RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372478.4

C9orf50-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene C9orf50, Length 1,620 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50-201ENST00000372478 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.08■■■■■ 4.33
C9orf50-201ENST00000372478 PRXQ9BXM0 1461 aa42.04■■■■■ 4.32
C9orf50-201ENST00000372478 SHROOM2Q13796 1616 aa41.97■■■■■ 4.31
C9orf50-201ENST00000372478 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.96■■■■■ 4.31
C9orf50-201ENST00000372478 JPH4Q96JJ6 628 aa41.89■■■■■ 4.3
C9orf50-201ENST00000372478 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.88■■■■■ 4.3
C9orf50-201ENST00000372478 ARAP1Q96P48 1450 aa41.84■■■■■ 4.29
C9orf50-201ENST00000372478 IQGAP2Q13576 1575 aa41.81■■■■■ 4.28
C9orf50-201ENST00000372478 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
C9orf50-201ENST00000372478 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.78■■■■■ 4.28
C9orf50-201ENST00000372478 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.77■■■■■ 4.28
C9orf50-201ENST00000372478 KIF21BO75037 1637 aa41.73■■■■■ 4.27
C9orf50-201ENST00000372478 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.61■■■■■ 4.25
C9orf50-201ENST00000372478 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.56■■■■■ 4.24
C9orf50-201ENST00000372478 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.5■■■■■ 4.23
C9orf50-201ENST00000372478 GOLGA3Q08378 1498 aa41.49■■■■■ 4.23
C9orf50-201ENST00000372478 DISP1Q96F81 1524 aa41.49■■■■■ 4.23
C9orf50-201ENST00000372478 KIAA0556O60303 1618 aa41.41■■■■■ 4.22
C9orf50-201ENST00000372478 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
C9orf50-201ENST00000372478 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
C9orf50-201ENST00000372478 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.35■■■■■ 4.21
C9orf50-201ENST00000372478 PTPRGP23470 1445 aa41.32■■■■■ 4.21
C9orf50-201ENST00000372478 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
C9orf50-201ENST00000372478 SAMD9Q5K651 1589 aa41.22■■■■■ 4.19
C9orf50-201ENST00000372478 P3H3Q8IVL6 736 aa41.21■■■■■ 4.19
C9orf50-201ENST00000372478 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.17■■■■■ 4.18
C9orf50-201ENST00000372478 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.06■■■■■ 4.16
C9orf50-201ENST00000372478 UACAQ9BZF9 1416 aa41.05■■■■■ 4.16
C9orf50-201ENST00000372478 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.02■■■■■ 4.16
C9orf50-201ENST00000372478 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.99■■■■■ 4.15
C9orf50-201ENST00000372478 ABCC2Q92887 1545 aa40.99■■■■■ 4.15
C9orf50-201ENST00000372478 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.97■■■■■ 4.15
C9orf50-201ENST00000372478 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.95■■■■■ 4.15
C9orf50-201ENST00000372478 ABCA8O94911 1581 aa40.94■■■■■ 4.14
C9orf50-201ENST00000372478 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.93■■■■■ 4.14
C9orf50-201ENST00000372478 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.92■■■■■ 4.14
C9orf50-201ENST00000372478 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
C9orf50-201ENST00000372478 MAPKBP1O60336 1514 aa40.8■■■■■ 4.12
C9orf50-201ENST00000372478 KDM5BQ9UGL1 1544 aa40.8■■■■■ 4.12
C9orf50-201ENST00000372478 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.79■■■■■ 4.12
C9orf50-201ENST00000372478 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
C9orf50-201ENST00000372478 CLIP1P30622 1438 aa40.77■■■■■ 4.12
C9orf50-201ENST00000372478 ARID3CA6NKF2 412 aa40.7■■■■■ 4.11
C9orf50-201ENST00000372478 CEP162Q5TB80 1403 aa40.66■■■■■ 4.1
C9orf50-201ENST00000372478 FMN1Q68DA7 1419 aa40.66■■■■■ 4.1
C9orf50-201ENST00000372478 ASXL2Q76L83 1435 aa40.65■■■■■ 4.1
C9orf50-201ENST00000372478 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.1
C9orf50-201ENST00000372478 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.61■■■■■ 4.09
C9orf50-201ENST00000372478 ATP10BO94823 1461 aa40.6■■■■■ 4.09
C9orf50-201ENST00000372478 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.58■■■■■ 4.09
C9orf50-201ENST00000372478 DIP2BQ9P265 1576 aa40.56■■■■■ 4.08
C9orf50-201ENST00000372478 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.51■■■■■ 4.08
C9orf50-201ENST00000372478 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
C9orf50-201ENST00000372478 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
C9orf50-201ENST00000372478 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
C9orf50-201ENST00000372478 HECW1Q76N89 1606 aa40.48■■■■■ 4.07
C9orf50-201ENST00000372478 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.48■■■■■ 4.07
C9orf50-201ENST00000372478 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
C9orf50-201ENST00000372478 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
C9orf50-201ENST00000372478 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
C9orf50-201ENST00000372478 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.39■■■■■ 4.06
C9orf50-201ENST00000372478 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.37■■■■■ 4.05
C9orf50-201ENST00000372478 KCNH8Q96L42 1107 aa40.35■■■■■ 4.05
C9orf50-201ENST00000372478 GLI2P10070 1586 aa40.34■■■■■ 4.05
C9orf50-201ENST00000372478 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.31■■■■■ 4.04
C9orf50-201ENST00000372478 TSPOAP1O95153 1857 aa40.3■■■■■ 4.04
C9orf50-201ENST00000372478 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.25■■■■■ 4.03
C9orf50-201ENST00000372478 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.22■■■■■ 4.03
C9orf50-201ENST00000372478 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.19■■■■■ 4.02
C9orf50-201ENST00000372478 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
C9orf50-201ENST00000372478 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.14■■■■■ 4.02
C9orf50-201ENST00000372478 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.13■■■■■ 4.01
C9orf50-201ENST00000372478 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
C9orf50-201ENST00000372478 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.1■■■■■ 4.01
C9orf50-201ENST00000372478 CD109Q6YHK3 1445 aa40.08■■■■■ 4.01
C9orf50-201ENST00000372478 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
C9orf50-201ENST00000372478 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.02■■■■■ 4
C9orf50-201ENST00000372478 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40■■■■□ 3.99
C9orf50-201ENST00000372478 KIF14Q15058 1648 aa39.99■■■■□ 3.99
C9orf50-201ENST00000372478 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.98■■■■□ 3.99
C9orf50-201ENST00000372478 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.95■■■■□ 3.99
C9orf50-201ENST00000372478 KDM6BO15054 1643 aa39.86■■■■□ 3.97
C9orf50-201ENST00000372478 TIAM1Q13009 1591 aa39.85■■■■□ 3.97
C9orf50-201ENST00000372478 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.84■■■■□ 3.97
C9orf50-201ENST00000372478 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.8■■■■□ 3.96
C9orf50-201ENST00000372478 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.77■■■■□ 3.96
C9orf50-201ENST00000372478 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
C9orf50-201ENST00000372478 PLCH2O75038 1416 aa39.73■■■■□ 3.95
C9orf50-201ENST00000372478 MAP3K1Q13233 1512 aa39.71■■■■□ 3.95
C9orf50-201ENST00000372478 FANCAO15360 1455 aa39.7■■■■□ 3.95
C9orf50-201ENST00000372478 NEO1Q92859 1461 aa39.7■■■■□ 3.95
C9orf50-201ENST00000372478 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.66■■■■□ 3.94
C9orf50-201ENST00000372478 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.66■■■■□ 3.94
C9orf50-201ENST00000372478 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.66■■■■□ 3.94
C9orf50-201ENST00000372478 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.65■■■■□ 3.94
C9orf50-201ENST00000372478 APLP2Q06481 763 aa39.65■■■■□ 3.94
C9orf50-201ENST00000372478 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.63■■■■□ 3.94
C9orf50-201ENST00000372478 PREX2Q70Z35 1606 aa39.63■■■■□ 3.94
C9orf50-201ENST00000372478 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
C9orf50-201ENST00000372478 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.62■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms