RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379567.6

AP5S1-202, Transcript of adaptor related protein complex 5 subunit sigma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene AP5S1, Length 1,791 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1-202ENST00000379567 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.09■■■■■ 4.65
AP5S1-202ENST00000379567 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.02■■■■□ 3.84
AP5S1-202ENST00000379567 ABCC9O60706 1549 aa37.83■■■■□ 3.65
AP5S1-202ENST00000379567 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
AP5S1-202ENST00000379567 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.72■■■■□ 3.47
AP5S1-202ENST00000379567 NACADO15069 1562 aa36.61■■■■□ 3.45
AP5S1-202ENST00000379567 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.56■■■■□ 3.44
AP5S1-202ENST00000379567 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.51■■■■□ 3.43
AP5S1-202ENST00000379567 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.5■■■■□ 3.43
AP5S1-202ENST00000379567 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.7■■■■□ 3.31
AP5S1-202ENST00000379567 SCRIBQ14160 1630 aa35.65■■■■□ 3.3
AP5S1-202ENST00000379567 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.42■■■■□ 3.26
AP5S1-202ENST00000379567 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.41■■■■□ 3.26
AP5S1-202ENST00000379567 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.11■■■■□ 3.21
AP5S1-202ENST00000379567 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
AP5S1-202ENST00000379567 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.35■■■■□ 3.09
AP5S1-202ENST00000379567 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.3■■■■□ 3.08
AP5S1-202ENST00000379567 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.23■■■■□ 3.07
AP5S1-202ENST00000379567 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
AP5S1-202ENST00000379567 SMARCA4P51532 1647 aa34.13■■■■□ 3.05
AP5S1-202ENST00000379567 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.98■■■■□ 3.03
AP5S1-202ENST00000379567 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.85■■■■□ 3.01
AP5S1-202ENST00000379567 SMARCA2P51531 1590 aa33.84■■■■□ 3.01
AP5S1-202ENST00000379567 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.79■■■■□ 3
AP5S1-202ENST00000379567 NCAPD3P42695 1498 aa33.77■■■■□ 3
AP5S1-202ENST00000379567 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
AP5S1-202ENST00000379567 HMGXB3Q12766 1538 aa33.65■■■□□ 2.98
AP5S1-202ENST00000379567 WIZO95785 1651 aa33.63■■■□□ 2.97
AP5S1-202ENST00000379567 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
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AP5S1-202ENST00000379567 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.91
AP5S1-202ENST00000379567 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.91■■■□□ 2.86
AP5S1-202ENST00000379567 NESP48681 1621 aa32.84■■■□□ 2.85
AP5S1-202ENST00000379567 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.83■■■□□ 2.85
AP5S1-202ENST00000379567 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.82■■■□□ 2.84
AP5S1-202ENST00000379567 CFTRP13569 1480 aa32.7■■■□□ 2.83
AP5S1-202ENST00000379567 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.61■■■□□ 2.81
AP5S1-202ENST00000379567 ERCC6Q03468 1493 aa32.6■■■□□ 2.81
AP5S1-202ENST00000379567 PRDM2Q13029 1718 aa32.47■■■□□ 2.79
AP5S1-202ENST00000379567 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.46■■■□□ 2.79
AP5S1-202ENST00000379567 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.44■■■□□ 2.78
AP5S1-202ENST00000379567 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.37■■■□□ 2.77
AP5S1-202ENST00000379567 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
AP5S1-202ENST00000379567 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.24■■■□□ 2.75
AP5S1-202ENST00000379567 WDR62O43379 1518 aa32.12■■■□□ 2.73
AP5S1-202ENST00000379567 CUX2O14529 1486 aa32.09■■■□□ 2.73
AP5S1-202ENST00000379567 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
AP5S1-202ENST00000379567 ABCC8Q09428 1581 aa31.99■■■□□ 2.71
AP5S1-202ENST00000379567 TOPBP1Q92547 1522 aa31.96■■■□□ 2.71
AP5S1-202ENST00000379567 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.96■■■□□ 2.71
AP5S1-202ENST00000379567 CUX1P39880 1505 aa31.85■■■□□ 2.69
AP5S1-202ENST00000379567 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.82■■■□□ 2.68
AP5S1-202ENST00000379567 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
AP5S1-202ENST00000379567 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.7■■■□□ 2.66
AP5S1-202ENST00000379567 SYNJ1O43426 1573 aa31.7■■■□□ 2.66
AP5S1-202ENST00000379567 TOP2BQ02880 1626 aa31.7■■■□□ 2.66
AP5S1-202ENST00000379567 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.67■■■□□ 2.66
AP5S1-202ENST00000379567 IFT140Q96RY7 1462 aa31.67■■■□□ 2.66
AP5S1-202ENST00000379567 SOGA1O94964 1423 aa31.6■■■□□ 2.65
AP5S1-202ENST00000379567 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.57■■■□□ 2.64
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AP5S1-202ENST00000379567 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.55■■■□□ 2.64
AP5S1-202ENST00000379567 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
AP5S1-202ENST00000379567 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.41■■■□□ 2.62
AP5S1-202ENST00000379567 WDR97A6NE52 1622 aa31.4■■■□□ 2.62
AP5S1-202ENST00000379567 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
AP5S1-202ENST00000379567 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
AP5S1-202ENST00000379567 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.37■■■□□ 2.61
AP5S1-202ENST00000379567 TRIM41Q8WV44 630 aa31.35■■■□□ 2.61
AP5S1-202ENST00000379567 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.25■■■□□ 2.59
AP5S1-202ENST00000379567 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.24■■■□□ 2.59
AP5S1-202ENST00000379567 GRIN2BQ13224 1484 aa31.19■■■□□ 2.58
AP5S1-202ENST00000379567 PBRM1Q86U86 1689 aa31.13■■■□□ 2.57
AP5S1-202ENST00000379567 KIF27Q86VH2 1401 aa31.13■■■□□ 2.57
AP5S1-202ENST00000379567 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.09■■■□□ 2.57
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AP5S1-202ENST00000379567 CHD1O14646 1710 aa30.91■■■□□ 2.54
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AP5S1-202ENST00000379567 GRIN2AQ12879 1464 aa30.79■■■□□ 2.52
AP5S1-202ENST00000379567 EEA1Q15075 1411 aa30.78■■■□□ 2.52
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AP5S1-202ENST00000379567 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.69■■■□□ 2.5
AP5S1-202ENST00000379567 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
AP5S1-202ENST00000379567 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.63■■■□□ 2.49
AP5S1-202ENST00000379567 NUP160Q12769 1436 aa30.62■■■□□ 2.49
AP5S1-202ENST00000379567 CEP170Q5SW79 1584 aa30.61■■■□□ 2.49
AP5S1-202ENST00000379567 PRXQ9BXM0 1461 aa30.6■■■□□ 2.49
AP5S1-202ENST00000379567 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.58■■■□□ 2.49
AP5S1-202ENST00000379567 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.44■■■□□ 2.46
AP5S1-202ENST00000379567 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.43■■■□□ 2.46
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