RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371723.4

SDCCAG3-203, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 2

Gene SDCCAG3, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-203ENST00000371723 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.99■■■■■ 4.63
SDCCAG3-203ENST00000371723 JPH4Q96JJ6 628 aa43.98■■■■■ 4.63
SDCCAG3-203ENST00000371723 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.92■■■■■ 4.62
SDCCAG3-203ENST00000371723 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
SDCCAG3-203ENST00000371723 PRXQ9BXM0 1461 aa43.74■■■■■ 4.59
SDCCAG3-203ENST00000371723 IQGAP2Q13576 1575 aa43.74■■■■■ 4.59
SDCCAG3-203ENST00000371723 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.71■■■■■ 4.59
SDCCAG3-203ENST00000371723 EEA1Q15075 1411 aa43.64■■■■■ 4.58
SDCCAG3-203ENST00000371723 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.61■■■■■ 4.57
SDCCAG3-203ENST00000371723 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.6■■■■■ 4.57
SDCCAG3-203ENST00000371723 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.5■■■■■ 4.55
SDCCAG3-203ENST00000371723 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.48■■■■■ 4.55
SDCCAG3-203ENST00000371723 DISP1Q96F81 1524 aa43.45■■■■■ 4.55
SDCCAG3-203ENST00000371723 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.38■■■■■ 4.53
SDCCAG3-203ENST00000371723 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
SDCCAG3-203ENST00000371723 PTPRGP23470 1445 aa43.36■■■■■ 4.53
SDCCAG3-203ENST00000371723 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
SDCCAG3-203ENST00000371723 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.35■■■■■ 4.53
SDCCAG3-203ENST00000371723 KIAA0556O60303 1618 aa43.33■■■■■ 4.53
SDCCAG3-203ENST00000371723 KIF21BO75037 1637 aa43.26■■■■■ 4.52
SDCCAG3-203ENST00000371723 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
SDCCAG3-203ENST00000371723 GOLGA3Q08378 1498 aa43.19■■■■■ 4.51
SDCCAG3-203ENST00000371723 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.12■■■■■ 4.49
SDCCAG3-203ENST00000371723 MAPKBP1O60336 1514 aa43.09■■■■■ 4.49
SDCCAG3-203ENST00000371723 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.09■■■■■ 4.49
SDCCAG3-203ENST00000371723 UACAQ9BZF9 1416 aa43.08■■■■■ 4.49
SDCCAG3-203ENST00000371723 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.04■■■■■ 4.48
SDCCAG3-203ENST00000371723 ABCC2Q92887 1545 aa43.03■■■■■ 4.48
SDCCAG3-203ENST00000371723 SAMD9Q5K651 1589 aa43■■■■■ 4.47
SDCCAG3-203ENST00000371723 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.9■■■■■ 4.46
SDCCAG3-203ENST00000371723 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.89■■■■■ 4.46
SDCCAG3-203ENST00000371723 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.88■■■■■ 4.46
SDCCAG3-203ENST00000371723 ABCA8O94911 1581 aa42.88■■■■■ 4.45
SDCCAG3-203ENST00000371723 DIP2BQ9P265 1576 aa42.86■■■■■ 4.45
SDCCAG3-203ENST00000371723 P3H3Q8IVL6 736 aa42.85■■■■■ 4.45
SDCCAG3-203ENST00000371723 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
SDCCAG3-203ENST00000371723 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.8■■■■■ 4.44
SDCCAG3-203ENST00000371723 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
SDCCAG3-203ENST00000371723 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
SDCCAG3-203ENST00000371723 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.76■■■■■ 4.44
SDCCAG3-203ENST00000371723 ASXL2Q76L83 1435 aa42.76■■■■■ 4.44
SDCCAG3-203ENST00000371723 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.74■■■■■ 4.43
SDCCAG3-203ENST00000371723 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.67■■■■■ 4.42
SDCCAG3-203ENST00000371723 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.61■■■■■ 4.41
SDCCAG3-203ENST00000371723 GLI2P10070 1586 aa42.59■■■■■ 4.41
SDCCAG3-203ENST00000371723 TSPOAP1O95153 1857 aa42.56■■■■■ 4.4
SDCCAG3-203ENST00000371723 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
SDCCAG3-203ENST00000371723 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.52■■■■■ 4.4
SDCCAG3-203ENST00000371723 ATP10BO94823 1461 aa42.5■■■■■ 4.39
SDCCAG3-203ENST00000371723 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.49■■■■■ 4.39
SDCCAG3-203ENST00000371723 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
SDCCAG3-203ENST00000371723 ARID3CA6NKF2 412 aa42.41■■■■■ 4.38
SDCCAG3-203ENST00000371723 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.41■■■■■ 4.38
SDCCAG3-203ENST00000371723 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
SDCCAG3-203ENST00000371723 FMN1Q68DA7 1419 aa42.31■■■■■ 4.36
SDCCAG3-203ENST00000371723 KCNH8Q96L42 1107 aa42.27■■■■■ 4.36
SDCCAG3-203ENST00000371723 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.26■■■■■ 4.36
SDCCAG3-203ENST00000371723 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
SDCCAG3-203ENST00000371723 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
SDCCAG3-203ENST00000371723 KDM6BO15054 1643 aa42.2■■■■■ 4.35
SDCCAG3-203ENST00000371723 HECW1Q76N89 1606 aa42.17■■■■■ 4.34
SDCCAG3-203ENST00000371723 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.14■■■■■ 4.34
SDCCAG3-203ENST00000371723 CLIP1P30622 1438 aa42.13■■■■■ 4.34
SDCCAG3-203ENST00000371723 CD109Q6YHK3 1445 aa42.13■■■■■ 4.34
SDCCAG3-203ENST00000371723 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
SDCCAG3-203ENST00000371723 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.11■■■■■ 4.33
SDCCAG3-203ENST00000371723 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.1■■■■■ 4.33
SDCCAG3-203ENST00000371723 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.06■■■■■ 4.32
SDCCAG3-203ENST00000371723 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.05■■■■■ 4.32
SDCCAG3-203ENST00000371723 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
SDCCAG3-203ENST00000371723 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
SDCCAG3-203ENST00000371723 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.98■■■■■ 4.31
SDCCAG3-203ENST00000371723 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
SDCCAG3-203ENST00000371723 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.91■■■■■ 4.3
SDCCAG3-203ENST00000371723 CEP162Q5TB80 1403 aa41.91■■■■■ 4.3
SDCCAG3-203ENST00000371723 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.87■■■■■ 4.29
SDCCAG3-203ENST00000371723 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.87■■■■■ 4.293e-9■■■■□ 25.7
SDCCAG3-203ENST00000371723 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
SDCCAG3-203ENST00000371723 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.83■■■■■ 4.29
SDCCAG3-203ENST00000371723 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.82■■■■■ 4.29
SDCCAG3-203ENST00000371723 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
SDCCAG3-203ENST00000371723 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.75■■■■■ 4.27
SDCCAG3-203ENST00000371723 NEO1Q92859 1461 aa41.75■■■■■ 4.27
SDCCAG3-203ENST00000371723 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.75■■■■■ 4.27
SDCCAG3-203ENST00000371723 KIF14Q15058 1648 aa41.73■■■■■ 4.27
SDCCAG3-203ENST00000371723 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.64■■■■■ 4.26
SDCCAG3-203ENST00000371723 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.63■■■■■ 4.26
SDCCAG3-203ENST00000371723 PLCH2O75038 1416 aa41.61■■■■■ 4.25
SDCCAG3-203ENST00000371723 FANCAO15360 1455 aa41.6■■■■■ 4.25
SDCCAG3-203ENST00000371723 AKNAQ7Z591 1439 aa41.55■■■■■ 4.24
SDCCAG3-203ENST00000371723 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.5■■■■■ 4.23
SDCCAG3-203ENST00000371723 RAPGEF3O95398 923 aa41.47■■■■■ 4.23
SDCCAG3-203ENST00000371723 RICTORQ6R327 1708 aa41.47■■■■■ 4.23
SDCCAG3-203ENST00000371723 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.46■■■■■ 4.23
SDCCAG3-203ENST00000371723 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.43■■■■■ 4.22
SDCCAG3-203ENST00000371723 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
SDCCAG3-203ENST00000371723 PREX2Q70Z35 1606 aa41.4■■■■■ 4.22
SDCCAG3-203ENST00000371723 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.4■■■■■ 4.22
SDCCAG3-203ENST00000371723 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.4■■■■■ 4.22
SDCCAG3-203ENST00000371723 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.39■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms