RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382120.3

SOD3-201, Transcript of superoxide dismutase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOD3, Length 1,526 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD3-201ENST00000382120 ARAP1Q96P48 1450 aa41.73■■■■■ 4.27
SOD3-201ENST00000382120 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
SOD3-201ENST00000382120 PRXQ9BXM0 1461 aa41.65■■■■■ 4.26
SOD3-201ENST00000382120 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.63■■■■■ 4.26
SOD3-201ENST00000382120 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.59■■■■■ 4.25
SOD3-201ENST00000382120 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.59■■■■■ 4.25
SOD3-201ENST00000382120 EEA1Q15075 1411 aa41.58■■■■■ 4.25
SOD3-201ENST00000382120 JPH4Q96JJ6 628 aa41.57■■■■■ 4.25
SOD3-201ENST00000382120 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
SOD3-201ENST00000382120 IQGAP2Q13576 1575 aa41.48■■■■■ 4.23
SOD3-201ENST00000382120 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.45■■■■■ 4.23
SOD3-201ENST00000382120 KIF21BO75037 1637 aa41.29■■■■■ 4.2
SOD3-201ENST00000382120 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.23■■■■■ 4.19
SOD3-201ENST00000382120 DISP1Q96F81 1524 aa41.21■■■■■ 4.19
SOD3-201ENST00000382120 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.21■■■■■ 4.19
SOD3-201ENST00000382120 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.13■■■■■ 4.17
SOD3-201ENST00000382120 KIAA0556O60303 1618 aa41.12■■■■■ 4.17
SOD3-201ENST00000382120 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
SOD3-201ENST00000382120 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.03■■■■■ 4.16
SOD3-201ENST00000382120 GOLGA3Q08378 1498 aa41.01■■■■■ 4.16
SOD3-201ENST00000382120 PTPRGP23470 1445 aa41■■■■■ 4.15
SOD3-201ENST00000382120 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.98■■■■■ 4.15
SOD3-201ENST00000382120 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
SOD3-201ENST00000382120 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
SOD3-201ENST00000382120 SAMD9Q5K651 1589 aa40.89■■■■■ 4.14
SOD3-201ENST00000382120 P3H3Q8IVL6 736 aa40.87■■■■■ 4.13
SOD3-201ENST00000382120 UACAQ9BZF9 1416 aa40.75■■■■■ 4.11
SOD3-201ENST00000382120 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.72■■■■■ 4.11
SOD3-201ENST00000382120 ABCC2Q92887 1545 aa40.71■■■■■ 4.11
SOD3-201ENST00000382120 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
SOD3-201ENST00000382120 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.69■■■■■ 4.1
SOD3-201ENST00000382120 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.68■■■■■ 4.1
SOD3-201ENST00000382120 ABCA8O94911 1581 aa40.65■■■■■ 4.1
SOD3-201ENST00000382120 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.63■■■■■ 4.1
SOD3-201ENST00000382120 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.61■■■■■ 4.09
SOD3-201ENST00000382120 MAPKBP1O60336 1514 aa40.57■■■■■ 4.09
SOD3-201ENST00000382120 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.56■■■■■ 4.08
SOD3-201ENST00000382120 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
SOD3-201ENST00000382120 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.52■■■■■ 4.08
SOD3-201ENST00000382120 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.5■■■■■ 4.07
SOD3-201ENST00000382120 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.47■■■■■ 4.07
SOD3-201ENST00000382120 ARID3CA6NKF2 412 aa40.42■■■■■ 4.06
SOD3-201ENST00000382120 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.42■■■■■ 4.06
SOD3-201ENST00000382120 ASXL2Q76L83 1435 aa40.41■■■■■ 4.06
SOD3-201ENST00000382120 DIP2BQ9P265 1576 aa40.4■■■■■ 4.06
SOD3-201ENST00000382120 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.38■■■■■ 4.05
SOD3-201ENST00000382120 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
SOD3-201ENST00000382120 CLIP1P30622 1438 aa40.3■■■■■ 4.04
SOD3-201ENST00000382120 ATP10BO94823 1461 aa40.3■■■■■ 4.04
SOD3-201ENST00000382120 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.29■■■■■ 4.04
SOD3-201ENST00000382120 FMN1Q68DA7 1419 aa40.22■■■■■ 4.03
SOD3-201ENST00000382120 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.2■■■■■ 4.03
SOD3-201ENST00000382120 CEP162Q5TB80 1403 aa40.19■■■■■ 4.02
SOD3-201ENST00000382120 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
SOD3-201ENST00000382120 TSPOAP1O95153 1857 aa40.16■■■■■ 4.02
SOD3-201ENST00000382120 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
SOD3-201ENST00000382120 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
SOD3-201ENST00000382120 HECW1Q76N89 1606 aa40.11■■■■■ 4.01
SOD3-201ENST00000382120 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.11■■■■■ 4.01
SOD3-201ENST00000382120 GLI2P10070 1586 aa40.11■■■■■ 4.01
SOD3-201ENST00000382120 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
SOD3-201ENST00000382120 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
SOD3-201ENST00000382120 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
SOD3-201ENST00000382120 KCNH8Q96L42 1107 aa40.06■■■■■ 4
SOD3-201ENST00000382120 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.02■■■■■ 4
SOD3-201ENST00000382120 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
SOD3-201ENST00000382120 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.98■■■■□ 3.99
SOD3-201ENST00000382120 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.89■■■■□ 3.98
SOD3-201ENST00000382120 CFAP43Q8NDM7 1665 aa39.88■■■■□ 3.98
SOD3-201ENST00000382120 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.84■■■■□ 3.97
SOD3-201ENST00000382120 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.83■■■■□ 3.97
SOD3-201ENST00000382120 CD109Q6YHK3 1445 aa39.8■■■■□ 3.96
SOD3-201ENST00000382120 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.77■■■■□ 3.96
SOD3-201ENST00000382120 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa39.74■■■■□ 3.95
SOD3-201ENST00000382120 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.74■■■■□ 3.95
SOD3-201ENST00000382120 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.73■■■■□ 3.95
SOD3-201ENST00000382120 KIF14Q15058 1648 aa39.72■■■■□ 3.95
SOD3-201ENST00000382120 KDM6BO15054 1643 aa39.7■■■■□ 3.95
SOD3-201ENST00000382120 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.68■■■■□ 3.94
SOD3-201ENST00000382120 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
SOD3-201ENST00000382120 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.65■■■■□ 3.94
SOD3-201ENST00000382120 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
SOD3-201ENST00000382120 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
SOD3-201ENST00000382120 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.49■■■■□ 3.91
SOD3-201ENST00000382120 TIAM1Q13009 1591 aa39.44■■■■□ 3.9
SOD3-201ENST00000382120 FANCAO15360 1455 aa39.41■■■■□ 3.9
SOD3-201ENST00000382120 PLCH2O75038 1416 aa39.4■■■■□ 3.9
SOD3-201ENST00000382120 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.4■■■■□ 3.9
SOD3-201ENST00000382120 NEO1Q92859 1461 aa39.39■■■■□ 3.9
SOD3-201ENST00000382120 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.37■■■■□ 3.89
SOD3-201ENST00000382120 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.36■■■■□ 3.89
SOD3-201ENST00000382120 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.36■■■■□ 3.89
SOD3-201ENST00000382120 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.35■■■■□ 3.89
SOD3-201ENST00000382120 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.35■■■■□ 3.89
SOD3-201ENST00000382120 PREX2Q70Z35 1606 aa39.33■■■■□ 3.89
SOD3-201ENST00000382120 AKNAQ7Z591 1439 aa39.32■■■■□ 3.88
SOD3-201ENST00000382120 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.31■■■■□ 3.88
SOD3-201ENST00000382120 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.28■■■■□ 3.88
SOD3-201ENST00000382120 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.26■■■■□ 3.88
SOD3-201ENST00000382120 RAPGEF3O95398 923 aa39.24■■■■□ 3.87
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