RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376085.3

LRRC38-201, Transcript of leucine rich repeat containing 38, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC38, Length 2,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38-201ENST00000376085 GRIN2BQ13224 1484 aa26.48■■□□□ 1.83
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LRRC38-201ENST00000376085 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.42■■□□□ 1.82
LRRC38-201ENST00000376085 ADAMTS12P58397 1594 aa26.41■■□□□ 1.82
LRRC38-201ENST00000376085 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
LRRC38-201ENST00000376085 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.39■■□□□ 1.82
LRRC38-201ENST00000376085 APLP2Q06481 763 aa26.39■■□□□ 1.82
LRRC38-201ENST00000376085 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.39■■□□□ 1.82
LRRC38-201ENST00000376085 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.39■■□□□ 1.82
LRRC38-201ENST00000376085 FBLN2P98095 1184 aa26.27■■□□□ 1.8
LRRC38-201ENST00000376085 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
LRRC38-201ENST00000376085 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.21■■□□□ 1.79
LRRC38-201ENST00000376085 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
LRRC38-201ENST00000376085 GRIN2AQ12879 1464 aa26.2■■□□□ 1.79
LRRC38-201ENST00000376085 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
LRRC38-201ENST00000376085 SAMD9Q5K651 1589 aa26.18■■□□□ 1.78
LRRC38-201ENST00000376085 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
LRRC38-201ENST00000376085 IQGAP2Q13576 1575 aa26.15■■□□□ 1.78
LRRC38-201ENST00000376085 SYNJ2O15056 1496 aa26.13■■□□□ 1.77
LRRC38-201ENST00000376085 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
LRRC38-201ENST00000376085 TIAM1Q13009 1591 aa26.09■■□□□ 1.77
LRRC38-201ENST00000376085 CEP170Q5SW79 1584 aa26.09■■□□□ 1.77
LRRC38-201ENST00000376085 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
LRRC38-201ENST00000376085 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.07■■□□□ 1.76
LRRC38-201ENST00000376085 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.07■■□□□ 1.76
LRRC38-201ENST00000376085 FMN1Q68DA7 1419 aa26.04■■□□□ 1.76
LRRC38-201ENST00000376085 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.02■■□□□ 1.76
LRRC38-201ENST00000376085 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.02■■□□□ 1.76
LRRC38-201ENST00000376085 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.01■■□□□ 1.75
LRRC38-201ENST00000376085 ARID3CA6NKF2 412 aa26■■□□□ 1.75
LRRC38-201ENST00000376085 DISP1Q96F81 1524 aa26■■□□□ 1.75
LRRC38-201ENST00000376085 MAP3K1Q13233 1512 aa25.98■■□□□ 1.75
LRRC38-201ENST00000376085 NUP160Q12769 1436 aa25.97■■□□□ 1.75
LRRC38-201ENST00000376085 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.97■■□□□ 1.75
LRRC38-201ENST00000376085 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.94■■□□□ 1.74
LRRC38-201ENST00000376085 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.93■■□□□ 1.74
LRRC38-201ENST00000376085 JPH4Q96JJ6 628 aa25.92■■□□□ 1.74
LRRC38-201ENST00000376085 KIAA0556O60303 1618 aa25.91■■□□□ 1.74
LRRC38-201ENST00000376085 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
LRRC38-201ENST00000376085 ITGAEP38570 1179 aa25.86■■□□□ 1.73
LRRC38-201ENST00000376085 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
LRRC38-201ENST00000376085 CHD1O14646 1710 aa25.84■■□□□ 1.73
LRRC38-201ENST00000376085 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.83■■□□□ 1.73
LRRC38-201ENST00000376085 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
LRRC38-201ENST00000376085 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.81■■□□□ 1.72
LRRC38-201ENST00000376085 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.8■■□□□ 1.72
LRRC38-201ENST00000376085 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
LRRC38-201ENST00000376085 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.75■■□□□ 1.71
LRRC38-201ENST00000376085 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
LRRC38-201ENST00000376085 HECW1Q76N89 1606 aa25.73■■□□□ 1.71
LRRC38-201ENST00000376085 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
LRRC38-201ENST00000376085 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
LRRC38-201ENST00000376085 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.7■■□□□ 1.7
LRRC38-201ENST00000376085 NCOA2Q15596 1464 aa25.67■■□□□ 1.7
LRRC38-201ENST00000376085 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.67■■□□□ 1.7
LRRC38-201ENST00000376085 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.66■■□□□ 1.7
LRRC38-201ENST00000376085 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
LRRC38-201ENST00000376085 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.63■■□□□ 1.69
LRRC38-201ENST00000376085 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.61■■□□□ 1.69
LRRC38-201ENST00000376085 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.59■■□□□ 1.69
LRRC38-201ENST00000376085 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
LRRC38-201ENST00000376085 ARHGEF11O15085 1522 aa25.55■■□□□ 1.68
LRRC38-201ENST00000376085 PTPRGP23470 1445 aa25.54■■□□□ 1.68
LRRC38-201ENST00000376085 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.54■■□□□ 1.68
LRRC38-201ENST00000376085 SHROOM2Q13796 1616 aa25.52■■□□□ 1.68
LRRC38-201ENST00000376085 ABCA8O94911 1581 aa25.51■■□□□ 1.67
LRRC38-201ENST00000376085 PTPRKQ15262 1439 aa25.5■■□□□ 1.67
LRRC38-201ENST00000376085 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.49■■□□□ 1.67
LRRC38-201ENST00000376085 ATP10BO94823 1461 aa25.47■■□□□ 1.67
LRRC38-201ENST00000376085 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.45■■□□□ 1.67
LRRC38-201ENST00000376085 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
LRRC38-201ENST00000376085 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
LRRC38-201ENST00000376085 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
LRRC38-201ENST00000376085 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.41■■□□□ 1.66
LRRC38-201ENST00000376085 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.66
LRRC38-201ENST00000376085 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
LRRC38-201ENST00000376085 KIF14Q15058 1648 aa25.39■■□□□ 1.66
LRRC38-201ENST00000376085 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.37■■□□□ 1.65
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LRRC38-201ENST00000376085 UACAQ9BZF9 1416 aa25.36■■□□□ 1.65
LRRC38-201ENST00000376085 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.34■■□□□ 1.65
LRRC38-201ENST00000376085 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
LRRC38-201ENST00000376085 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.28■■□□□ 1.64
LRRC38-201ENST00000376085 MIA2Q96PC5 1412 aa25.28■■□□□ 1.64
LRRC38-201ENST00000376085 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
LRRC38-201ENST00000376085 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
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LRRC38-201ENST00000376085 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
LRRC38-201ENST00000376085 ABCC2Q92887 1545 aa25.23■■□□□ 1.63
LRRC38-201ENST00000376085 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.22■■□□□ 1.63
LRRC38-201ENST00000376085 NAIPQ13075 1403 aa25.22■■□□□ 1.63
LRRC38-201ENST00000376085 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.21■■□□□ 1.63
LRRC38-201ENST00000376085 HFM1A2PYH4 1435 aa25.19■■□□□ 1.62
LRRC38-201ENST00000376085 ABCC5O15440 1437 aa25.17■■□□□ 1.62
LRRC38-201ENST00000376085 KCNH8Q96L42 1107 aa25.17■■□□□ 1.62
LRRC38-201ENST00000376085 MAPKBP1O60336 1514 aa25.17■■□□□ 1.62
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LRRC38-201ENST00000376085 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.15■■□□□ 1.62
LRRC38-201ENST00000376085 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.13■■□□□ 1.61
LRRC38-201ENST00000376085 KDM6BO15054 1643 aa25.13■■□□□ 1.61
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