RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371723.4

SDCCAG3-203, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 2

Gene SDCCAG3, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-203ENST00000371723 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.99■■■■■ 4.63
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SDCCAG3-203ENST00000371723 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
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SDCCAG3-203ENST00000371723 IQGAP2Q13576 1575 aa43.74■■■■■ 4.59
SDCCAG3-203ENST00000371723 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.71■■■■■ 4.59
SDCCAG3-203ENST00000371723 EEA1Q15075 1411 aa43.64■■■■■ 4.58
SDCCAG3-203ENST00000371723 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.61■■■■■ 4.57
SDCCAG3-203ENST00000371723 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.6■■■■■ 4.57
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SDCCAG3-203ENST00000371723 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.48■■■■■ 4.55
SDCCAG3-203ENST00000371723 DISP1Q96F81 1524 aa43.45■■■■■ 4.55
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SDCCAG3-203ENST00000371723 PTPRGP23470 1445 aa43.36■■■■■ 4.53
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SDCCAG3-203ENST00000371723 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.35■■■■■ 4.53
SDCCAG3-203ENST00000371723 KIAA0556O60303 1618 aa43.33■■■■■ 4.53
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SDCCAG3-203ENST00000371723 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.04■■■■■ 4.48
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SDCCAG3-203ENST00000371723 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.14■■■■■ 4.34
SDCCAG3-203ENST00000371723 CLIP1P30622 1438 aa42.13■■■■■ 4.34
SDCCAG3-203ENST00000371723 CD109Q6YHK3 1445 aa42.13■■■■■ 4.34
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SDCCAG3-203ENST00000371723 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.06■■■■■ 4.32
SDCCAG3-203ENST00000371723 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.05■■■■■ 4.32
SDCCAG3-203ENST00000371723 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
SDCCAG3-203ENST00000371723 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
SDCCAG3-203ENST00000371723 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.98■■■■■ 4.31
SDCCAG3-203ENST00000371723 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
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SDCCAG3-203ENST00000371723 NEO1Q92859 1461 aa41.75■■■■■ 4.27
SDCCAG3-203ENST00000371723 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.75■■■■■ 4.27
SDCCAG3-203ENST00000371723 KIF14Q15058 1648 aa41.73■■■■■ 4.27
SDCCAG3-203ENST00000371723 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.64■■■■■ 4.26
SDCCAG3-203ENST00000371723 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.63■■■■■ 4.26
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SDCCAG3-203ENST00000371723 FANCAO15360 1455 aa41.6■■■■■ 4.25
SDCCAG3-203ENST00000371723 AKNAQ7Z591 1439 aa41.55■■■■■ 4.24
SDCCAG3-203ENST00000371723 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.5■■■■■ 4.23
SDCCAG3-203ENST00000371723 RAPGEF3O95398 923 aa41.47■■■■■ 4.23
SDCCAG3-203ENST00000371723 RICTORQ6R327 1708 aa41.47■■■■■ 4.23
SDCCAG3-203ENST00000371723 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.46■■■■■ 4.23
SDCCAG3-203ENST00000371723 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.43■■■■■ 4.22
SDCCAG3-203ENST00000371723 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
SDCCAG3-203ENST00000371723 PREX2Q70Z35 1606 aa41.4■■■■■ 4.22
SDCCAG3-203ENST00000371723 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.4■■■■■ 4.22
SDCCAG3-203ENST00000371723 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.4■■■■■ 4.22
SDCCAG3-203ENST00000371723 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.39■■■■■ 4.22
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