RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370577.7

LMBRD1-202, Transcript of LMBR1 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMBRD1, Length 2,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1-202ENST00000370577 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
LMBRD1-202ENST00000370577 WDR62O43379 1518 aa23.02■■□□□ 1.27
LMBRD1-202ENST00000370577 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
LMBRD1-202ENST00000370577 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1-202ENST00000370577 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.99■■□□□ 1.27
LMBRD1-202ENST00000370577 ERCC6Q03468 1493 aa22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1-202ENST00000370577 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1-202ENST00000370577 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
LMBRD1-202ENST00000370577 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1-202ENST00000370577 TIAM1Q13009 1591 aa22.96■■□□□ 1.27
LMBRD1-202ENST00000370577 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
LMBRD1-202ENST00000370577 IFT140Q96RY7 1462 aa22.93■■□□□ 1.26
LMBRD1-202ENST00000370577 MAP3K1Q13233 1512 aa22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1-202ENST00000370577 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
LMBRD1-202ENST00000370577 ADAMTS12P58397 1594 aa22.9■■□□□ 1.26
LMBRD1-202ENST00000370577 GRIN2BQ13224 1484 aa22.89■■□□□ 1.26
LMBRD1-202ENST00000370577 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1-202ENST00000370577 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1-202ENST00000370577 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.88■■□□□ 1.25
LMBRD1-202ENST00000370577 SAMD9Q5K651 1589 aa22.87■■□□□ 1.25
LMBRD1-202ENST00000370577 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
LMBRD1-202ENST00000370577 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.85■■□□□ 1.25
LMBRD1-202ENST00000370577 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.84■■□□□ 1.25
LMBRD1-202ENST00000370577 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.83■■□□□ 1.25
LMBRD1-202ENST00000370577 FMN1Q68DA7 1419 aa22.81■■□□□ 1.24
LMBRD1-202ENST00000370577 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
LMBRD1-202ENST00000370577 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.79■■□□□ 1.24
LMBRD1-202ENST00000370577 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.77■■□□□ 1.24
LMBRD1-202ENST00000370577 IQGAP2Q13576 1575 aa22.76■■□□□ 1.23
LMBRD1-202ENST00000370577 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1-202ENST00000370577 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.72■■□□□ 1.23
LMBRD1-202ENST00000370577 ITGAEP38570 1179 aa22.68■■□□□ 1.22
LMBRD1-202ENST00000370577 GRIN2AQ12879 1464 aa22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1-202ENST00000370577 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
LMBRD1-202ENST00000370577 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
LMBRD1-202ENST00000370577 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.61■■□□□ 1.21
LMBRD1-202ENST00000370577 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1-202ENST00000370577 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
LMBRD1-202ENST00000370577 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1-202ENST00000370577 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
LMBRD1-202ENST00000370577 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1-202ENST00000370577 SYNJ2O15056 1496 aa22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1-202ENST00000370577 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
LMBRD1-202ENST00000370577 HECW1Q76N89 1606 aa22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1-202ENST00000370577 NEUROD1Q13562 356 aa22.54■■□□□ 1.2
LMBRD1-202ENST00000370577 FBLN2P98095 1184 aa22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1-202ENST00000370577 CEP170Q5SW79 1584 aa22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1-202ENST00000370577 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1-202ENST00000370577 KIAA0556O60303 1618 aa22.53■■□□□ 1.2
LMBRD1-202ENST00000370577 DISP1Q96F81 1524 aa22.52■■□□□ 1.2
LMBRD1-202ENST00000370577 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.51■■□□□ 1.19
LMBRD1-202ENST00000370577 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1-202ENST00000370577 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.5■■□□□ 1.19
LMBRD1-202ENST00000370577 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.49■■□□□ 1.19
LMBRD1-202ENST00000370577 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1-202ENST00000370577 NCOA2Q15596 1464 aa22.48■■□□□ 1.19
LMBRD1-202ENST00000370577 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1-202ENST00000370577 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
LMBRD1-202ENST00000370577 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1-202ENST00000370577 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1-202ENST00000370577 ARID3CA6NKF2 412 aa22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1-202ENST00000370577 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1-202ENST00000370577 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1-202ENST00000370577 NUP160Q12769 1436 aa22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1-202ENST00000370577 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1-202ENST00000370577 ARHGEF11O15085 1522 aa22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1-202ENST00000370577 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.38■■□□□ 1.17
LMBRD1-202ENST00000370577 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
LMBRD1-202ENST00000370577 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1-202ENST00000370577 JPH4Q96JJ6 628 aa22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1-202ENST00000370577 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1-202ENST00000370577 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.34■■□□□ 1.17
LMBRD1-202ENST00000370577 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1-202ENST00000370577 PTPRKQ15262 1439 aa22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1-202ENST00000370577 MAPKBP1O60336 1514 aa22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1-202ENST00000370577 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1-202ENST00000370577 CHD1O14646 1710 aa22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1-202ENST00000370577 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LMBRD1-202ENST00000370577 HFM1A2PYH4 1435 aa22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1-202ENST00000370577 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
LMBRD1-202ENST00000370577 MIA2Q96PC5 1412 aa22.19■■□□□ 1.14
LMBRD1-202ENST00000370577 NAIPQ13075 1403 aa22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1-202ENST00000370577 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
LMBRD1-202ENST00000370577 MIER1Q8N108 512 aa22.15■■□□□ 1.14
LMBRD1-202ENST00000370577 ABCA8O94911 1581 aa22.15■■□□□ 1.14
LMBRD1-202ENST00000370577 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1-202ENST00000370577 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.14■■□□□ 1.13
LMBRD1-202ENST00000370577 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.11■■□□□ 1.13
LMBRD1-202ENST00000370577 KIF14Q15058 1648 aa22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1-202ENST00000370577 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.1■■□□□ 1.13
LMBRD1-202ENST00000370577 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.09■■□□□ 1.13
LMBRD1-202ENST00000370577 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.08■■□□□ 1.13
LMBRD1-202ENST00000370577 UACAQ9BZF9 1416 aa22.07■■□□□ 1.12
LMBRD1-202ENST00000370577 PTPRGP23470 1445 aa22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1-202ENST00000370577 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LMBRD1-202ENST00000370577 SHROOM2Q13796 1616 aa22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1-202ENST00000370577 ATP10BO94823 1461 aa22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1-202ENST00000370577 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.05■■□□□ 1.12
LMBRD1-202ENST00000370577 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
LMBRD1-202ENST00000370577 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
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