RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379567.6

AP5S1-202, Transcript of adaptor related protein complex 5 subunit sigma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene AP5S1, Length 1,791 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1-202ENST00000379567 KIF21BO75037 1637 aa30.42■■■□□ 2.46
AP5S1-202ENST00000379567 ARHGEF11O15085 1522 aa30.35■■■□□ 2.45
AP5S1-202ENST00000379567 SHROOM2Q13796 1616 aa30.34■■■□□ 2.45
AP5S1-202ENST00000379567 JPH4Q96JJ6 628 aa30.33■■■□□ 2.45
AP5S1-202ENST00000379567 IQGAP2Q13576 1575 aa30.32■■■□□ 2.45
AP5S1-202ENST00000379567 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.31■■■□□ 2.44
AP5S1-202ENST00000379567 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.29■■■□□ 2.44
AP5S1-202ENST00000379567 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.29■■■□□ 2.44
AP5S1-202ENST00000379567 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.29■■■□□ 2.44
AP5S1-202ENST00000379567 GOLGA3Q08378 1498 aa30.28■■■□□ 2.44
AP5S1-202ENST00000379567 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.25■■■□□ 2.43
AP5S1-202ENST00000379567 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
AP5S1-202ENST00000379567 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
AP5S1-202ENST00000379567 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.19■■■□□ 2.42
AP5S1-202ENST00000379567 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.16■■■□□ 2.42
AP5S1-202ENST00000379567 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.12■■■□□ 2.41
AP5S1-202ENST00000379567 ARAP1Q96P48 1450 aa30.11■■■□□ 2.41
AP5S1-202ENST00000379567 DISP1Q96F81 1524 aa30.07■■■□□ 2.4
AP5S1-202ENST00000379567 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.06■■■□□ 2.4
AP5S1-202ENST00000379567 KIAA0556O60303 1618 aa30.02■■■□□ 2.4
AP5S1-202ENST00000379567 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
AP5S1-202ENST00000379567 TNIKQ9UKE5 1360 aa29.98■■■□□ 2.39
AP5S1-202ENST00000379567 SAMD9Q5K651 1589 aa29.94■■■□□ 2.38
AP5S1-202ENST00000379567 PTPRGP23470 1445 aa29.93■■■□□ 2.38
AP5S1-202ENST00000379567 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
AP5S1-202ENST00000379567 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.9■■■□□ 2.38
AP5S1-202ENST00000379567 P3H3Q8IVL6 736 aa29.89■■■□□ 2.38
AP5S1-202ENST00000379567 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.79■■■□□ 2.36
AP5S1-202ENST00000379567 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.79■■■□□ 2.36
AP5S1-202ENST00000379567 CLIP1P30622 1438 aa29.75■■■□□ 2.35
AP5S1-202ENST00000379567 UACAQ9BZF9 1416 aa29.74■■■□□ 2.35
AP5S1-202ENST00000379567 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.71■■■□□ 2.35
AP5S1-202ENST00000379567 CEP162Q5TB80 1403 aa29.71■■■□□ 2.35
AP5S1-202ENST00000379567 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.7■■■□□ 2.35
AP5S1-202ENST00000379567 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.7■■■□□ 2.34
AP5S1-202ENST00000379567 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.69■■■□□ 2.34
AP5S1-202ENST00000379567 ABCC2Q92887 1545 aa29.68■■■□□ 2.34
AP5S1-202ENST00000379567 ABCA8O94911 1581 aa29.66■■■□□ 2.34
AP5S1-202ENST00000379567 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.63■■■□□ 2.33
AP5S1-202ENST00000379567 FMN1Q68DA7 1419 aa29.63■■■□□ 2.33
AP5S1-202ENST00000379567 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.58■■■□□ 2.33
AP5S1-202ENST00000379567 KDM5BQ9UGL1 1544 aa29.55■■■□□ 2.32
AP5S1-202ENST00000379567 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
AP5S1-202ENST00000379567 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
AP5S1-202ENST00000379567 MAPKBP1O60336 1514 aa29.48■■■□□ 2.31
AP5S1-202ENST00000379567 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
AP5S1-202ENST00000379567 ARID3CA6NKF2 412 aa29.45■■■□□ 2.31
AP5S1-202ENST00000379567 HECW1Q76N89 1606 aa29.44■■■□□ 2.3
AP5S1-202ENST00000379567 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
AP5S1-202ENST00000379567 ATP10BO94823 1461 aa29.43■■■□□ 2.3
AP5S1-202ENST00000379567 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.42■■■□□ 2.3
AP5S1-202ENST00000379567 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
AP5S1-202ENST00000379567 ASXL2Q76L83 1435 aa29.39■■■□□ 2.3
AP5S1-202ENST00000379567 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
AP5S1-202ENST00000379567 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
AP5S1-202ENST00000379567 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.38■■■□□ 2.29
AP5S1-202ENST00000379567 HRCP23327 699 aa29.35■■■□□ 2.29
AP5S1-202ENST00000379567 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
AP5S1-202ENST00000379567 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
AP5S1-202ENST00000379567 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.33■■■□□ 2.29
AP5S1-202ENST00000379567 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
AP5S1-202ENST00000379567 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.31■■■□□ 2.28
AP5S1-202ENST00000379567 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.29■■■□□ 2.28
AP5S1-202ENST00000379567 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.28■■■□□ 2.28
AP5S1-202ENST00000379567 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.26■■■□□ 2.28
AP5S1-202ENST00000379567 DIP2BQ9P265 1576 aa29.25■■■□□ 2.27
AP5S1-202ENST00000379567 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.24■■■□□ 2.27
AP5S1-202ENST00000379567 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.22■■■□□ 2.27
AP5S1-202ENST00000379567 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
AP5S1-202ENST00000379567 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.2■■■□□ 2.26
AP5S1-202ENST00000379567 KCNH8Q96L42 1107 aa29.19■■■□□ 2.26
AP5S1-202ENST00000379567 GLI2P10070 1586 aa29.16■■■□□ 2.26
AP5S1-202ENST00000379567 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
AP5S1-202ENST00000379567 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.05■■■□□ 2.24
AP5S1-202ENST00000379567 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.05■■■□□ 2.24
AP5S1-202ENST00000379567 TIAM1Q13009 1591 aa29.05■■■□□ 2.24
AP5S1-202ENST00000379567 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.04■■■□□ 2.24
AP5S1-202ENST00000379567 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.03■■■□□ 2.24
AP5S1-202ENST00000379567 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.02■■■□□ 2.24
AP5S1-202ENST00000379567 APLP2Q06481 763 aa29.02■■■□□ 2.24
AP5S1-202ENST00000379567 MAP3K1Q13233 1512 aa29.01■■■□□ 2.24
AP5S1-202ENST00000379567 KIF14Q15058 1648 aa29.01■■■□□ 2.23
AP5S1-202ENST00000379567 CD109Q6YHK3 1445 aa29■■■□□ 2.23
AP5S1-202ENST00000379567 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
AP5S1-202ENST00000379567 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.23
AP5S1-202ENST00000379567 TSPOAP1O95153 1857 aa28.97■■■□□ 2.23
AP5S1-202ENST00000379567 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.96■■■□□ 2.23
AP5S1-202ENST00000379567 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.95■■■□□ 2.22
AP5S1-202ENST00000379567 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.92■■■□□ 2.22
AP5S1-202ENST00000379567 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
AP5S1-202ENST00000379567 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.9■■■□□ 2.22
AP5S1-202ENST00000379567 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
AP5S1-202ENST00000379567 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
AP5S1-202ENST00000379567 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.83■■■□□ 2.21
AP5S1-202ENST00000379567 PLCH2O75038 1416 aa28.83■■■□□ 2.2
AP5S1-202ENST00000379567 NCOA2Q15596 1464 aa28.79■■■□□ 2.2
AP5S1-202ENST00000379567 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.78■■■□□ 2.2
AP5S1-202ENST00000379567 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.77■■■□□ 2.2
AP5S1-202ENST00000379567 FANCAO15360 1455 aa28.77■■■□□ 2.2
AP5S1-202ENST00000379567 NEO1Q92859 1461 aa28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms