RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394588.3

NMB-202, Transcript of neuromedin B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NMB, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMB-202ENST00000394588 PRXQ9BXM0 1461 aa44.73■■■■■ 4.75
NMB-202ENST00000394588 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.73■■■■■ 4.75
NMB-202ENST00000394588 ARAP1Q96P48 1450 aa44.72■■■■■ 4.75
NMB-202ENST00000394588 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.67■■■■■ 4.74
NMB-202ENST00000394588 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.63■■■■■ 4.74
NMB-202ENST00000394588 JPH4Q96JJ6 628 aa44.58■■■■■ 4.73
NMB-202ENST00000394588 IQGAP2Q13576 1575 aa44.55■■■■■ 4.72
NMB-202ENST00000394588 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.54■■■■■ 4.72
NMB-202ENST00000394588 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.52■■■■■ 4.72
NMB-202ENST00000394588 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.52■■■■■ 4.72
NMB-202ENST00000394588 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.51■■■■■ 4.72
NMB-202ENST00000394588 KIF21BO75037 1637 aa44.39■■■■■ 4.7
NMB-202ENST00000394588 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.31■■■■■ 4.68
NMB-202ENST00000394588 DISP1Q96F81 1524 aa44.21■■■■■ 4.67
NMB-202ENST00000394588 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.21■■■■■ 4.67
NMB-202ENST00000394588 KIAA0556O60303 1618 aa44.15■■■■■ 4.66
NMB-202ENST00000394588 GOLGA3Q08378 1498 aa44.08■■■■■ 4.65
NMB-202ENST00000394588 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.06■■■■■ 4.64
NMB-202ENST00000394588 PTPRGP23470 1445 aa44■■■■■ 4.63
NMB-202ENST00000394588 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.95■■■■■ 4.63
NMB-202ENST00000394588 SAMD9Q5K651 1589 aa43.92■■■■■ 4.62
NMB-202ENST00000394588 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.91■■■■■ 4.62
NMB-202ENST00000394588 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.61
NMB-202ENST00000394588 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
NMB-202ENST00000394588 UACAQ9BZF9 1416 aa43.74■■■■■ 4.59
NMB-202ENST00000394588 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.74■■■■■ 4.59
NMB-202ENST00000394588 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.73■■■■■ 4.59
NMB-202ENST00000394588 ABCC2Q92887 1545 aa43.72■■■■■ 4.59
NMB-202ENST00000394588 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
NMB-202ENST00000394588 P3H3Q8IVL6 736 aa43.69■■■■■ 4.58
NMB-202ENST00000394588 ABCA8O94911 1581 aa43.65■■■■■ 4.58
NMB-202ENST00000394588 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.64■■■■■ 4.58
NMB-202ENST00000394588 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.61■■■■■ 4.57
NMB-202ENST00000394588 MAPKBP1O60336 1514 aa43.61■■■■■ 4.57
NMB-202ENST00000394588 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.59■■■■■ 4.57
NMB-202ENST00000394588 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
NMB-202ENST00000394588 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.53■■■■■ 4.56
NMB-202ENST00000394588 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.51■■■■■ 4.56
NMB-202ENST00000394588 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.5■■■■■ 4.55
NMB-202ENST00000394588 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.46■■■■■ 4.55
NMB-202ENST00000394588 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.42■■■■■ 4.54
NMB-202ENST00000394588 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.35■■■■■ 4.53
NMB-202ENST00000394588 DIP2BQ9P265 1576 aa43.35■■■■■ 4.53
NMB-202ENST00000394588 ASXL2Q76L83 1435 aa43.34■■■■■ 4.53
NMB-202ENST00000394588 CLIP1P30622 1438 aa43.26■■■■■ 4.52
NMB-202ENST00000394588 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
NMB-202ENST00000394588 FMN1Q68DA7 1419 aa43.25■■■■■ 4.51
NMB-202ENST00000394588 ATP10BO94823 1461 aa43.23■■■■■ 4.51
NMB-202ENST00000394588 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.18■■■■■ 4.5
NMB-202ENST00000394588 WDR7Q9Y4E6 1490 aa43.17■■■■■ 4.5
NMB-202ENST00000394588 ARID3CA6NKF2 412 aa43.16■■■■■ 4.5
NMB-202ENST00000394588 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.16■■■■■ 4.5
NMB-202ENST00000394588 GLI2P10070 1586 aa43.12■■■■■ 4.49
NMB-202ENST00000394588 CEP162Q5TB80 1403 aa43.12■■■■■ 4.49
NMB-202ENST00000394588 HECW1Q76N89 1606 aa43.11■■■■■ 4.49
NMB-202ENST00000394588 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
NMB-202ENST00000394588 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
NMB-202ENST00000394588 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
NMB-202ENST00000394588 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.97■■■■■ 4.47
NMB-202ENST00000394588 TSPOAP1O95153 1857 aa42.97■■■■■ 4.47
NMB-202ENST00000394588 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.97■■■■■ 4.47
NMB-202ENST00000394588 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
NMB-202ENST00000394588 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
NMB-202ENST00000394588 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.95■■■■■ 4.47
NMB-202ENST00000394588 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
NMB-202ENST00000394588 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
NMB-202ENST00000394588 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.89■■■■■ 4.46
NMB-202ENST00000394588 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.87■■■■■ 4.45
NMB-202ENST00000394588 KCNH8Q96L42 1107 aa42.86■■■■■ 4.45
NMB-202ENST00000394588 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.79■■■■■ 4.44
NMB-202ENST00000394588 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.78■■■■■ 4.44
NMB-202ENST00000394588 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.78■■■■■ 4.44
NMB-202ENST00000394588 CD109Q6YHK3 1445 aa42.71■■■■■ 4.43
NMB-202ENST00000394588 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.67■■■■■ 4.42
NMB-202ENST00000394588 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.67■■■■■ 4.42
NMB-202ENST00000394588 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.41
NMB-202ENST00000394588 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.61■■■■■ 4.41
NMB-202ENST00000394588 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
NMB-202ENST00000394588 KDM6BO15054 1643 aa42.6■■■■■ 4.41
NMB-202ENST00000394588 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.6■■■■■ 4.41
NMB-202ENST00000394588 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.6■■■■■ 4.41
NMB-202ENST00000394588 KIF14Q15058 1648 aa42.57■■■■■ 4.4
NMB-202ENST00000394588 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.41■■■■■ 4.38
NMB-202ENST00000394588 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
NMB-202ENST00000394588 NEO1Q92859 1461 aa42.36■■■■■ 4.37
NMB-202ENST00000394588 TIAM1Q13009 1591 aa42.35■■■■■ 4.37
NMB-202ENST00000394588 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.35■■■■■ 4.37
NMB-202ENST00000394588 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.31■■■■■ 4.36
NMB-202ENST00000394588 PLCH2O75038 1416 aa42.31■■■■■ 4.36
NMB-202ENST00000394588 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.3■■■■■ 4.36
NMB-202ENST00000394588 FANCAO15360 1455 aa42.3■■■■■ 4.36
NMB-202ENST00000394588 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.29■■■■■ 4.36
NMB-202ENST00000394588 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.29■■■■■ 4.36
NMB-202ENST00000394588 PREX2Q70Z35 1606 aa42.24■■■■■ 4.35
NMB-202ENST00000394588 MAP3K1Q13233 1512 aa42.23■■■■■ 4.35
NMB-202ENST00000394588 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.23■■■■■ 4.35
NMB-202ENST00000394588 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.23■■■■■ 4.35
NMB-202ENST00000394588 AKNAQ7Z591 1439 aa42.2■■■■■ 4.35
NMB-202ENST00000394588 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.17■■■■■ 4.34
NMB-202ENST00000394588 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.12■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms