RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382034.9

TOM1-201, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TOM1, Length 1,300 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-201ENST00000382034 JPH4Q96JJ6 628 aa26.92■■□□□ 1.9
TOM1-201ENST00000382034 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.87■■□□□ 1.89
TOM1-201ENST00000382034 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
TOM1-201ENST00000382034 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.83■■□□□ 1.89
TOM1-201ENST00000382034 IQGAP2Q13576 1575 aa26.73■■□□□ 1.87
TOM1-201ENST00000382034 PRXQ9BXM0 1461 aa26.71■■□□□ 1.87
TOM1-201ENST00000382034 EEA1Q15075 1411 aa26.71■■□□□ 1.87
TOM1-201ENST00000382034 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.66■■□□□ 1.86
TOM1-201ENST00000382034 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.61■■□□□ 1.85
TOM1-201ENST00000382034 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.61■■□□□ 1.85
TOM1-201ENST00000382034 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.59■■□□□ 1.85
TOM1-201ENST00000382034 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
TOM1-201ENST00000382034 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.56■■□□□ 1.84
TOM1-201ENST00000382034 PTPRGP23470 1445 aa26.54■■□□□ 1.84
TOM1-201ENST00000382034 DISP1Q96F81 1524 aa26.54■■□□□ 1.84
TOM1-201ENST00000382034 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.54■■□□□ 1.84
TOM1-201ENST00000382034 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.49■■□□□ 1.83
TOM1-201ENST00000382034 GOLGA3Q08378 1498 aa26.48■■□□□ 1.83
TOM1-201ENST00000382034 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
TOM1-201ENST00000382034 KIAA0556O60303 1618 aa26.46■■□□□ 1.83
TOM1-201ENST00000382034 MAPKBP1O60336 1514 aa26.44■■□□□ 1.82
TOM1-201ENST00000382034 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.42■■□□□ 1.82
TOM1-201ENST00000382034 KIF21BO75037 1637 aa26.38■■□□□ 1.81
TOM1-201ENST00000382034 UACAQ9BZF9 1416 aa26.37■■□□□ 1.81
TOM1-201ENST00000382034 ABCC2Q92887 1545 aa26.36■■□□□ 1.81
TOM1-201ENST00000382034 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.31■■□□□ 1.8
TOM1-201ENST00000382034 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.3■■□□□ 1.8
TOM1-201ENST00000382034 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
TOM1-201ENST00000382034 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
TOM1-201ENST00000382034 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.27■■□□□ 1.8
TOM1-201ENST00000382034 SAMD9Q5K651 1589 aa26.26■■□□□ 1.79
TOM1-201ENST00000382034 DIP2BQ9P265 1576 aa26.23■■□□□ 1.79
TOM1-201ENST00000382034 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.23■■□□□ 1.79
TOM1-201ENST00000382034 ABCA8O94911 1581 aa26.2■■□□□ 1.79
TOM1-201ENST00000382034 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.18■■□□□ 1.78
TOM1-201ENST00000382034 ASXL2Q76L83 1435 aa26.17■■□□□ 1.78
TOM1-201ENST00000382034 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
TOM1-201ENST00000382034 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.14■■□□□ 1.77
TOM1-201ENST00000382034 GLI2P10070 1586 aa26.12■■□□□ 1.77
TOM1-201ENST00000382034 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
TOM1-201ENST00000382034 P3H3Q8IVL6 736 aa26.07■■□□□ 1.76
TOM1-201ENST00000382034 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.04■■□□□ 1.76
TOM1-201ENST00000382034 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
TOM1-201ENST00000382034 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.01■■□□□ 1.75
TOM1-201ENST00000382034 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.98■■□□□ 1.75
TOM1-201ENST00000382034 ATP10BO94823 1461 aa25.97■■□□□ 1.75
TOM1-201ENST00000382034 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.96■■□□□ 1.75
TOM1-201ENST00000382034 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TOM1-201ENST00000382034 TSPOAP1O95153 1857 aa25.94■■□□□ 1.74
TOM1-201ENST00000382034 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TOM1-201ENST00000382034 FMN1Q68DA7 1419 aa25.9■■□□□ 1.74
TOM1-201ENST00000382034 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.89■■□□□ 1.74
TOM1-201ENST00000382034 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TOM1-201ENST00000382034 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.89■■□□□ 1.73
TOM1-201ENST00000382034 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.88■■□□□ 1.73
TOM1-201ENST00000382034 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.86■■□□□ 1.73
TOM1-201ENST00000382034 KDM6BO15054 1643 aa25.85■■□□□ 1.73
TOM1-201ENST00000382034 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.82■■□□□ 1.72
TOM1-201ENST00000382034 CD109Q6YHK3 1445 aa25.8■■□□□ 1.72
TOM1-201ENST00000382034 KCNH8Q96L42 1107 aa25.8■■□□□ 1.72
TOM1-201ENST00000382034 ARID3CA6NKF2 412 aa25.77■■□□□ 1.72
TOM1-201ENST00000382034 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.77■■□□□ 1.72
TOM1-201ENST00000382034 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
TOM1-201ENST00000382034 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
TOM1-201ENST00000382034 HECW1Q76N89 1606 aa25.75■■□□□ 1.71
TOM1-201ENST00000382034 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.75■■□□□ 1.71
TOM1-201ENST00000382034 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.69■■□□□ 1.7
TOM1-201ENST00000382034 CLIP1P30622 1438 aa25.68■■□□□ 1.7
TOM1-201ENST00000382034 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
TOM1-201ENST00000382034 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.65■■□□□ 1.7
TOM1-201ENST00000382034 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
TOM1-201ENST00000382034 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
TOM1-201ENST00000382034 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.62■■□□□ 1.69
TOM1-201ENST00000382034 NEO1Q92859 1461 aa25.61■■□□□ 1.69
TOM1-201ENST00000382034 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.59■■□□□ 1.69
TOM1-201ENST00000382034 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.59■■□□□ 1.69
TOM1-201ENST00000382034 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
TOM1-201ENST00000382034 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.683e-6■■■■■ 31
TOM1-201ENST00000382034 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
TOM1-201ENST00000382034 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.55■■□□□ 1.68
TOM1-201ENST00000382034 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
TOM1-201ENST00000382034 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.52■■□□□ 1.68
TOM1-201ENST00000382034 CEP162Q5TB80 1403 aa25.51■■□□□ 1.67
TOM1-201ENST00000382034 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.5■■□□□ 1.67
TOM1-201ENST00000382034 KIF14Q15058 1648 aa25.48■■□□□ 1.67
TOM1-201ENST00000382034 PLCH2O75038 1416 aa25.46■■□□□ 1.67
TOM1-201ENST00000382034 FANCAO15360 1455 aa25.45■■□□□ 1.67
TOM1-201ENST00000382034 AKNAQ7Z591 1439 aa25.42■■□□□ 1.66
TOM1-201ENST00000382034 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.42■■□□□ 1.66
TOM1-201ENST00000382034 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
TOM1-201ENST00000382034 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
TOM1-201ENST00000382034 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.37■■□□□ 1.65
TOM1-201ENST00000382034 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.36■■□□□ 1.65
TOM1-201ENST00000382034 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.34■■□□□ 1.65
TOM1-201ENST00000382034 RAPGEF3O95398 923 aa25.34■■□□□ 1.65
TOM1-201ENST00000382034 RICTORQ6R327 1708 aa25.33■■□□□ 1.65
TOM1-201ENST00000382034 ADGRL1O94910 1474 aa25.3■■□□□ 1.64
TOM1-201ENST00000382034 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.3■■□□□ 1.64
TOM1-201ENST00000382034 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.29■■□□□ 1.64
TOM1-201ENST00000382034 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.28■■□□□ 1.64
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