RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HCN3-201ENST00000368358 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.01■□□□□ 0.79
HCN3-201ENST00000368358 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.97■□□□□ 0.79
HCN3-201ENST00000368358 ARAP1Q96P48 1450 aa19.97■□□□□ 0.79
HCN3-201ENST00000368358 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.92■□□□□ 0.78
HCN3-201ENST00000368358 IFT140Q96RY7 1462 aa19.87■□□□□ 0.77
HCN3-201ENST00000368358 GRIN2BQ13224 1484 aa19.86■□□□□ 0.77
HCN3-201ENST00000368358 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.83■□□□□ 0.76
HCN3-201ENST00000368358 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.82■□□□□ 0.76
HCN3-201ENST00000368358 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.82■□□□□ 0.76
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HCN3-201ENST00000368358 CUL7Q14999 1698 aa19.7■□□□□ 0.74
HCN3-201ENST00000368358 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.7■□□□□ 0.74
HCN3-201ENST00000368358 FMN1Q68DA7 1419 aa19.68■□□□□ 0.74
HCN3-201ENST00000368358 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.67■□□□□ 0.74
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HCN3-201ENST00000368358 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.62■□□□□ 0.73
HCN3-201ENST00000368358 GRIN2AQ12879 1464 aa19.6■□□□□ 0.73
HCN3-201ENST00000368358 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
HCN3-201ENST00000368358 KCNH8Q96L42 1107 aa19.59■□□□□ 0.73
HCN3-201ENST00000368358 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
HCN3-201ENST00000368358 PBRM1Q86U86 1689 aa19.56■□□□□ 0.72
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HCN3-201ENST00000368358 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.55■□□□□ 0.72
HCN3-201ENST00000368358 WDR97A6NE52 1622 aa19.55■□□□□ 0.72
HCN3-201ENST00000368358 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.55■□□□□ 0.72
HCN3-201ENST00000368358 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
HCN3-201ENST00000368358 ADAMTS12P58397 1594 aa19.55■□□□□ 0.72
HCN3-201ENST00000368358 IQGAP2Q13576 1575 aa19.55■□□□□ 0.72
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HCN3-201ENST00000368358 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.54■□□□□ 0.72
HCN3-201ENST00000368358 TRIM52Q96A61 297 aa19.54■□□□□ 0.72
HCN3-201ENST00000368358 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.52■□□□□ 0.72
HCN3-201ENST00000368358 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19.52■□□□□ 0.71
HCN3-201ENST00000368358 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.52■□□□□ 0.71
HCN3-201ENST00000368358 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
HCN3-201ENST00000368358 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.51■□□□□ 0.71
HCN3-201ENST00000368358 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.51■□□□□ 0.71
HCN3-201ENST00000368358 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
HCN3-201ENST00000368358 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.49■□□□□ 0.71
HCN3-201ENST00000368358 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.49■□□□□ 0.71
HCN3-201ENST00000368358 TIAM1Q13009 1591 aa19.46■□□□□ 0.71
HCN3-201ENST00000368358 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HCN3-201ENST00000368358 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
HCN3-201ENST00000368358 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.45■□□□□ 0.7
HCN3-201ENST00000368358 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
HCN3-201ENST00000368358 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
HCN3-201ENST00000368358 PTPRGP23470 1445 aa19.43■□□□□ 0.7
HCN3-201ENST00000368358 PLB1Q6P1J6 1458 aa19.41■□□□□ 0.7
HCN3-201ENST00000368358 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
HCN3-201ENST00000368358 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.34■□□□□ 0.69
HCN3-201ENST00000368358 NCOA2Q15596 1464 aa19.34■□□□□ 0.69
HCN3-201ENST00000368358 CEP170Q5SW79 1584 aa19.34■□□□□ 0.69
HCN3-201ENST00000368358 OSCARQ8IYS5 282 aa19.33■□□□□ 0.69
HCN3-201ENST00000368358 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
HCN3-201ENST00000368358 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.32■□□□□ 0.68
HCN3-201ENST00000368358 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
HCN3-201ENST00000368358 DISP1Q96F81 1524 aa19.31■□□□□ 0.68
HCN3-201ENST00000368358 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.3■□□□□ 0.68
HCN3-201ENST00000368358 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.3■□□□□ 0.68
HCN3-201ENST00000368358 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.28■□□□□ 0.68
HCN3-201ENST00000368358 NUP160Q12769 1436 aa19.27■□□□□ 0.67
HCN3-201ENST00000368358 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.26■□□□□ 0.67
HCN3-201ENST00000368358 SAMD9Q5K651 1589 aa19.26■□□□□ 0.67
HCN3-201ENST00000368358 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.26■□□□□ 0.67
HCN3-201ENST00000368358 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.25■□□□□ 0.67
HCN3-201ENST00000368358 KIAA0556O60303 1618 aa19.24■□□□□ 0.67
HCN3-201ENST00000368358 TSPY4P0CV99 314 aa19.24■□□□□ 0.67
HCN3-201ENST00000368358 TSPY10P0CW01 314 aa19.24■□□□□ 0.67
HCN3-201ENST00000368358 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
HCN3-201ENST00000368358 HECW1Q76N89 1606 aa19.24■□□□□ 0.67
HCN3-201ENST00000368358 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.24■□□□□ 0.67
HCN3-201ENST00000368358 FOXD1Q16676 465 aa19.22■□□□□ 0.67
HCN3-201ENST00000368358 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.21■□□□□ 0.672e-10■■■□□ 18.1
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HCN3-201ENST00000368358 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.2■□□□□ 0.66
HCN3-201ENST00000368358 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
HCN3-201ENST00000368358 MAP3K1Q13233 1512 aa19.18■□□□□ 0.66
HCN3-201ENST00000368358 MIER1Q8N108 512 aa19.18■□□□□ 0.66
HCN3-201ENST00000368358 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
HCN3-201ENST00000368358 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.16■□□□□ 0.66
HCN3-201ENST00000368358 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
HCN3-201ENST00000368358 CHD1O14646 1710 aa19.14■□□□□ 0.66
HCN3-201ENST00000368358 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
HCN3-201ENST00000368358 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.14■□□□□ 0.65
HCN3-201ENST00000368358 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
HCN3-201ENST00000368358 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa19.12■□□□□ 0.65
HCN3-201ENST00000368358 CFAP43Q8NDM7 1665 aa19.12■□□□□ 0.65
HCN3-201ENST00000368358 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
HCN3-201ENST00000368358 UACAQ9BZF9 1416 aa19.11■□□□□ 0.65
HCN3-201ENST00000368358 ATP10BO94823 1461 aa19.09■□□□□ 0.65
HCN3-201ENST00000368358 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.08■□□□□ 0.65
HCN3-201ENST00000368358 PTPRKQ15262 1439 aa19.08■□□□□ 0.64
HCN3-201ENST00000368358 TONSLQ96HA7 1378 aa19.07■□□□□ 0.64
HCN3-201ENST00000368358 ARHGEF11O15085 1522 aa19.07■□□□□ 0.64
HCN3-201ENST00000368358 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.04■□□□□ 0.64
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