RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371723.4

SDCCAG3-203, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 2

Gene SDCCAG3, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-203ENST00000371723 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.55■■■■■ 7.76
SDCCAG3-203ENST00000371723 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.63■■■■■ 6.66
SDCCAG3-203ENST00000371723 ABCC9O60706 1549 aa55.48■■■■■ 6.47
SDCCAG3-203ENST00000371723 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.33■■■■■ 6.13
SDCCAG3-203ENST00000371723 NACADO15069 1562 aa53.24■■■■■ 6.11
SDCCAG3-203ENST00000371723 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.05■■■■■ 6.08
SDCCAG3-203ENST00000371723 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.9■■■■■ 6.06
SDCCAG3-203ENST00000371723 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.88■■■■■ 6.06
SDCCAG3-203ENST00000371723 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.6■■■■■ 6.01
SDCCAG3-203ENST00000371723 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.27■■■■■ 5.96
SDCCAG3-203ENST00000371723 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.79■■■■■ 5.88
SDCCAG3-203ENST00000371723 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.78■■■■■ 5.88
SDCCAG3-203ENST00000371723 SCRIBQ14160 1630 aa51.6■■■■■ 5.85
SDCCAG3-203ENST00000371723 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.17■■■■■ 5.78
SDCCAG3-203ENST00000371723 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.11■■■■■ 5.77
SDCCAG3-203ENST00000371723 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.39■■■■■ 5.66
SDCCAG3-203ENST00000371723 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.24■■■■■ 5.63
SDCCAG3-203ENST00000371723 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.88■■■■■ 5.57
SDCCAG3-203ENST00000371723 SMARCA4P51532 1647 aa49.38■■■■■ 5.49
SDCCAG3-203ENST00000371723 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.26■■■■■ 5.48
SDCCAG3-203ENST00000371723 NCAPD3P42695 1498 aa49.12■■■■■ 5.45
SDCCAG3-203ENST00000371723 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.12■■■■■ 5.45
SDCCAG3-203ENST00000371723 SMARCA2P51531 1590 aa49.05■■■■■ 5.44
SDCCAG3-203ENST00000371723 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.98■■■■■ 5.43
SDCCAG3-203ENST00000371723 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.91■■■■■ 5.42
SDCCAG3-203ENST00000371723 HMGXB3Q12766 1538 aa48.88■■■■■ 5.41
SDCCAG3-203ENST00000371723 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.67■■■■■ 5.38
SDCCAG3-203ENST00000371723 WIZO95785 1651 aa48.47■■■■■ 5.35
SDCCAG3-203ENST00000371723 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.33■■■■■ 5.33
SDCCAG3-203ENST00000371723 NESP48681 1621 aa47.99■■■■■ 5.27
SDCCAG3-203ENST00000371723 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.91■■■■■ 5.26
SDCCAG3-203ENST00000371723 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.87■■■■■ 5.25
SDCCAG3-203ENST00000371723 ERCC6Q03468 1493 aa47.8■■■■■ 5.24
SDCCAG3-203ENST00000371723 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.65■■■■■ 5.22
SDCCAG3-203ENST00000371723 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.49■■■■■ 5.19
SDCCAG3-203ENST00000371723 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.49■■■■■ 5.19
SDCCAG3-203ENST00000371723 CUX2O14529 1486 aa47.41■■■■■ 5.18
SDCCAG3-203ENST00000371723 CFTRP13569 1480 aa47.36■■■■■ 5.17
SDCCAG3-203ENST00000371723 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.34■■■■■ 5.17
SDCCAG3-203ENST00000371723 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.34■■■■■ 5.17
SDCCAG3-203ENST00000371723 PRDM2Q13029 1718 aa47.11■■■■■ 5.13
SDCCAG3-203ENST00000371723 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.11■■■■■ 5.13
SDCCAG3-203ENST00000371723 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.06■■■■■ 5.12
SDCCAG3-203ENST00000371723 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.03■■■■■ 5.12
SDCCAG3-203ENST00000371723 WDR62O43379 1518 aa46.93■■■■■ 5.1
SDCCAG3-203ENST00000371723 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.89■■■■■ 5.1
SDCCAG3-203ENST00000371723 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.68■■■■■ 5.06
SDCCAG3-203ENST00000371723 TOPBP1Q92547 1522 aa46.36■■■■■ 5.01
SDCCAG3-203ENST00000371723 ABCC8Q09428 1581 aa46.34■■■■■ 5.01
SDCCAG3-203ENST00000371723 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.3■■■■■ 5
SDCCAG3-203ENST00000371723 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.15■■■■■ 4.98
SDCCAG3-203ENST00000371723 IFT140Q96RY7 1462 aa46.09■■■■■ 4.97
SDCCAG3-203ENST00000371723 CUX1P39880 1505 aa45.96■■■■■ 4.95
SDCCAG3-203ENST00000371723 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.94■■■■■ 4.95
SDCCAG3-203ENST00000371723 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.91■■■■■ 4.94
SDCCAG3-203ENST00000371723 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.91■■■■■ 4.94
SDCCAG3-203ENST00000371723 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.8■■■■■ 4.92
SDCCAG3-203ENST00000371723 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.75■■■■■ 4.91
SDCCAG3-203ENST00000371723 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.74■■■■■ 4.91
SDCCAG3-203ENST00000371723 SOGA1O94964 1423 aa45.73■■■■■ 4.91
SDCCAG3-203ENST00000371723 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.61■■■■■ 4.892e-6■■□□□ 13.2
SDCCAG3-203ENST00000371723 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.55■■■■■ 4.88
SDCCAG3-203ENST00000371723 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.55■■■■■ 4.88
SDCCAG3-203ENST00000371723 TOP2BQ02880 1626 aa45.53■■■■■ 4.88
SDCCAG3-203ENST00000371723 WDR97A6NE52 1622 aa45.52■■■■■ 4.88
SDCCAG3-203ENST00000371723 SYNJ1O43426 1573 aa45.5■■■■■ 4.87
SDCCAG3-203ENST00000371723 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.48■■■■■ 4.87
SDCCAG3-203ENST00000371723 OSCARQ8IYS5 282 aa45.38■■■■■ 4.86
SDCCAG3-203ENST00000371723 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.36■■■■■ 4.85
SDCCAG3-203ENST00000371723 CHD1O14646 1710 aa45.26■■■■■ 4.84
SDCCAG3-203ENST00000371723 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.24■■■■■ 4.83
SDCCAG3-203ENST00000371723 GRIN2BQ13224 1484 aa45.22■■■■■ 4.83
SDCCAG3-203ENST00000371723 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.22■■■■■ 4.83
SDCCAG3-203ENST00000371723 PBRM1Q86U86 1689 aa45.21■■■■■ 4.83
SDCCAG3-203ENST00000371723 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.19■■■■■ 4.82
SDCCAG3-203ENST00000371723 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.14■■■■■ 4.82
SDCCAG3-203ENST00000371723 FBLN2P98095 1184 aa45.03■■■■■ 4.8
SDCCAG3-203ENST00000371723 SYNJ2O15056 1496 aa44.96■■■■■ 4.79
SDCCAG3-203ENST00000371723 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.9■■■■■ 4.78
SDCCAG3-203ENST00000371723 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.82■■■■■ 4.77
SDCCAG3-203ENST00000371723 ADAMTS12P58397 1594 aa44.8■■■■■ 4.76
SDCCAG3-203ENST00000371723 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.75■■■■■ 4.75
SDCCAG3-203ENST00000371723 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.75■■■■■ 4.75
SDCCAG3-203ENST00000371723 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.75■■■■■ 4.75
SDCCAG3-203ENST00000371723 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.72■■■■■ 4.75
SDCCAG3-203ENST00000371723 ARHGEF11O15085 1522 aa44.69■■■■■ 4.74
SDCCAG3-203ENST00000371723 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.67■■■■■ 4.74
SDCCAG3-203ENST00000371723 GRIN2AQ12879 1464 aa44.66■■■■■ 4.74
SDCCAG3-203ENST00000371723 KIF27Q86VH2 1401 aa44.61■■■■■ 4.73
SDCCAG3-203ENST00000371723 TRIM41Q8WV44 630 aa44.5■■■■■ 4.71
SDCCAG3-203ENST00000371723 NUP160Q12769 1436 aa44.48■■■■■ 4.71
SDCCAG3-203ENST00000371723 IGF1RP08069 1367 aa44.47■■■■■ 4.71
SDCCAG3-203ENST00000371723 CEP170Q5SW79 1584 aa44.47■■■■■ 4.71
SDCCAG3-203ENST00000371723 CUL7Q14999 1698 aa44.4■■■■■ 4.7
SDCCAG3-203ENST00000371723 ARAP1Q96P48 1450 aa44.32■■■■■ 4.69
SDCCAG3-203ENST00000371723 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.23■■■■■ 4.67
SDCCAG3-203ENST00000371723 SHROOM2Q13796 1616 aa44.21■■■■■ 4.67
SDCCAG3-203ENST00000371723 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.2■■■■■ 4.67
SDCCAG3-203ENST00000371723 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.18■■■■■ 4.66
SDCCAG3-203ENST00000371723 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.09■■■■■ 4.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms