RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380277.6

PXDC1-201, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene PXDC1, Length 1,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-201ENST00000380277 PRXQ9BXM0 1461 aa24.76■■□□□ 1.55
PXDC1-201ENST00000380277 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.72■■□□□ 1.55
PXDC1-201ENST00000380277 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PXDC1-201ENST00000380277 SHROOM2Q13796 1616 aa24.69■■□□□ 1.54
PXDC1-201ENST00000380277 JPH4Q96JJ6 628 aa24.68■■□□□ 1.54
PXDC1-201ENST00000380277 ARAP1Q96P48 1450 aa24.64■■□□□ 1.54
PXDC1-201ENST00000380277 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PXDC1-201ENST00000380277 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.62■■□□□ 1.53
PXDC1-201ENST00000380277 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.61■■□□□ 1.53
PXDC1-201ENST00000380277 IQGAP2Q13576 1575 aa24.59■■□□□ 1.53
PXDC1-201ENST00000380277 KIF21BO75037 1637 aa24.52■■□□□ 1.52
PXDC1-201ENST00000380277 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.49■■□□□ 1.51
PXDC1-201ENST00000380277 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.47■■□□□ 1.51
PXDC1-201ENST00000380277 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.45■■□□□ 1.51
PXDC1-201ENST00000380277 DISP1Q96F81 1524 aa24.43■■□□□ 1.5
PXDC1-201ENST00000380277 GOLGA3Q08378 1498 aa24.41■■□□□ 1.5
PXDC1-201ENST00000380277 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.39■■□□□ 1.49
PXDC1-201ENST00000380277 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.37■■□□□ 1.49
PXDC1-201ENST00000380277 KIAA0556O60303 1618 aa24.35■■□□□ 1.49
PXDC1-201ENST00000380277 PTPRGP23470 1445 aa24.34■■□□□ 1.49
PXDC1-201ENST00000380277 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
PXDC1-201ENST00000380277 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PXDC1-201ENST00000380277 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PXDC1-201ENST00000380277 SAMD9Q5K651 1589 aa24.24■■□□□ 1.47
PXDC1-201ENST00000380277 P3H3Q8IVL6 736 aa24.21■■□□□ 1.47
PXDC1-201ENST00000380277 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.21■■□□□ 1.47
PXDC1-201ENST00000380277 UACAQ9BZF9 1416 aa24.19■■□□□ 1.46
PXDC1-201ENST00000380277 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.16■■□□□ 1.46
PXDC1-201ENST00000380277 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.15■■□□□ 1.46
PXDC1-201ENST00000380277 ABCC2Q92887 1545 aa24.13■■□□□ 1.45
PXDC1-201ENST00000380277 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
PXDC1-201ENST00000380277 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.12■■□□□ 1.45
PXDC1-201ENST00000380277 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.12■■□□□ 1.45
PXDC1-201ENST00000380277 ABCA8O94911 1581 aa24.08■■□□□ 1.45
PXDC1-201ENST00000380277 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.07■■□□□ 1.44
PXDC1-201ENST00000380277 MAPKBP1O60336 1514 aa24.05■■□□□ 1.44
PXDC1-201ENST00000380277 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PXDC1-201ENST00000380277 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.04■■□□□ 1.44
PXDC1-201ENST00000380277 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24■■□□□ 1.43
PXDC1-201ENST00000380277 CLIP1P30622 1438 aa23.98■■□□□ 1.43
PXDC1-201ENST00000380277 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.96■■□□□ 1.43
PXDC1-201ENST00000380277 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PXDC1-201ENST00000380277 FMN1Q68DA7 1419 aa23.95■■□□□ 1.42
PXDC1-201ENST00000380277 ASXL2Q76L83 1435 aa23.95■■□□□ 1.42
PXDC1-201ENST00000380277 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.92■■□□□ 1.42
PXDC1-201ENST00000380277 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PXDC1-201ENST00000380277 ARID3CA6NKF2 412 aa23.91■■□□□ 1.42
PXDC1-201ENST00000380277 CEP162Q5TB80 1403 aa23.91■■□□□ 1.42
PXDC1-201ENST00000380277 ATP10BO94823 1461 aa23.89■■□□□ 1.42
PXDC1-201ENST00000380277 DIP2BQ9P265 1576 aa23.87■■□□□ 1.41
PXDC1-201ENST00000380277 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.87■■□□□ 1.41
PXDC1-201ENST00000380277 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.85■■□□□ 1.41
PXDC1-201ENST00000380277 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.82■■□□□ 1.4
PXDC1-201ENST00000380277 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PXDC1-201ENST00000380277 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
PXDC1-201ENST00000380277 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
PXDC1-201ENST00000380277 HECW1Q76N89 1606 aa23.79■■□□□ 1.4
PXDC1-201ENST00000380277 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
PXDC1-201ENST00000380277 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.78■■□□□ 1.4
PXDC1-201ENST00000380277 GLI2P10070 1586 aa23.76■■□□□ 1.39
PXDC1-201ENST00000380277 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PXDC1-201ENST00000380277 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PXDC1-201ENST00000380277 KCNH8Q96L42 1107 aa23.74■■□□□ 1.39
PXDC1-201ENST00000380277 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.73■■□□□ 1.39
PXDC1-201ENST00000380277 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.71■■□□□ 1.39
PXDC1-201ENST00000380277 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.66■■□□□ 1.38
PXDC1-201ENST00000380277 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
PXDC1-201ENST00000380277 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.64■■□□□ 1.38
PXDC1-201ENST00000380277 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.63■■□□□ 1.37
PXDC1-201ENST00000380277 CD109Q6YHK3 1445 aa23.61■■□□□ 1.37
PXDC1-201ENST00000380277 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.61■■□□□ 1.37
PXDC1-201ENST00000380277 TSPOAP1O95153 1857 aa23.59■■□□□ 1.37
PXDC1-201ENST00000380277 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.59■■□□□ 1.37
PXDC1-201ENST00000380277 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.58■■□□□ 1.36
PXDC1-201ENST00000380277 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PXDC1-201ENST00000380277 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PXDC1-201ENST00000380277 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.56■■□□□ 1.36
PXDC1-201ENST00000380277 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.55■■□□□ 1.36
PXDC1-201ENST00000380277 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
PXDC1-201ENST00000380277 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.49■■□□□ 1.35
PXDC1-201ENST00000380277 KIF14Q15058 1648 aa23.48■■□□□ 1.35
PXDC1-201ENST00000380277 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.44■■□□□ 1.34
PXDC1-201ENST00000380277 KDM6BO15054 1643 aa23.43■■□□□ 1.34
PXDC1-201ENST00000380277 TIAM1Q13009 1591 aa23.41■■□□□ 1.34
PXDC1-201ENST00000380277 PLCH2O75038 1416 aa23.41■■□□□ 1.34
PXDC1-201ENST00000380277 NEO1Q92859 1461 aa23.4■■□□□ 1.34
PXDC1-201ENST00000380277 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PXDC1-201ENST00000380277 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.39■■□□□ 1.33
PXDC1-201ENST00000380277 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.38■■□□□ 1.33
PXDC1-201ENST00000380277 MAP3K1Q13233 1512 aa23.37■■□□□ 1.33
PXDC1-201ENST00000380277 FANCAO15360 1455 aa23.37■■□□□ 1.33
PXDC1-201ENST00000380277 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.35■■□□□ 1.33
PXDC1-201ENST00000380277 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.33■■□□□ 1.33
PXDC1-201ENST00000380277 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.33■■□□□ 1.33
PXDC1-201ENST00000380277 AKNAQ7Z591 1439 aa23.32■■□□□ 1.32
PXDC1-201ENST00000380277 APLP2Q06481 763 aa23.32■■□□□ 1.32
PXDC1-201ENST00000380277 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.32■■□□□ 1.32
PXDC1-201ENST00000380277 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.32■■□□□ 1.32
PXDC1-201ENST00000380277 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PXDC1-201ENST00000380277 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms