RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.34■■■□□ 2.13
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HCN3-201ENST00000368358 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.48■■□□□ 1.51
HCN3-201ENST00000368358 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.11■■□□□ 1.45
HCN3-201ENST00000368358 ABCC9O60706 1549 aa23.87■■□□□ 1.41
HCN3-201ENST00000368358 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
HCN3-201ENST00000368358 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
HCN3-201ENST00000368358 SCRIBQ14160 1630 aa23.04■■□□□ 1.28
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HCN3-201ENST00000368358 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.91■■□□□ 1.26
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HCN3-201ENST00000368358 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.67■■□□□ 1.22
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HCN3-201ENST00000368358 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.35■■□□□ 1.17
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HCN3-201ENST00000368358 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.25■■□□□ 1.15
HCN3-201ENST00000368358 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.22■■□□□ 1.15
HCN3-201ENST00000368358 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HCN3-201ENST00000368358 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.08■■□□□ 1.13
HCN3-201ENST00000368358 TRIM41Q8WV44 630 aa22.04■■□□□ 1.12
HCN3-201ENST00000368358 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.88■■□□□ 1.09
HCN3-201ENST00000368358 WIZO95785 1651 aa21.88■■□□□ 1.09
HCN3-201ENST00000368358 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HCN3-201ENST00000368358 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.83■■□□□ 1.09
HCN3-201ENST00000368358 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.81■■□□□ 1.08
HCN3-201ENST00000368358 SMARCA4P51532 1647 aa21.69■■□□□ 1.06
HCN3-201ENST00000368358 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
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HCN3-201ENST00000368358 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.48■■□□□ 1.03
HCN3-201ENST00000368358 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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HCN3-201ENST00000368358 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HCN3-201ENST00000368358 SMARCA2P51531 1590 aa21.34■■□□□ 1.01
HCN3-201ENST00000368358 ABCC8Q09428 1581 aa21.3■■□□□ 1
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HCN3-201ENST00000368358 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
HCN3-201ENST00000368358 NCAPD3P42695 1498 aa21.11■□□□□ 0.97
HCN3-201ENST00000368358 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.09■□□□□ 0.97
HCN3-201ENST00000368358 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.04■□□□□ 0.96
HCN3-201ENST00000368358 SOGA1O94964 1423 aa21.03■□□□□ 0.96
HCN3-201ENST00000368358 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.01■□□□□ 0.95
HCN3-201ENST00000368358 HMGXB3Q12766 1538 aa20.9■□□□□ 0.94
HCN3-201ENST00000368358 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.9■□□□□ 0.94
HCN3-201ENST00000368358 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.89■□□□□ 0.94
HCN3-201ENST00000368358 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
HCN3-201ENST00000368358 NESP48681 1621 aa20.84■□□□□ 0.93
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HCN3-201ENST00000368358 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
HCN3-201ENST00000368358 SYNJ1O43426 1573 aa20.75■□□□□ 0.91
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HCN3-201ENST00000368358 CFTRP13569 1480 aa20.74■□□□□ 0.91
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HCN3-201ENST00000368358 CUX2O14529 1486 aa20.61■□□□□ 0.89
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HCN3-201ENST00000368358 GOLGA3Q08378 1498 aa20.55■□□□□ 0.88
HCN3-201ENST00000368358 FBLN2P98095 1184 aa20.54■□□□□ 0.88
HCN3-201ENST00000368358 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.53■□□□□ 0.88
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HCN3-201ENST00000368358 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.5■□□□□ 0.87
HCN3-201ENST00000368358 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.5■□□□□ 0.87
HCN3-201ENST00000368358 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.49■□□□□ 0.87
HCN3-201ENST00000368358 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.47■□□□□ 0.87
HCN3-201ENST00000368358 TOP2BQ02880 1626 aa20.46■□□□□ 0.87
HCN3-201ENST00000368358 CLIP1P30622 1438 aa20.45■□□□□ 0.86
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HCN3-201ENST00000368358 TOPBP1Q92547 1522 aa20.35■□□□□ 0.85
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HCN3-201ENST00000368358 ITGAEP38570 1179 aa20.32■□□□□ 0.84
HCN3-201ENST00000368358 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HCN3-201ENST00000368358 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.29■□□□□ 0.84
HCN3-201ENST00000368358 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HCN3-201ENST00000368358 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.25■□□□□ 0.83
HCN3-201ENST00000368358 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
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HCN3-201ENST00000368358 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
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HCN3-201ENST00000368358 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.14■□□□□ 0.81
HCN3-201ENST00000368358 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.13■□□□□ 0.81
HCN3-201ENST00000368358 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN3-201ENST00000368358 KIF21BO75037 1637 aa20.12■□□□□ 0.81
HCN3-201ENST00000368358 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.07■□□□□ 0.8
HCN3-201ENST00000368358 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HCN3-201ENST00000368358 PRDM2Q13029 1718 aa20.06■□□□□ 0.8
HCN3-201ENST00000368358 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HCN3-201ENST00000368358 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.05■□□□□ 0.8
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