RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378863.8

CRLS1-201, Transcript of cardiolipin synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRLS1, Length 3,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1-201ENST00000378863 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.78■□□□□ 0.92
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CRLS1-201ENST00000378863 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.75■□□□□ 0.91
CRLS1-201ENST00000378863 TONSLQ96HA7 1378 aa20.71■□□□□ 0.91
CRLS1-201ENST00000378863 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.71■□□□□ 0.91
CRLS1-201ENST00000378863 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.69■□□□□ 0.9
CRLS1-201ENST00000378863 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
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CRLS1-201ENST00000378863 ANP32CO43423 234 aa20.66■□□□□ 0.9
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CRLS1-201ENST00000378863 CFTRP13569 1480 aa20.62■□□□□ 0.89
CRLS1-201ENST00000378863 ARAP1Q96P48 1450 aa20.61■□□□□ 0.89
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CRLS1-201ENST00000378863 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.59■□□□□ 0.89
CRLS1-201ENST00000378863 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.59■□□□□ 0.89
CRLS1-201ENST00000378863 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.59■□□□□ 0.89
CRLS1-201ENST00000378863 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.56■□□□□ 0.88
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CRLS1-201ENST00000378863 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.54■□□□□ 0.88
CRLS1-201ENST00000378863 FKBP8Q14318 412 aa20.53■□□□□ 0.88
CRLS1-201ENST00000378863 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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CRLS1-201ENST00000378863 RGL3Q3MIN7 710 aa20.44■□□□□ 0.86
CRLS1-201ENST00000378863 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.43■□□□□ 0.86
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CRLS1-201ENST00000378863 TSPY10P0CW01 314 aa20.43■□□□□ 0.86
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CRLS1-201ENST00000378863 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CRLS1-201ENST00000378863 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CRLS1-201ENST00000378863 FMN1Q68DA7 1419 aa20.32■□□□□ 0.84
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CRLS1-201ENST00000378863 JPH4Q96JJ6 628 aa20.3■□□□□ 0.84
CRLS1-201ENST00000378863 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.841e-6■□□□□ 11.1
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CRLS1-201ENST00000378863 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.21■□□□□ 0.83
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CRLS1-201ENST00000378863 PKD2Q13563 968 aa20.18■□□□□ 0.82
CRLS1-201ENST00000378863 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.18■□□□□ 0.82
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CRLS1-201ENST00000378863 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CRLS1-201ENST00000378863 MYT1Q01538 1121 aa20.13■□□□□ 0.81
CRLS1-201ENST00000378863 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.11■□□□□ 0.81
CRLS1-201ENST00000378863 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
CRLS1-201ENST00000378863 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CRLS1-201ENST00000378863 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.09■□□□□ 0.81
CRLS1-201ENST00000378863 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.08■□□□□ 0.81
CRLS1-201ENST00000378863 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CRLS1-201ENST00000378863 TMC1Q8TDI8 760 aa20.05■□□□□ 0.8
CRLS1-201ENST00000378863 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.03■□□□□ 0.8
CRLS1-201ENST00000378863 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.02■□□□□ 0.8
CRLS1-201ENST00000378863 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.02■□□□□ 0.8
CRLS1-201ENST00000378863 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.02■□□□□ 0.8
CRLS1-201ENST00000378863 NUP155O75694 1391 aa20.02■□□□□ 0.79
CRLS1-201ENST00000378863 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.01■□□□□ 0.79
CRLS1-201ENST00000378863 NCOA2Q15596 1464 aa20.01■□□□□ 0.79
CRLS1-201ENST00000378863 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20■□□□□ 0.79
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CRLS1-201ENST00000378863 TIAM1Q13009 1591 aa19.97■□□□□ 0.79
CRLS1-201ENST00000378863 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.96■□□□□ 0.79
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CRLS1-201ENST00000378863 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
CRLS1-201ENST00000378863 GRIN2BQ13224 1484 aa19.93■□□□□ 0.78
CRLS1-201ENST00000378863 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.92■□□□□ 0.78
CRLS1-201ENST00000378863 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
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CRLS1-201ENST00000378863 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CRLS1-201ENST00000378863 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.89■□□□□ 0.78
CRLS1-201ENST00000378863 BCL11AQ9H165 835 aa19.88■□□□□ 0.77
CRLS1-201ENST00000378863 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.88■□□□□ 0.77
CRLS1-201ENST00000378863 GGT6Q6P531 493 aa19.86■□□□□ 0.77
CRLS1-201ENST00000378863 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
CRLS1-201ENST00000378863 STAG3Q9UJ98 1225 aa19.84■□□□□ 0.77
CRLS1-201ENST00000378863 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.84■□□□□ 0.77
CRLS1-201ENST00000378863 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa19.82■□□□□ 0.76
CRLS1-201ENST00000378863 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.82■□□□□ 0.76
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