□ 2.35
UBXN6-202ENST00000394765 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.74■■■□□ 2.35
UBXN6-202ENST00000394765 CUX2O14529 1486 aa29.64■■■□□ 2.34
UBXN6-202ENST00000394765 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.53■■■□□ 2.32
UBXN6-202ENST00000394765 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
UBXN6-202ENST00000394765 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
UBXN6-202ENST00000394765 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.5■■■□□ 2.31
UBXN6-202ENST00000394765 KIF27Q86VH2 1401 aa29.47■■■□□ 2.31
UBXN6-202ENST00000394765 WDR97A6NE52 1622 aa29.45■■■□□ 2.31
UBXN6-202ENST00000394765 IFT140Q96RY7 1462 aa29.45■■■□□ 2.31
UBXN6-202ENST00000394765 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.45■■■□□ 2.3
UBXN6-202ENST00000394765 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
UBXN6-202ENST00000394765 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.44■■■□□ 2.3
UBXN6-202ENST00000394765 EEA1Q15075 1411 aa29.41■■■□□ 2.3
UBXN6-202ENST00000394765 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.32e-7■■■■■ 33.7
UBXN6-202ENST00000394765 IGF1RP08069 1367 aa29.33■■■□□ 2.29
UBXN6-202ENST00000394765 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.33■■■□□ 2.29
UBXN6-202ENST00000394765 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.32■■■□□ 2.28
UBXN6-202ENST00000394765 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
UBXN6-202ENST00000394765 PRXQ9BXM0 1461 aa29.19■■■□□ 2.26
UBXN6-202ENST00000394765 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.17■■■□□ 2.26
UBXN6-202ENST00000394765 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.16■■■□□ 2.26
UBXN6-202ENST00000394765 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.14■■■□□ 2.26
UBXN6-202ENST00000394765 GRIN2BQ13224 1484 aa29.14■■■□□ 2.26
UBXN6-202ENST00000394765 PBRM1Q86U86 1689 aa29.14■■■□□ 2.25
UBXN6-202ENST00000394765 KIF21BO75037 1637 aa29.1■■■□□ 2.25
UBXN6-202ENST00000394765 GOLGA3Q08378 1498 aa29.07■■■□□ 2.24
UBXN6-202ENST00000394765 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.07■■■□□ 2.24
UBXN6-202ENST00000394765 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
UBXN6-202ENST00000394765 CUL7Q14999 1698 aa29.01■■■□□ 2.24
UBXN6-202ENST00000394765 ADAMTS12P58397 1594 aa28.99■■■□□ 2.23
UBXN6-202ENST00000394765 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.97■■■□□ 2.23
UBXN6-202ENST00000394765 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
UBXN6-202ENST00000394765 FBLN2P98095 1184 aa28.92■■■□□ 2.22
UBXN6-202ENST00000394765 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.89■■■□□ 2.21
UBXN6-202ENST00000394765 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
UBXN6-202ENST00000394765 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
UBXN6-202ENST00000394765 SYNJ2O15056 1496 aa28.85■■■□□ 2.21
UBXN6-202ENST00000394765 GRIN2AQ12879 1464 aa28.81■■■□□ 2.2
UBXN6-202ENST00000394765 CEP162Q5TB80 1403 aa28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms